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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 136 / 151 下载 TSV

上一页 136 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G001962 Chr04 NC_080390.1:31815393-31815405promoter 内 3561-3573 bp + 428 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 31810581-31814965(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAGGGTAGGTGTT
SmilChr04G001569 Chr04 NC_080390.1:26010001-26010013promoter 内 3521-3533 bp - 468 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 26007552-26009533(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAAACCTACCACT
SmilChr01G004371 Chr01 NC_080387.1:61923861-61923873promoter 内 3459-3471 bp + 530 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 61922627-61923331(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAGTGAGGTAAA
SmilChr01G004030 Chr01 NC_080387.1:58706845-58706857promoter 内 3437-3449 bp + 552 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 58706212-58706293(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGTGGTAGGTTTG
SmilChr03G004253 Chr03 NC_080389.1:61013828-61013840promoter 内 3390-3402 bp + 599 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 61010657-61013229(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGATAGGTAAA
SmilChr02G004054 Chr02 NC_080388.1:62861927-62861939promoter 内 3257-3269 bp - 732 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 62862671-62864748(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTTTG
SmilChr01G005875 Chr01 NC_080387.1:74700205-74700217promoter 内 3229-3241 bp + 760 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 74700977-74710158(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTCCTTCA
SmilChr03G003612 Chr03 NC_080389.1:54780107-54780119promoter 内 3225-3237 bp - 764 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 54777917-54779343(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAAACCTACCTCT
SmilChr03G003340 Chr03 NC_080389.1:51695597-51695609promoter 内 3211-3223 bp + 778 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 51690180-51694819(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAAGGAGGTAAA
SmilChr02G000471 Chr02 NC_080388.1:6382611-6382623promoter 内 3122-3134 bp - 867 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 6376046-6381744(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGTACCTACTTTG
SmilChr03G004184 Chr03 NC_080389.1:60547398-60547410promoter 内 3072-3084 bp + 917 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 60548327-60552511(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTCACGTC
SmilChr04G001799 Chr04 NC_080390.1:29459863-29459875promoter 内 2985-2997 bp - 1004 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 29460879-29462928(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGGGTAGGTATT
SmilChr01G005874 Chr01 NC_080387.1:74700205-74700217promoter 内 2911-2923 bp + 1078 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 74686291-74699127(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAAGGAGGTAAA
SmilChr02G002796 Chr02 NC_080388.1:48056741-48056753promoter 内 2849-2861 bp + 1140 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 48039990-48055601(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATTGTAGGTACC
SmilChr02G000719 Chr02 NC_080388.1:11555846-11555858promoter 内 2839-2851 bp + 1150 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 11542462-11554696(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATTGTAGGTACC
SmilChr03G003595 Chr03 NC_080389.1:54588821-54588833promoter 内 2834-2846 bp - 1155 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 54584497-54587666(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAAACCTACCTCT
SmilChr04G001424 Chr04 NC_080390.1:23188212-23188224promoter 内 2814-2826 bp - 1175 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 23185042-23187037(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTATTCTT
SmilChr01G004088 Chr01 NC_080387.1:59286483-59286495promoter 内 2769-2781 bp + 1220 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 59287715-59289915(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTGCCTACCTGC
SmilChr05G000345 Chr05 NC_080391.1:2579567-2579579promoter 内 2737-2749 bp - 1252 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 2558691-2578315(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTACCTACAGAG
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SmilChr01G002028 Chr01 NC_080387.1:35843992-35844004promoter 内 2554-2566 bp - 1435 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 35845439-35847576(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAGTGAGGTAAA
SmilChr01G004403 Chr01 NC_080387.1:62145136-62145148promoter 内 2514-2526 bp - 1475 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 62138438-62143661(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTCACATA
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SmilChr01G002036 Chr01 NC_080387.1:35996907-35996919promoter 内 2471-2483 bp + 1518 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 35998437-36001209(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTATTTCG
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SmilChr01G004372 Chr01 NC_080387.1:61923861-61923873promoter 内 2329-2341 bp + 1660 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 61925533-61927324(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTCACTCA
SmilChr04G001351 Chr04 NC_080390.1:21905601-21905613promoter 内 2275-2287 bp - 1714 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 21907327-21907914(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTTTG
SmilChr01G003831 Chr01 NC_080387.1:56642028-56642040promoter 内 2205-2217 bp + 1784 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 56637261-56640244(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTTTG
SmilChr01G004510 Chr01 NC_080387.1:63191212-63191224promoter 内 2189-2201 bp - 1800 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 63184665-63189412(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTATTCTT
SmilChr03G004341 Chr03 NC_080389.1:61716126-61716138promoter 内 2141-2153 bp + 1848 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 61717986-61721047(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTGCCTACCTGC
SmilChr02G001927 Chr02 NC_080388.1:34681238-34681250promoter 内 2072-2084 bp + 1917 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 34683167-34686374(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTATTTCG
SmilChr04G003645 Chr04 NC_080390.1:52967825-52967837promoter 内 2036-2048 bp + 1953 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 52969790-52972993(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTACCTACAATT
SmilChr05G001942 Chr05 NC_080391.1:19781895-19781907promoter 内 1989-2001 bp + 2000 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 19778249-19779895(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATTGTAGGTACC
SmilChr05G001205 Chr05 NC_080391.1:10141665-10141677promoter 内 1897-1909 bp + 2092 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 10143769-10147499(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTATTTTG
SmilChr03G002168 Chr03 NC_080389.1:33725524-33725536promoter 内 1877-1889 bp - 2112 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 33722564-33723412(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCAACTACCTTG
SmilChr04G000609 Chr04 NC_080390.1:6891477-6891489promoter 内 1713-1725 bp + 2276 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 6893765-6895023(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTATCCAA
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SmilChr02G003291 Chr02 NC_080388.1:54186444-54186456promoter 内 1692-1704 bp + 2297 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 54183608-54184147(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAGTGAGGTAAA
SmilChr02G002750 Chr02 NC_080388.1:47531669-47531681promoter 内 1660-1672 bp + 2329 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 47534010-47538392(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTATTTAT
SmilChr01G004599 Chr01 NC_080387.1:63979458-63979470promoter 内 1651-1663 bp + 2338 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 63981808-63989116(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTATTCTT
SmilChr01G005982 Chr01 NC_080387.1:75478283-75478295promoter 内 1626-1638 bp + 2363 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 75473032-75475920(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTTTG
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SmilChr01G004324 Chr01 NC_080387.1:61400147-61400159promoter 内 1563-1575 bp + 2426 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 61402585-61404376(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTATTCCT
SmilChr04G001328 Chr04 NC_080390.1:21434335-21434347promoter 内 1432-1444 bp + 2557 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 21422262-21431778(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCTGTAGGTAAC
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SmilChr03G000493 Chr03 NC_080389.1:5276484-5276496promoter 内 1133-1145 bp + 2856 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 5272609-5273628(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGTGAGGTAAA
SmilChr04G004184 Chr04 NC_080390.1:56404542-56404554promoter 内 1074-1086 bp + 2915 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 56399455-56401627(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTTTG