转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G001094; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021820-RA_Salv SmilChr04G001094 WRKY XP_057804404.1 MP00408 AGCGTTGACTTTT

可能结合的靶基因

9902 个结合位点 8149 个候选靶基因 第 50 / 163 下载 TSV

上一页 50 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G002244 Chr07 NC_080393.1:20596743-20596755promoter 内 1667-1679 bp + 2322 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 20599077-20601135(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTCGTTGACTATA
SmilChr06G002958 Chr06 NC_080392.1:42391001-42391013promoter 内 1635-1647 bp - 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 42385067-42388647(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTCGTTGACCTCC
SmilChr02G004390 Chr02 NC_080388.1:66249012-66249024promoter 内 1578-1590 bp - 2411 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 66251435-66255580(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGAAGTCAACTCT
SmilChr01G004895 Chr01 NC_080387.1:67036095-67036107promoter 内 1574-1586 bp + 2415 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 66999498-67033680(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACTTT
SmilChr06G001768 Chr06 NC_080392.1:20652463-20652475promoter 内 1524-1536 bp - 2465 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 20645950-20649998(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTGGTTGACTTTA
SmilChr01G004302 Chr01 NC_080387.1:61193788-61193800promoter 内 1248-1260 bp + 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 61196541-61197712(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TAGGTTGACTTTG
SmilChr06G002960 Chr06 NC_080392.1:42391001-42391013promoter 内 1172-1184 bp - 2817 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 42393830-42394441(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGAGGTCAACGAC
SmilChr01G004873 Chr01 NC_080387.1:66834211-66834223promoter 内 957-969 bp - 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 66837255-66837328(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCGAGTCAACGGT
SmilChr04G000671 Chr04 NC_080390.1:7608962-7608974promoter 内 872-884 bp + 3117 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7603724-7605845(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAACATC
SmilChr04G000316 Chr04 NC_080390.1:2900059-2900071promoter 内 864-876 bp + 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 2903196-2906187(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATCGTTGACTGTG
SmilChr02G000052 Chr02 NC_080388.1:701666-701678promoter 内 791-803 bp - 3198 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 694513-698468(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACAGTTGACTTGT
SmilChr02G000168 Chr02 NC_080388.1:2170471-2170483promoter 内 789-801 bp + 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 2173683-2177646(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACAGTTGACTTGT
SmilChr08G002566 Chr08 NC_080394.1:24995251-24995263promoter 内 655-667 bp - 3334 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 24998597-25000654(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTTAGTCAACGAC
SmilChr01G004874 Chr01 NC_080387.1:66834211-66834223promoter 内 639-651 bp - 3350 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 66837573-66839486(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCGAGTCAACGGT
SmilChr06G001629 Chr06 NC_080392.1:18231425-18231437promoter 内 628-640 bp - 3361 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 18218045-18228064(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAGTTGACTTCG
SmilChr02G004884 Chr02 NC_080388.1:70924338-70924350promoter 内 527-539 bp + 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 70927812-70928715(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACTGTTGACTTTC
SmilChr07G002248 Chr07 NC_080393.1:20667844-20667856promoter 内 511-523 bp + 3478 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 20659104-20664366(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TATAGTCAACGAG
SmilChr07G002242 Chr07 NC_080393.1:20596743-20596755promoter 内 510-522 bp + 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 20587964-20593264(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TATAGTCAACGAG
SmilChr02G004834 Chr02 NC_080388.1:70455872-70455884promoter 内 447-459 bp - 3542 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 70459426-70471260(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACTCG
SmilChr03G001356 Chr03 NC_080389.1:15932129-15932141promoter 内 363-375 bp + 3626 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 15927053-15928503(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAACATC
SmilChr07G000237 Chr07 NC_080393.1:1527459-1527471promoter 内 301-313 bp - 3688 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 1531159-1531499(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATAAGTCAACCCT
SmilChr02G004660 Chr02 NC_080388.1:68999152-68999164promoter 内 222-234 bp + 3767 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 69002931-69006333(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAGTTGACTTTC
SmilChr05G001848 Chr05 NC_080391.1:18512534-18512546promoter 内 129-141 bp - 3860 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 18506540-18508674(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACTGTTGACTTTC
SmilChr08G002947 Chr08 NC_080394.1:29480543-29480555promoter 内 96-108 bp + 3893 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 29475026-29476650(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGTAGTCAACGTC
SmilChr02G002965 Chr02 NC_080388.1:50164115-50164127promoter 内 24-36 bp + 3965 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 50168092-50171839(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGGGTTGACTTAT
SmilChr02G005121 Chr02 NC_080388.1:72699196-72699208promoter 内 3661-3673 bp + 328 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 72698374-72698868(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATGAGTCAACGGA
SmilChr07G002386 Chr07 NC_080393.1:22269068-22269080promoter 内 3565-3577 bp + 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 22267402-22268644(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACCAT
SmilChr05G001344 Chr05 NC_080391.1:11872466-11872478promoter 内 2743-2755 bp + 1246 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 11873724-11877614(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACCATC
SmilChr04G000160 Chr04 NC_080390.1:1390983-1390995promoter 内 3835-3847 bp - 154 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 1390228-1390829(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACCATC
SmilChr02G000709 Chr02 NC_080388.1:11436655-11436667promoter 内 3683-3695 bp + 306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 11436973-11442426(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGGGTTGACTTCG
SmilChr02G000156 Chr02 NC_080388.1:2025823-2025835promoter 内 3224-3236 bp + 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 2021802-2025058(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GATGGTCAACGCG
SmilChr07G000113 Chr07 NC_080393.1:637303-637315promoter 内 2648-2660 bp + 1341 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 635802-635962(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAGGTCAACGGA
SmilChr01G002624 Chr01 NC_080387.1:44512590-44512602promoter 内 2544-2556 bp - 1445 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 44508084-44511145(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAGTTGACTTCC
SmilChr06G000763 Chr06 NC_080392.1:7078926-7078938promoter 内 2343-2355 bp - 1646 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 7073968-7077280(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACCATC
SmilChr06G000980 Chr06 NC_080392.1:9564512-9564524promoter 内 2204-2216 bp + 1785 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 9561641-9562727(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GATGGTCAACGCG
SmilChr07G000554 Chr07 NC_080393.1:3818736-3818748promoter 内 1827-1839 bp + 2162 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 3813308-3816574(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GATGGTCAACGCG
SmilChr05G002685 Chr05 NC_080391.1:30486055-30486067promoter 内 1534-1546 bp - 2455 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 30488522-30488929(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACAGTCAACGAG
SmilChr07G000283 Chr07 NC_080393.1:1837887-1837899promoter 内 1472-1484 bp - 2517 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 1831818-1835370(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAGTTGACTATT
SmilChr05G001247 Chr05 NC_080391.1:10595438-10595450promoter 内 1424-1436 bp - 2565 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 10598015-10601637(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GATGGTCAACGCG
SmilChr08G001113 Chr08 NC_080394.1:8637646-8637658promoter 内 1018-1030 bp + 2971 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 8633853-8634675(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACAAGTCAACCCT
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SmilChr04G001637 Chr04 NC_080390.1:27178171-27178183promoter 内 816-828 bp - 3173 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 27174147-27174998(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GACGTTGACCTCC
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SmilChr05G002695 Chr05 NC_080391.1:30785329-30785341promoter 内 305-317 bp + 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 30789025-30790187(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CACGTTGACTGTT
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SmilChr02G005122 Chr02 NC_080388.1:72699196-72699208promoter 内 3914-3926 bp + 75 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 72699283-72703370(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TCCGTTGACTCAT
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SmilChr06G002300 Chr06 NC_080392.1:33234736-33234748promoter 内 3865-3877 bp + 124 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 33228596-33234612(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAATGCT
SmilChr04G003694 Chr04 NC_080390.1:53327109-53327121promoter 内 3847-3859 bp + 142 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 53321489-53326967(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACAAGTCAACCCT
SmilChr07G002595 Chr07 NC_080393.1:24946912-24946924promoter 内 3801-3813 bp - 188 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 24946035-24946724(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACCATC