转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 32 / 134 下载 TSV

上一页 32 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005498 Chr02 NC_080388.1:75132575-75132589promoter 内 3583-3597 bp - 404 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 75132993-75137687(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTACACAA
SmilChr03G002660 Chr03 NC_080389.1:42264033-42264047promoter 内 3516-3530 bp - 471 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 42264518-42265742(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATCTGC
SmilChr01G001391 Chr01 NC_080387.1:27359634-27359648promoter 内 2459-2473 bp + 1528 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 27347996-27358106(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTGTCTTG
SmilChr02G003595 Chr02 NC_080388.1:57155469-57155483promoter 内 2088-2102 bp + 1899 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 57149153-57153570(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTAGTTAG
SmilChr01G002577 Chr01 NC_080387.1:43917658-43917672promoter 内 1502-1516 bp - 2485 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 43920157-43922480(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTACTAAT
SmilChr02G000930 Chr02 NC_080388.1:16202099-16202113promoter 内 1053-1067 bp - 2934 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 16205047-16214520(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTATTATT
SmilChr02G003596 Chr02 NC_080388.1:57155469-57155483promoter 内 899-913 bp + 3088 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 57151576-57152381(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTAGTTAG
SmilChr02G001060 Chr02 NC_080388.1:18838415-18838429promoter 内 803-817 bp - 3184 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 18841613-18842665(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATTTAT
SmilChr03G002088 Chr03 NC_080389.1:32179423-32179437promoter 内 581-595 bp - 3406 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 32172941-32176017(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATTGTGATGATTAA
SmilChr01G003633 Chr01 NC_080387.1:54851368-54851382promoter 内 306-320 bp - 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 54855063-54856789(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTATGATA
SmilChr02G003805 Chr02 NC_080388.1:59673556-59673570promoter 内 275-289 bp + 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 59667575-59669844(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTACTAAT
SmilChr02G005581 Chr02 NC_080388.1:75646598-75646612promoter 内 263-277 bp - 3724 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 75637200-75642874(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATAACAATGATTAT
SmilChr03G001106 Chr03 NC_080389.1:12748438-12748452promoter 内 3979-3993 bp - 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 12748460-12752581(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAATCATTAGTTTT
SmilChr02G005551 Chr02 NC_080388.1:75489801-75489815promoter 内 3850-3864 bp - 137 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 75489952-75493024(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACCATCATTATTTAC
SmilChr03G001077 Chr03 NC_080389.1:12468974-12468988promoter 内 3727-3741 bp - 260 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 12469248-12470919(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCCATCATTACTTCA
SmilChr02G003018 Chr02 NC_080388.1:50884287-50884301promoter 内 3410-3424 bp - 577 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 50876103-50883710(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CAAGACAATGATTAT
SmilChr02G003019 Chr02 NC_080388.1:50884287-50884301promoter 内 3300-3314 bp - 687 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 50884988-50891414(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTGTCTTG
SmilChr01G006158 Chr01 NC_080387.1:76994388-76994402promoter 内 3207-3221 bp + 780 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 76991344-76993608(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATGATTACTTTG
SmilChr01G001992 Chr01 NC_080387.1:35324206-35324220promoter 内 3126-3140 bp - 861 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 35321960-35323345(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATTCTAATGATTAT
SmilChr03G002373 Chr03 NC_080389.1:37358038-37358052promoter 内 1973-1987 bp - 2014 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 37360066-37361268(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTACTAAT
SmilChr01G005848 Chr01 NC_080387.1:74434088-74434102promoter 内 1742-1756 bp + 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 74436347-74437790(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGATGCAATGATTGG
SmilChr01G001990 Chr01 NC_080387.1:35324206-35324220promoter 内 1472-1486 bp - 2515 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 35318182-35321691(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATTCTAATGATTAT
SmilChr02G002695 Chr02 NC_080388.1:46686448-46686462promoter 内 1433-1447 bp + 2554 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 46682644-46683894(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACCATCATTATTTAC
SmilChr01G004609 Chr01 NC_080387.1:64067323-64067337promoter 内 1308-1322 bp - 2679 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 64061550-64064644(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGAGATAATGATGGA
SmilChr03G001252 Chr03 NC_080389.1:14441739-14441753promoter 内 1150-1164 bp + 2837 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 14444590-14449243(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTATATAATGATTAA
SmilChr02G002237 Chr02 NC_080388.1:39723692-39723706promoter 内 998-1012 bp + 2989 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 39715606-39720703(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTAGAATA
SmilChr01G005345 Chr01 NC_080387.1:70679986-70680000promoter 内 968-982 bp + 3019 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 70672390-70676967(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAATCATTACTTAA
SmilChr03G001909 Chr03 NC_080389.1:26723144-26723158promoter 内 831-845 bp + 3156 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 26719882-26719988(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCACAATA
SmilChr01G003075 Chr01 NC_080387.1:49588999-49589013promoter 内 741-755 bp + 3246 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 49592259-49597744(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAAATAATGATTGT
SmilChr02G001804 Chr02 NC_080388.1:32896172-32896186promoter 内 23-37 bp + 3964 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 32888362-32892208(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTGTCTTG
SmilChr02G001634 Chr02 NC_080388.1:30293467-30293481promoter 内 3979-3993 bp - 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 30293489-30297610(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAATCATTAGTTTT
SmilChr02G004695 Chr02 NC_080388.1:69291182-69291196promoter 内 3897-3911 bp + 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 69290475-69291092(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAATCATTGCTTCT
SmilChr02G001059 Chr02 NC_080388.1:18835819-18835833promoter 内 3785-3799 bp - 202 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 18836035-18840237(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATTTAT
SmilChr01G002070 Chr01 NC_080387.1:36571640-36571654promoter 内 3689-3703 bp + 298 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 36565220-36571342(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTAGAAAA
SmilChr03G000334 Chr03 NC_080389.1:3786843-3786857promoter 内 3682-3696 bp - 305 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 3787162-3788672(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATAACA
SmilChr01G000073 Chr01 NC_080387.1:1268855-1268869promoter 内 3469-3483 bp + 518 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 1269387-1271849(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAACATGATGATTAT
SmilChr02G005367 Chr02 NC_080388.1:74366175-74366189promoter 内 3427-3441 bp + 560 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 74359181-74365615(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATTAAC
SmilChr02G000460 Chr02 NC_080388.1:6192147-6192161promoter 内 3384-3398 bp - 603 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 6192764-6193343(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTATTATT
SmilChr01G001854 Chr01 NC_080387.1:33475112-33475126promoter 内 3355-3369 bp - 632 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 33471818-33474480(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAAATAATGATTAA
SmilChr02G005097 Chr02 NC_080388.1:72540393-72540407promoter 内 3300-3314 bp + 687 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 72534141-72539706(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATTAAC
SmilChr01G005738 Chr01 NC_080387.1:73506448-73506462promoter 内 3222-3236 bp - 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 73507227-73507982(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATGATTACTTTG
SmilChr01G000497 Chr01 NC_080387.1:10135532-10135546promoter 内 3091-3105 bp - 896 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 10131296-10134636(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATTGTGATGATTAA
SmilChr03G000902 Chr03 NC_080389.1:10326176-10326190promoter 内 2969-2983 bp - 1018 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 10327208-10331622(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATCCCC
SmilChr01G000846 Chr01 NC_080387.1:18314934-18314948promoter 内 2871-2885 bp + 1116 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 18312378-18313818(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATTAAT
SmilChr02G003679 Chr02 NC_080388.1:58162468-58162482promoter 内 2811-2825 bp + 1176 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 58159880-58161292(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTAGCAAG
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SmilChr03G001629 Chr03 NC_080389.1:20991007-20991021promoter 内 2746-2760 bp - 1241 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 20992262-20994544(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTATTATT
SmilChr01G002583 Chr01 NC_080387.1:43963921-43963935promoter 内 2665-2679 bp - 1322 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 43965257-43966611(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTATTATT
SmilChr01G006098 Chr01 NC_080387.1:76456703-76456717promoter 内 2324-2338 bp - 1663 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 76458380-76459888(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATGATTACTTTG