转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 32 / 149 下载 TSV

上一页 32 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001999 Chr06 NC_080392.1:25524037-25524047promoter 内 1445-1455 bp - 2546 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 25526593-25529411(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr01G003463 Chr01 NC_080387.1:53206864-53206874promoter 内 1438-1448 bp - 2553 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 53209427-53212949(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGC
SmilChr05G002121 Chr05 NC_080391.1:22287852-22287862promoter 内 1343-1353 bp + 2648 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 22284437-22285204(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr02G000811 Chr02 NC_080388.1:13601702-13601712promoter 内 1305-1315 bp - 2686 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 13604398-13606703(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr01G002676 Chr01 NC_080387.1:44972081-44972091promoter 内 1300-1310 bp + 2691 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 44962530-44969390(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr04G001310 Chr04 NC_080390.1:20962872-20962882promoter 内 1086-1096 bp - 2905 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 20958065-20959967(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCG
SmilChr01G005759 Chr01 NC_080387.1:73700909-73700919promoter 内 1073-1083 bp - 2918 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 73682109-73697991(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCG
SmilChr01G002987 Chr01 NC_080387.1:48792068-48792078promoter 内 1046-1056 bp - 2945 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 48795023-48814661(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr04G001945 Chr04 NC_080390.1:31571555-31571565promoter 内 1023-1033 bp + 2968 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 31574533-31576376(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr07G001026 Chr07 NC_080393.1:7459391-7459401promoter 内 992-1002 bp + 2999 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 7453451-7456392(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr07G001368 Chr07 NC_080393.1:10606772-10606782promoter 内 934-944 bp + 3057 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 10609839-10612787(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr06G001387 Chr06 NC_080392.1:14514601-14514611promoter 内 904-914 bp - 3087 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 14517698-14520503(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr01G000509 Chr01 NC_080387.1:10349421-10349431promoter 内 887-897 bp + 3104 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 10339985-10346317(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr07G003234 Chr07 NC_080393.1:34312089-34312099promoter 内 862-872 bp + 3129 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 34304733-34308960(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr01G005861 Chr01 NC_080387.1:74549451-74549461promoter 内 842-852 bp - 3149 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 74534652-74546302(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr02G002005 Chr02 NC_080388.1:36195014-36195024promoter 内 814-824 bp + 3177 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 36188049-36191837(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr06G002912 Chr06 NC_080392.1:41959620-41959630promoter 内 800-810 bp - 3191 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 41962821-41965249(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTT
SmilChr05G002898 Chr05 NC_080391.1:34793963-34793973promoter 内 797-807 bp + 3194 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 34797167-34797272(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr05G002864 Chr05 NC_080391.1:34219210-34219220promoter 内 789-799 bp + 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 34212102-34216008(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr01G000460 Chr01 NC_080387.1:9428880-9428890promoter 内 759-769 bp + 3232 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 9423489-9425648(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr02G001545 Chr02 NC_080388.1:28704111-28704121promoter 内 745-755 bp - 3246 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 28699559-28700865(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr01G002196 Chr01 NC_080387.1:38115449-38115459promoter 内 684-694 bp - 3307 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 38110169-38112142(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCGGCTGTCA
SmilChr01G004716 Chr01 NC_080387.1:65378485-65378495promoter 内 658-668 bp - 3333 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 65374814-65375152(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCG
SmilChr01G004855 Chr01 NC_080387.1:66727960-66727970promoter 内 611-621 bp - 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 66731350-66734673(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTT
SmilChr05G003082 Chr05 NC_080391.1:38953541-38953551promoter 内 537-547 bp - 3454 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 38957005-38979398(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr05G001770 Chr05 NC_080391.1:17409931-17409941promoter 内 456-466 bp + 3535 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 17404387-17406396(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTT
SmilChr01G000604 Chr01 NC_080387.1:13155248-13155258promoter 内 442-452 bp + 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 13148705-13151699(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr03G003230 Chr03 NC_080389.1:50019277-50019287promoter 内 438-448 bp - 3553 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 50022840-50025478(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr01G006061 Chr01 NC_080387.1:76056298-76056308promoter 内 426-436 bp + 3565 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 76048442-76052733(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGC
SmilChr06G001348 Chr06 NC_080392.1:14038718-14038728promoter 内 387-397 bp - 3604 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 14042332-14044888(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr06G001388 Chr06 NC_080392.1:14514601-14514611promoter 内 381-391 bp - 3610 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 14518221-14518344(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr01G001117 Chr01 NC_080387.1:22810418-22810428promoter 内 233-243 bp + 3758 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 22804136-22806660(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr05G003316 Chr05 NC_080391.1:43427859-43427869promoter 内 227-237 bp - 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 43431633-43434853(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr03G002156 Chr03 NC_080389.1:33545382-33545392promoter 内 222-232 bp - 3769 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 33549161-33552044(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr01G004222 Chr01 NC_080387.1:60587341-60587351promoter 内 203-213 bp + 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 60582237-60583553(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr05G003647 Chr05 NC_080391.1:48903821-48903831promoter 内 193-203 bp + 3798 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 48907629-48912151(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr02G002008 Chr02 NC_080388.1:36226243-36226253promoter 内 174-184 bp - 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 36216486-36222426(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCG
SmilChr04G000675 Chr04 NC_080390.1:7703772-7703782promoter 内 101-111 bp + 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 7707672-7708575(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCGGCTGTCA
SmilChr05G003549 Chr05 NC_080391.1:47405344-47405354promoter 内 86-96 bp - 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 47409259-47409825(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTT
SmilChr01G006138 Chr01 NC_080387.1:76886873-76886883promoter 内 75-85 bp + 3916 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 76890799-76892272(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr01G005719 Chr01 NC_080387.1:73373690-73373700promoter 内 55-65 bp - 3936 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 73377636-73381453(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGAT
SmilChr07G002844 Chr07 NC_080393.1:28545576-28545586promoter 内 2041-2051 bp + 1950 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 28542002-28543626(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGGA
SmilChr03G003428 Chr03 NC_080389.1:52630494-52630504promoter 内 2443-2453 bp + 1548 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 52626154-52628946(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGG
SmilChr04G000684 Chr04 NC_080390.1:7982295-7982305promoter 内 2245-2255 bp - 1746 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 7979145-7980549(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACAGCTGTCC
SmilChr01G003585 Chr01 NC_080387.1:54420681-54420691promoter 内 1631-1641 bp - 2360 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 54423051-54425934(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGG
SmilChr04G003794 Chr04 NC_080390.1:54129832-54129842promoter 内 1495-1505 bp + 2496 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 54125337-54127336(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGTC
SmilChr05G003922 Chr05 NC_080391.1:52978900-52978910promoter 内 3959-3969 bp + 32 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 52978942-52981641(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAGGCTGTCA
SmilChr04G004092 Chr04 NC_080390.1:55921240-55921250promoter 内 3710-3720 bp + 281 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 55917490-55920959(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCGC
SmilChr02G002955 Chr02 NC_080388.1:50088263-50088273promoter 内 3617-3627 bp + 374 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 50088647-50091298(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAA
SmilChr06G000769 Chr06 NC_080392.1:7186688-7186698promoter 内 3414-3424 bp - 577 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 7185653-7186111(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAA