转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 5 / 149 下载 TSV

上一页 5 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G004141 Chr04 NC_080390.1:56178952-56178962promoter 内 941-951 bp + 3050 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 56182012-56184519(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCGGCTGTCA
SmilChr04G001438 Chr04 NC_080390.1:23456782-23456792promoter 内 512-522 bp - 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 23460271-23461244(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGGT
SmilChr03G003356 Chr03 NC_080389.1:51882650-51882660promoter 内 279-289 bp + 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 51886372-51889616(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCGGCTGTCA
SmilChr05G000476 Chr05 NC_080391.1:3658915-3658925promoter 内 3058-3068 bp + 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 4 3659858-3662144(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACAGCTGTCA
SmilChr05G003020 Chr05 NC_080391.1:37597422-37597432promoter 内 2738-2748 bp - 1253 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 4 37595765-37596169(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACAGCTGTCA
SmilChr03G002085 Chr03 NC_080389.1:32086926-32086936promoter 内 1602-1612 bp - 2389 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 3 32080679-32084537(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACAGCTGTCA
SmilChr01G005441 Chr01 NC_080387.1:71520730-71520740promoter 内 3301-3311 bp - 690 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 71521430-71523973(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGT
SmilChr07G002568 Chr07 NC_080393.1:24515000-24515010promoter 内 2801-2811 bp + 1190 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 24513704-24513810(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGT
SmilChr05G000207 Chr05 NC_080391.1:1649788-1649798promoter 内 2586-2596 bp - 1405 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 1645530-1648383(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACAGCTGTCA
SmilChr04G000725 Chr04 NC_080390.1:8517099-8517109promoter 内 2492-2502 bp + 1499 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 8518608-8520353(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCG
SmilChr02G001211 Chr02 NC_080388.1:22305488-22305498promoter 内 1755-1765 bp - 2236 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 22300368-22303252(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACAGCTGTCA
SmilChr02G001210 Chr02 NC_080388.1:22288594-22288604promoter 内 1754-1764 bp - 2237 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 22283444-22286357(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACAGCTGTCA
SmilChr05G001525 Chr05 NC_080391.1:13968160-13968170promoter 内 1724-1734 bp + 2267 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 13962947-13965893(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGT
SmilChr02G003127 Chr02 NC_080388.1:52294928-52294938promoter 内 1017-1027 bp + 2974 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 52297912-52299027(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACAGCTGTCA
SmilChr02G001192 Chr02 NC_080388.1:21898785-21898795promoter 内 1004-1014 bp - 2987 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 21893830-21895798(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACAGCTGTCA
SmilChr05G002877 Chr05 NC_080391.1:34450477-34450487promoter 内 572-582 bp + 3419 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 34445134-34447058(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTC
SmilChr03G002185 Chr03 NC_080389.1:34074897-34074907promoter 内 340-350 bp + 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 34078558-34080770(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCG
SmilChr07G003269 Chr07 NC_080393.1:34448270-34448280promoter 内 18-28 bp - 3973 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 34441622-34444297(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GACAGCTGTCA
SmilChr04G001422 Chr04 NC_080390.1:23149202-23149212promoter 内 3983-3993 bp - 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 23149220-23158067(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGT
SmilChr05G003110 Chr05 NC_080391.1:39529558-39529568promoter 内 3517-3527 bp + 474 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 39530042-39533351(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCG
SmilChr05G003108 Chr05 NC_080391.1:39529558-39529568promoter 内 3288-3298 bp + 703 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 39525991-39528855(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGT
SmilChr02G001228 Chr02 NC_080388.1:22575579-22575589promoter 内 3110-3120 bp - 881 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 22576470-22583545(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGT
SmilChr01G000281 Chr01 NC_080387.1:5523044-5523054promoter 内 2974-2984 bp - 1017 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 5521374-5522027(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCG
SmilChr04G001910 Chr04 NC_080390.1:31204484-31204494promoter 内 2914-2924 bp + 1077 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 31189791-31203407(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGT
SmilChr01G004754 Chr01 NC_080387.1:65742289-65742299promoter 内 2453-2463 bp - 1538 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 65743837-65744217(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGT
SmilChr04G000046 Chr04 NC_080390.1:421189-421199promoter 内 2419-2429 bp + 1572 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 422771-424229(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCG
SmilChr02G001296 Chr02 NC_080388.1:23974869-23974879promoter 内 2414-2424 bp - 1577 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 23972360-23973292(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCG
SmilChr01G001038 Chr01 NC_080387.1:21605743-21605753promoter 内 2413-2423 bp + 1578 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 21607331-21608758(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCG
SmilChr03G000719 Chr03 NC_080389.1:8056901-8056911promoter 内 2322-2332 bp - 1669 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 8058580-8060311(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGT
SmilChr02G003352 Chr02 NC_080388.1:54713583-54713593promoter 内 2319-2329 bp + 1672 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 54710558-54711911(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGT
SmilChr06G001949 Chr06 NC_080392.1:24056779-24056789promoter 内 2235-2245 bp + 1756 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 24050547-24055023(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGT
SmilChr02G003642 Chr02 NC_080388.1:57775340-57775350promoter 内 2186-2196 bp - 1805 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 57770884-57773535(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCG
SmilChr01G000861 Chr01 NC_080387.1:18528987-18528997promoter 内 2081-2091 bp - 1910 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 18525937-18527077(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCG
SmilChr04G000843 Chr04 NC_080390.1:10656141-10656151promoter 内 1912-1922 bp + 2079 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 10658230-10661709(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCG
SmilChr04G001087 Chr04 NC_080390.1:15596912-15596922promoter 内 1864-1874 bp - 2127 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 15599049-15601502(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGT
SmilChr03G002569 Chr03 NC_080389.1:40880143-40880153promoter 内 1836-1846 bp - 2155 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 40875172-40877988(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCG
SmilChr03G001170 Chr03 NC_080389.1:13456671-13456681promoter 内 1400-1410 bp - 2591 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 13459272-13460810(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGT
SmilChr04G000044 Chr04 NC_080390.1:421189-421199promoter 内 1218-1228 bp + 2773 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 414793-418416(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGT
SmilChr01G000280 Chr01 NC_080387.1:5523044-5523054promoter 内 1211-1221 bp - 2780 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 5517309-5520264(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCG
SmilChr07G001831 Chr07 NC_080393.1:15801272-15801282promoter 内 2-12 bp - 3989 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 15792218-15797283(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCG
SmilChr01G005956 Chr01 NC_080387.1:75251435-75251445promoter 内 3719-3729 bp + 272 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 75251717-75253499(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCA
SmilChr05G000004 Chr05 NC_080391.1:8020-8030promoter 内 2649-2659 bp + 1342 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 9372-18827(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCA
SmilChr03G001633 Chr03 NC_080389.1:21025225-21025235promoter 内 2026-2036 bp + 1965 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 21022167-21023260(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTG
SmilChr03G001226 Chr03 NC_080389.1:14147942-14147952promoter 内 3023-3033 bp + 968 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 14148920-14152203(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGGCC
SmilChr02G004369 Chr02 NC_080388.1:66015385-66015395promoter 内 828-838 bp - 3163 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 66010727-66012222(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCA
SmilChr02G004373 Chr02 NC_080388.1:66082104-66082114promoter 内 821-831 bp - 3170 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 66077448-66078934(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCA
SmilChr07G002478 Chr07 NC_080393.1:23383074-23383084promoter 内 3567-3577 bp + 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 23380436-23382650(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTG
SmilChr06G000834 Chr06 NC_080392.1:7839818-7839828promoter 内 3222-3232 bp + 769 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 7836825-7839049(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTG
SmilChr05G000517 Chr05 NC_080391.1:3992388-3992398promoter 内 2669-2679 bp + 1322 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 3989011-3991066(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTG
SmilChr03G001581 Chr03 NC_080389.1:19970248-19970258promoter 内 2344-2354 bp - 1647 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 19967704-19968601(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTCA