转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G002534; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003982-RA_Salv SmilChr02G002534 TCP XP_057797741.1 MP00169 GTTGGGACCACA

可能结合的靶基因

7295 个结合位点 6498 个候选靶基因 第 21 / 130 下载 TSV

上一页 21 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G004007 Chr08 NC_080394.1:48425666-48425677promoter 内 3328-3339 bp - 662 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 48426339-48429564(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 AGTGGTCCCCCA
SmilChr04G000885 Chr04 NC_080390.1:11287462-11287473promoter 内 3289-3300 bp + 701 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 11280501-11286761(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 AGTGGTCCCCCA
SmilChr06G002126 Chr06 NC_080392.1:28587681-28587692promoter 内 3195-3206 bp + 795 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 28574604-28586886(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCCAAT
SmilChr02G001414 Chr02 NC_080388.1:26764845-26764856promoter 内 2979-2990 bp + 1011 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 26763248-26763834(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCCAAT
SmilChr02G001978 Chr02 NC_080388.1:35737091-35737102promoter 内 2586-2597 bp + 1404 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 35732406-35735687(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCCAAA
SmilChr01G004290 Chr01 NC_080387.1:61097188-61097199promoter 内 2525-2536 bp + 1465 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 61098664-61100306(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGGGGGACCACT
SmilChr02G002400 Chr02 NC_080388.1:41883707-41883718promoter 内 2511-2522 bp + 1479 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 41885197-41886517(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATTGGGACCACA
SmilChr04G003471 Chr04 NC_080390.1:51172029-51172040promoter 内 2324-2335 bp + 1666 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 51173706-51178967(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TTTGGGACCACA
SmilChr04G000889 Chr04 NC_080390.1:11404579-11404590promoter 内 2167-2178 bp - 1823 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 11400353-11402756(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GATGGGACCACT
SmilChr03G004123 Chr03 NC_080389.1:60088037-60088048promoter 内 2153-2164 bp + 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 60084723-60086200(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 AGTGGTCCCCCA
SmilChr01G004183 Chr01 NC_080387.1:60276687-60276698promoter 内 2144-2155 bp - 1846 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 60274033-60274841(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATTGGGACCACA
SmilChr03G004301 Chr03 NC_080389.1:61394698-61394709promoter 内 2091-2102 bp + 1899 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 61396608-61399321(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATTGGGACCACA
SmilChr04G002359 Chr04 NC_080390.1:38083729-38083740promoter 内 2088-2099 bp - 1902 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 38085642-38088567(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 AGTGGTCCCATC
SmilChr01G005568 Chr01 NC_080387.1:72470377-72470388promoter 内 1877-1888 bp - 2113 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 72465758-72468264(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GATGGGACCACT
SmilChr07G003845 Chr07 NC_080393.1:47644459-47644470promoter 内 1866-1877 bp - 2124 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 47646594-47653604(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCCAAA
SmilChr01G005841 Chr01 NC_080387.1:74410145-74410156promoter 内 1841-1852 bp + 2149 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 74406422-74407996(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCCAAA
SmilChr08G002578 Chr08 NC_080394.1:25124264-25124275promoter 内 1590-1601 bp + 2400 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 25105044-25121864(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCCAAA
SmilChr02G004978 Chr02 NC_080388.1:71658772-71658783promoter 内 1157-1168 bp + 2833 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 71661616-71665960(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TTTGGGACCACA
SmilChr08G003237 Chr08 NC_080394.1:33281156-33281167promoter 内 1117-1128 bp - 2873 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 33284040-33285220(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCCAAA
SmilChr08G001327 Chr08 NC_080394.1:10607705-10607716promoter 内 1047-1058 bp + 2943 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 10610659-10612305(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATTGGGACCACA
SmilChr01G004591 Chr01 NC_080387.1:63921190-63921201promoter 内 908-919 bp - 3082 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 63914506-63918108(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATTGGGACCACA
SmilChr03G004668 Chr03 NC_080389.1:64144518-64144529promoter 内 772-783 bp + 3218 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 64147747-64151428(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TTTGGGACCACA
SmilChr03G004302 Chr03 NC_080389.1:61394698-61394709promoter 内 747-758 bp + 3243 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 61397952-61398257(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 ATTGGGACCACA
SmilChr08G000605 Chr08 NC_080394.1:4477229-4477240promoter 内 725-736 bp + 3265 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 4480505-4485556(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TTTGGGACCACA
SmilChr07G000658 Chr07 NC_080393.1:4435454-4435465promoter 内 353-364 bp - 3637 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 4439102-4444012(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCCAAT
SmilChr03G004087 Chr03 NC_080389.1:59779495-59779506promoter 内 279-290 bp - 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 59771863-59775784(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GATGGGACCACT
SmilChr08G003994 Chr08 NC_080394.1:48212441-48212452promoter 内 94-105 bp + 3896 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 48205975-48208545(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 AGTGGTCCCCCA
SmilChr04G002592 Chr04 NC_080390.1:41334377-41334388promoter 内 3686-3697 bp - 304 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 41334692-41339669(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCCTAC
SmilChr05G000065 Chr05 NC_080391.1:319828-319839promoter 内 2074-2085 bp + 1916 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 316771-317912(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCCTAC
SmilChr08G004076 Chr08 NC_080394.1:49389224-49389235promoter 内 1157-1168 bp + 2833 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 49392068-49395215(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GTAGGGACCACA
SmilChr03G004207 Chr03 NC_080389.1:60676890-60676901promoter 内 3905-3916 bp + 85 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 60676986-60679388(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GTAGGGACCACA
SmilChr05G002805 Chr05 NC_080391.1:32819140-32819151promoter 内 3881-3892 bp - 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 32819260-32823293(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCCTAC
SmilChr01G001418 Chr01 NC_080387.1:27767784-27767795promoter 内 3743-3754 bp - 247 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 27763875-27767537(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GTAGGGACCACA
SmilChr03G000941 Chr03 NC_080389.1:10695624-10695635promoter 内 3697-3708 bp + 293 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 10695928-10697625(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 GTAGGGACCACA
SmilChr01G002548 Chr01 NC_080387.1:43577423-43577434promoter 内 3554-3565 bp + 436 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 43568349-43576987(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCCTAC
SmilChr07G001465 Chr07 NC_080393.1:11489492-11489503promoter 内 3446-3457 bp - 544 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 11490047-11497428(+) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCCTAC
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SmilChr01G005636 Chr01 NC_080387.1:72800651-72800662promoter 内 2008-2019 bp + 1982 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 72796920-72798669(-) SMil_00003982-RA_Salv MP00169 TGTGGTCCCTAC