转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 3 / 151 下载 TSV

上一页 3 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G001966 Chr04 NC_080390.1:31886562-31886574promoter 内 2373-2385 bp - 1616 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 31888190-31890819(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGTGGTAGGTGAA
SmilChr01G003733 Chr01 NC_080387.1:55627682-55627694promoter 内 2181-2193 bp - 1808 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 55618087-55625874(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCACT
SmilChr05G001897 Chr05 NC_080391.1:19267095-19267107promoter 内 1298-1310 bp - 2691 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 19269798-19271538(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTGAA
SmilChr02G000257 Chr02 NC_080388.1:3292455-3292467promoter 内 582-594 bp + 3407 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 3295874-3297706(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCACT
SmilChr03G001928 Chr03 NC_080389.1:27064340-27064352promoter 内 3874-3886 bp - 115 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 27064467-27066676(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTGGTAGGTGGG
SmilChr02G002571 Chr02 NC_080388.1:44725854-44725866promoter 内 3845-3857 bp + 144 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 44725036-44725710(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTGGA
SmilChr03G003625 Chr03 NC_080389.1:54921570-54921582promoter 内 3135-3147 bp - 854 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 54922436-54923545(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTGGA
SmilChr02G001704 Chr02 NC_080388.1:31341995-31342007promoter 内 3037-3049 bp + 952 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 31342959-31346201(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACCCCC
SmilChr04G003493 Chr04 NC_080390.1:51361422-51361434promoter 内 3034-3046 bp + 955 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 51362389-51364878(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTCT
SmilChr04G002459 Chr04 NC_080390.1:39414575-39414587promoter 内 2381-2393 bp - 1608 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 39412281-39412967(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTCT
SmilChr05G002080 Chr05 NC_080391.1:21739174-21739186promoter 内 2207-2219 bp + 1782 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 21740968-21743967(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCACT
SmilChr01G003614 Chr01 NC_080387.1:54679621-54679633promoter 内 1842-1854 bp - 2147 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 54681780-54685540(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTAAG
SmilChr02G003261 Chr02 NC_080388.1:53898531-53898543promoter 内 1798-1810 bp + 2191 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 53900734-53908580(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCACT
SmilChr03G003989 Chr03 NC_080389.1:58919343-58919355promoter 内 1788-1800 bp - 2201 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 58911799-58917142(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTCT
SmilChr02G002991 Chr02 NC_080388.1:50579933-50579945promoter 内 1610-1622 bp + 2379 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 50574042-50577554(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTAAG
SmilChr02G001778 Chr02 NC_080388.1:32557778-32557790promoter 内 769-781 bp - 3220 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 32561010-32566063(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTGGTAGGTGGG
SmilChr05G000066 Chr05 NC_080391.1:327856-327868promoter 内 762-774 bp - 3227 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 323560-324629(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCACT
SmilChr02G002572 Chr02 NC_080388.1:44725854-44725866promoter 内 720-732 bp + 3269 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 44729135-44729890(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTCT
SmilChr02G000255 Chr02 NC_080388.1:3292455-3292467promoter 内 362-374 bp + 3627 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 3285444-3288828(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGTGGTAGGTGGA
SmilChr01G003941 Chr01 NC_080387.1:57744594-57744606promoter 内 1667-1679 bp - 2322 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 6 57746928-57753052(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTAGG
SmilChr01G003940 Chr01 NC_080387.1:57744594-57744606promoter 内 1800-1812 bp - 2189 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 5 57740197-57742405(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACCTTT
SmilChr01G000639 Chr01 NC_080387.1:14366640-14366652promoter 内 2061-2073 bp - 1928 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 3 14368580-14375203(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGCGGTAGGTGGG
SmilChr01G000494 Chr01 NC_080387.1:10070694-10070706promoter 内 1182-1194 bp + 2807 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 3 10073513-10076671(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCGCC
SmilChr01G003162 Chr01 NC_080387.1:50427779-50427791promoter 内 3582-3594 bp - 407 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 50428198-50431024(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTGAG
SmilChr03G001761 Chr03 NC_080389.1:24028136-24028148promoter 内 2960-2972 bp + 1029 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 24029177-24030433(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCGCC
SmilChr01G001301 Chr01 NC_080387.1:25923450-25923462promoter 内 2731-2743 bp - 1258 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 25924720-25928691(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTAGG
SmilChr05G001945 Chr05 NC_080391.1:19829872-19829884promoter 内 2612-2624 bp - 1377 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 19822857-19828495(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACCTCT
SmilChr04G000761 Chr04 NC_080390.1:9285628-9285640promoter 内 2240-2252 bp - 1749 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 9279966-9283879(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCGCC
SmilChr03G001762 Chr03 NC_080389.1:24028136-24028148promoter 内 1697-1709 bp + 2292 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 24030440-24032840(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCGCC
SmilChr04G001212 Chr04 NC_080390.1:18843501-18843513promoter 内 1537-1549 bp + 2452 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 18845965-18849480(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCGCC
SmilChr02G003718 Chr02 NC_080388.1:58800748-58800760promoter 内 1298-1310 bp + 2691 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 58803451-58803524(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACCATT
SmilChr02G000344 Chr02 NC_080388.1:4498188-4498200promoter 内 750-762 bp + 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 4492434-4494949(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGCGGTAGGTGGG
SmilChr04G003339 Chr04 NC_080390.1:50063745-50063757promoter 内 3952-3964 bp + 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 50063794-50066373(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCTTA
SmilChr01G004806 Chr01 NC_080387.1:66261794-66261806promoter 内 3891-3903 bp + 98 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 66261904-66264810(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCGCC
SmilChr01G003161 Chr01 NC_080387.1:50427779-50427791promoter 内 3428-3440 bp - 561 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 50424449-50427218(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCACA
SmilChr05G001534 Chr05 NC_080391.1:14032506-14032518promoter 内 2924-2936 bp - 1065 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 14033583-14035647(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTAGG
SmilChr01G000657 Chr01 NC_080387.1:14637617-14637629promoter 内 2342-2354 bp + 1647 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 14639276-14640727(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCGTC
SmilChr05G000325 Chr05 NC_080391.1:2437619-2437631promoter 内 1648-1660 bp + 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 2432308-2435278(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAGGTAGGTGAG
SmilChr03G003894 Chr03 NC_080389.1:58044472-58044484promoter 内 1586-1598 bp + 2403 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 58046887-58050554(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCTTA
SmilChr02G001391 Chr02 NC_080388.1:26408240-26408252promoter 内 1369-1381 bp + 2620 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 26402064-26405620(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAGGTAGGTGAG
SmilChr02G000884 Chr02 NC_080388.1:15248256-15248268promoter 内 597-609 bp + 3392 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 15240996-15244864(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTAAG
SmilChr01G001120 Chr01 NC_080387.1:22822118-22822130promoter 内 219-231 bp + 3770 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 22825900-22826668(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCGCC
SmilChr05G000327 Chr05 NC_080391.1:2437619-2437631promoter 内 139-151 bp + 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 2441481-2464606(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCTTA
SmilChr01G000881 Chr01 NC_080387.1:18750343-18750355promoter 内 34-46 bp + 3955 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 18743230-18746388(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACGGTAGGTGAG
SmilChr01G003567 Chr01 NC_080387.1:54254230-54254242promoter 内 30-42 bp - 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 54249052-54250271(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCTCA
SmilChr02G001494 Chr02 NC_080388.1:27887661-27887673promoter 内 3624-3636 bp - 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 27886473-27887296(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCACA
SmilChr03G002079 Chr03 NC_080389.1:31910574-31910586promoter 内 2642-2654 bp + 1347 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 31911933-31916492(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCACA
SmilChr01G004955 Chr01 NC_080387.1:67641829-67641841promoter 内 2856-2868 bp - 1133 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 1 67638247-67640696(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCCAC
SmilChr01G004956 Chr01 NC_080387.1:67641829-67641841promoter 内 2461-2473 bp - 1528 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 1 67643369-67647185(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGGTAGGTGAG
SmilChr01G004732 Chr01 NC_080387.1:65513298-65513310promoter 内 730-742 bp + 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 1 65506016-65510039(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGGTAGGTAAA