转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 40 / 143 下载 TSV

上一页 40 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001052 Chr02 NC_080388.1:18777857-18777868promoter 内 794-805 bp - 3196 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 18772030-18774661(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGTA
SmilChr01G001102 Chr01 NC_080387.1:22546231-22546242promoter 内 775-786 bp - 3215 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 22549457-22555678(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr01G002345 Chr01 NC_080387.1:40595959-40595970promoter 内 719-730 bp - 3271 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 40590469-40592688(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGTT
SmilChr01G000224 Chr01 NC_080387.1:3977549-3977560promoter 内 657-668 bp - 3333 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 3980893-3981438(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr01G000187 Chr01 NC_080387.1:3188702-3188713promoter 内 610-621 bp - 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 3183053-3185322(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGTA
SmilChr01G001353 Chr01 NC_080387.1:26800351-26800362promoter 内 303-314 bp + 3687 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 26804049-26809727(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGTT
SmilChr07G002885 Chr07 NC_080393.1:29098498-29098509promoter 内 215-226 bp - 3775 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 29102284-29102733(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr08G001038 Chr08 NC_080394.1:7906376-7906387promoter 内 173-184 bp - 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 7910204-7917084(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGAGT
SmilChr07G003699 Chr07 NC_080393.1:44616528-44616539promoter 内 97-108 bp - 3893 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 44611547-44612635(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGTA
SmilChr07G002832 Chr07 NC_080393.1:28373063-28373074promoter 内 95-106 bp - 3895 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 28376969-28379671(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAC
SmilChr06G003116 Chr06 NC_080392.1:44007818-44007829promoter 内 3987-3998 bp - 3 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 44007832-44009843(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAAA
SmilChr08G001574 Chr08 NC_080394.1:12949714-12949725promoter 内 3301-3312 bp + 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 12945969-12949025(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCAA
SmilChr04G000656 Chr04 NC_080390.1:7427969-7427980promoter 内 3226-3237 bp + 764 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 7428744-7431916(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAGG
SmilChr02G004467 Chr02 NC_080388.1:67072830-67072841promoter 内 3171-3182 bp - 819 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 67073660-67076530(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCAA
SmilChr03G000829 Chr03 NC_080389.1:9515259-9515270promoter 内 3161-3172 bp + 829 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 9509952-9514430(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAAA
SmilChr01G000028 Chr01 NC_080387.1:543279-543290promoter 内 3075-3086 bp - 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 541403-542364(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTATT
SmilChr06G002842 Chr06 NC_080392.1:41187327-41187338promoter 内 2989-3000 bp + 1001 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 41184596-41186326(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCAA
SmilChr08G001379 Chr08 NC_080394.1:10991062-10991073promoter 内 2912-2923 bp + 1078 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 10987823-10989984(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCAA
SmilChr02G004821 Chr02 NC_080388.1:70322379-70322390promoter 内 2722-2733 bp - 1268 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 70323658-70328578(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCAA
SmilChr04G000516 Chr04 NC_080390.1:5674817-5674828promoter 内 2506-2517 bp + 1484 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 5670757-5673333(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCGC
SmilChr08G000516 Chr08 NC_080394.1:3754959-3754970promoter 内 2226-2237 bp - 1764 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 3756734-3757497(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCAA
SmilChr03G004185 Chr03 NC_080389.1:60551776-60551787promoter 内 2212-2223 bp - 1778 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 60553565-60555593(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAAA
SmilChr06G001295 Chr06 NC_080392.1:13495066-13495077promoter 内 2211-2222 bp - 1779 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 13496856-13500011(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCAA
SmilChr07G003322 Chr07 NC_080393.1:35471754-35471765promoter 内 2141-2152 bp + 1849 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 35473614-35476158(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAGG
SmilChr05G004335 Chr05 NC_080391.1:57032573-57032584promoter 内 1966-1977 bp - 2024 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 57028778-57030549(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTATT
SmilChr04G001371 Chr04 NC_080390.1:22271972-22271983promoter 内 1936-1947 bp + 2054 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 22251609-22269918(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCGC
SmilChr01G004377 Chr01 NC_080387.1:61968779-61968790promoter 内 1623-1634 bp - 2367 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 61971157-61977289(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAAA
SmilChr06G000109 Chr06 NC_080392.1:774998-775009promoter 内 1524-1535 bp + 2466 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 767355-772532(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCCA
SmilChr01G003172 Chr01 NC_080387.1:50531316-50531327promoter 内 654-665 bp + 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 50522332-50527980(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCAC
SmilChr04G000163 Chr04 NC_080390.1:1471905-1471916promoter 内 563-574 bp - 3427 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 1463504-1468478(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGGG
SmilChr06G003199 Chr06 NC_080392.1:44858995-44859006promoter 内 481-492 bp - 3509 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 44853100-44855486(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAGG
SmilChr02G004466 Chr02 NC_080388.1:67072830-67072841promoter 内 114-125 bp - 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 67065916-67068954(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAGG
SmilChr05G002695 Chr05 NC_080391.1:30785071-30785082promoter 内 47-58 bp + 3943 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 30789025-30790187(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCTA
SmilChr05G001054 Chr05 NC_080391.1:8732450-8732461promoter 内 590-601 bp - 3400 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 4 8735861-8739073(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAAA
SmilChr07G003704 Chr07 NC_080393.1:44698795-44698806promoter 内 3759-3770 bp + 231 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 44699037-44700035(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGTG
SmilChr08G002282 Chr08 NC_080394.1:21232336-21232347promoter 内 3075-3086 bp - 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 21230212-21231421(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGTG
SmilChr03G003048 Chr03 NC_080389.1:47384084-47384095promoter 内 2738-2749 bp + 1252 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 47385347-47389171(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCAA
SmilChr08G000732 Chr08 NC_080394.1:5428953-5428964promoter 内 2023-2034 bp - 1967 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 5422072-5426986(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGAA
SmilChr01G002928 Chr01 NC_080387.1:48055475-48055486promoter 内 1735-1746 bp + 2255 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 48057741-48060375(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGTG
SmilChr03G000283 Chr03 NC_080389.1:3220872-3220883promoter 内 1537-1548 bp + 2453 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 3217644-3218419(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAAA
SmilChr07G003967 Chr07 NC_080393.1:50494563-50494574promoter 内 1202-1213 bp + 2788 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 50489365-50491775(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAAA
SmilChr01G000559 Chr01 NC_080387.1:11649115-11649126promoter 内 865-876 bp - 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 11644323-11645990(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCGA
SmilChr02G005517 Chr02 NC_080388.1:75283341-75283352promoter 内 427-438 bp - 3563 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 75286915-75287274(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAAA
SmilChr05G001167 Chr05 NC_080391.1:9794808-9794819promoter 内 3850-3861 bp - 140 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 9793050-9794668(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATG
SmilChr07G001468 Chr07 NC_080393.1:11534105-11534116promoter 内 3087-3098 bp + 903 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 11527509-11533202(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAAA
SmilChr04G003112 Chr04 NC_080390.1:47681916-47681927promoter 内 2843-2854 bp + 1147 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 47679646-47680769(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCAA
SmilChr08G000716 Chr08 NC_080394.1:5314429-5314440promoter 内 2594-2605 bp - 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 5308116-5313033(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGAA
SmilChr02G002400 Chr02 NC_080388.1:41883720-41883731promoter 内 2524-2535 bp - 1466 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 41885197-41886517(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCTG
SmilChr06G000180 Chr06 NC_080392.1:1261490-1261501promoter 内 2206-2217 bp - 1784 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 1257697-1259706(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGAA
SmilChr05G000704 Chr05 NC_080391.1:5295085-5295096promoter 内 2051-2062 bp + 1939 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 5297035-5321242(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCAA