转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G005217; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00006334-RA_Salv SmilChr02G005217 G2-like XP_057792502.1 MP00022 GAGAATCTGT

可能结合的靶基因

9720 个结合位点 6959 个候选靶基因 第 35 / 140 下载 TSV

上一页 35 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005514 Chr01 NC_080387.1:71975411-71975420promoter 内 1853-1862 bp + 2139 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 71970230-71973272(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr01G005736 Chr01 NC_080387.1:73487072-73487081promoter 内 1848-1857 bp + 2144 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 73489225-73490124(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr03G004733 Chr03 NC_080389.1:64480975-64480984promoter 内 1815-1824 bp - 2177 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 64483161-64485049(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr01G001407 Chr01 NC_080387.1:27664342-27664351promoter 内 1648-1657 bp + 2344 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 27666695-27667429(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr03G003426 Chr03 NC_080389.1:52599065-52599074promoter 内 1550-1559 bp - 2442 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 52601516-52601980(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr03G004181 Chr03 NC_080389.1:60531958-60531967promoter 内 1499-1508 bp + 2493 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 60534460-60538815(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr02G002255 Chr02 NC_080388.1:39979436-39979445promoter 内 1495-1504 bp - 2497 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 39981942-39983388(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr01G001127 Chr01 NC_080387.1:22868634-22868643promoter 内 1485-1494 bp + 2507 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 22871150-22872813(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr02G005585 Chr02 NC_080388.1:75666247-75666256promoter 内 1459-1468 bp + 2533 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 75660752-75663714(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr01G004612 Chr01 NC_080387.1:64083583-64083592promoter 内 1418-1427 bp - 2574 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 64076344-64081009(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr03G000763 Chr03 NC_080389.1:8726225-8726234promoter 内 1382-1391 bp + 2610 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 8722362-8723615(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr02G004821 Chr02 NC_080388.1:70321035-70321044promoter 内 1378-1387 bp + 2614 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 70323658-70328578(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr03G000785 Chr03 NC_080389.1:8947572-8947581promoter 内 1350-1359 bp + 2642 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 8941038-8944930(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr02G000999 Chr02 NC_080388.1:17622615-17622624promoter 内 1328-1337 bp - 2664 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 17625288-17627802(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr03G004734 Chr03 NC_080389.1:64490197-64490206promoter 内 1263-1272 bp - 2729 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 64485194-64487468(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr01G003976 Chr01 NC_080387.1:58202627-58202636promoter 内 1255-1264 bp + 2737 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 58197199-58199890(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr02G003740 Chr02 NC_080388.1:59065951-59065960promoter 内 1251-1260 bp - 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 59059038-59063210(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr04G000309 Chr04 NC_080390.1:2851336-2851345promoter 内 1251-1260 bp + 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 2854086-2855614(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr02G003799 Chr02 NC_080388.1:59623530-59623539promoter 内 1213-1222 bp + 2779 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 59619165-59620751(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr03G000933 Chr03 NC_080389.1:10637816-10637825promoter 内 1209-1218 bp + 2783 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 10631938-10635033(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr03G000228 Chr03 NC_080389.1:2724057-2724066promoter 内 1163-1172 bp - 2829 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 2719788-2721228(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr03G001687 Chr03 NC_080389.1:22285815-22285824promoter 内 1148-1157 bp + 2844 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 22282306-22282971(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr03G000346 Chr03 NC_080389.1:3898738-3898747promoter 内 1143-1152 bp + 2849 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 3901596-3902226(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr02G001554 Chr02 NC_080388.1:28833233-28833242promoter 内 996-1005 bp - 2996 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 28829675-28830237(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr01G000590 Chr01 NC_080387.1:12826528-12826537promoter 内 955-964 bp - 3037 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 12820889-12823491(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr02G003699 Chr02 NC_080388.1:58451795-58451804promoter 内 878-887 bp + 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 58454918-58457152(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr03G002395 Chr03 NC_080389.1:37910570-37910579promoter 内 842-851 bp - 3150 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 37913729-37916535(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr02G000757 Chr02 NC_080388.1:12346179-12346188promoter 内 822-831 bp - 3170 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 12340144-12343009(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr01G001300 Chr01 NC_080387.1:25901432-25901441promoter 内 818-827 bp + 3174 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 25904615-25910368(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr03G001730 Chr03 NC_080389.1:23251289-23251298promoter 内 790-799 bp + 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 23247285-23248087(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr01G001032 Chr01 NC_080387.1:21480487-21480496promoter 内 713-722 bp - 3279 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 21476350-21477208(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr02G004733 Chr02 NC_080388.1:69568564-69568573promoter 内 640-649 bp + 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 69561938-69565212(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr02G000864 Chr02 NC_080388.1:14888009-14888018promoter 内 610-619 bp + 3382 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 14891400-14894409(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr01G001060 Chr01 NC_080387.1:21913947-21913956promoter 内 565-574 bp + 3427 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 21917383-21919024(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr03G002200 Chr03 NC_080389.1:34597313-34597322promoter 内 539-548 bp + 3453 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 34600775-34607949(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr02G000962 Chr02 NC_080388.1:16785833-16785842promoter 内 528-537 bp + 3464 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 16776812-16782369(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr04G000016 Chr04 NC_080390.1:224299-224308promoter 内 522-531 bp + 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 220086-220829(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr03G000230 Chr03 NC_080389.1:2724057-2724066promoter 内 462-471 bp - 3530 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 2727596-2728591(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr03G001662 Chr03 NC_080389.1:21555923-21555932promoter 内 312-321 bp + 3680 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 21549798-21552243(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr02G000158 Chr02 NC_080388.1:2037227-2037236promoter 内 286-295 bp - 3706 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 2040942-2043017(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr03G001674 Chr03 NC_080389.1:21890992-21891001promoter 内 261-270 bp - 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 21884760-21887261(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr02G002861 Chr02 NC_080388.1:48782962-48782971promoter 内 260-269 bp + 3732 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 48786703-48790314(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr01G004636 Chr01 NC_080387.1:64375475-64375484promoter 内 229-238 bp + 3763 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 64379247-64380035(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr03G004007 Chr03 NC_080389.1:59080651-59080660promoter 内 120-129 bp - 3872 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 59084532-59085631(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr02G000561 Chr02 NC_080388.1:7900378-7900387promoter 内 110-119 bp - 3882 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 7893948-7896496(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGA
SmilChr03G003427 Chr03 NC_080389.1:52599065-52599074promoter 内 83-92 bp - 3909 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 52602983-52606903(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr01G002794 Chr01 NC_080387.1:46450273-46450282promoter 内 14-23 bp + 3978 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 46443274-46446295(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TCAGATTCTG
SmilChr01G003560 Chr01 NC_080387.1:54210725-54210734promoter 内 154-163 bp - 3838 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 7 54203024-54206887(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTAT
SmilChr03G003944 Chr03 NC_080389.1:58517135-58517144promoter 内 3534-3543 bp - 458 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 5 58507257-58516677(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTAT
SmilChr02G003833 Chr02 NC_080388.1:59976451-59976460promoter 内 3369-3378 bp - 623 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 4 59974151-59975828(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTAT