转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G001252; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00025976-RA_Salv SmilChr03G001252 bZIP XP_057802461.1 MP00291 AATGGTCACGTGGCA

可能结合的靶基因

9321 个结合位点 6894 个候选靶基因 第 51 / 138 下载 TSV

上一页 51 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001910 Chr05 NC_080391.1:19368600-19368614promoter 内 2685-2699 bp - 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 19369916-19371708(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGTTCGTA
SmilChr06G003078 Chr06 NC_080392.1:43672182-43672196promoter 内 2642-2656 bp + 1345 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 43673541-43676182(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCTTTGACGTGGCA
SmilChr02G003651 Chr02 NC_080388.1:57908681-57908695promoter 内 2401-2415 bp - 1586 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 57887944-57907095(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGGAACGACGTGGCA
SmilChr06G002044 Chr06 NC_080392.1:26726339-26726353promoter 内 2372-2386 bp - 1615 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 26727968-26729446(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCAAAAGT
SmilChr06G002662 Chr06 NC_080392.1:38469326-38469340promoter 内 2247-2261 bp - 1740 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 38467070-38467586(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CATCCTGACGTGGCG
SmilChr06G001551 Chr06 NC_080392.1:16880606-16880620promoter 内 2184-2198 bp - 1803 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 16875685-16878803(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GAATGACACGTGGCC
SmilChr05G000903 Chr05 NC_080391.1:7153049-7153063promoter 内 2120-2134 bp + 1867 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 7154930-7157290(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATTTGTCACGTGTCA
SmilChr07G001965 Chr07 NC_080393.1:17177939-17177953promoter 内 2117-2131 bp + 1870 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 17179823-17179904(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATATACCACGTGGCG
SmilChr01G001774 Chr01 NC_080387.1:32655010-32655024promoter 内 1956-1970 bp + 2031 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 32650047-32652979(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGACACGTGACAAAT
SmilChr04G002677 Chr04 NC_080390.1:42214051-42214065promoter 内 1927-1941 bp + 2060 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 42208264-42211991(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGAGCATG
SmilChr04G002678 Chr04 NC_080390.1:42214051-42214065promoter 内 1926-1940 bp + 2061 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 42216126-42218986(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CATGCTCACGTGGCT
SmilChr06G000023 Chr06 NC_080392.1:263381-263395promoter 内 1901-1915 bp - 2086 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 265481-266796(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTCATACAC
SmilChr04G000388 Chr04 NC_080390.1:3926229-3926243promoter 内 1445-1459 bp - 2542 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 3928785-3931497(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCCACGTCAGATAC
SmilChr08G001119 Chr08 NC_080394.1:8694651-8694665promoter 内 1160-1174 bp - 2827 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 8689748-8691824(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATTTGTCACGTGTCA
SmilChr08G004202 Chr08 NC_080394.1:51389754-51389768promoter 内 1002-1016 bp + 2985 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 51384774-51386769(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTCGAGG
SmilChr08G002291 Chr08 NC_080394.1:21402786-21402800promoter 内 842-856 bp - 3145 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 21390780-21399641(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GCTTCCGACGTGGCC
SmilChr01G005481 Chr01 NC_080387.1:71789381-71789395promoter 内 765-779 bp + 3222 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 71780374-71786159(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCCACGTGGTCTTT
SmilChr01G005625 Chr01 NC_080387.1:72728361-72728375promoter 内 727-741 bp + 3260 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 72723566-72725101(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGAATAAC
SmilChr03G001462 Chr03 NC_080389.1:17459222-17459236promoter 内 622-636 bp + 3365 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 17462601-17463092(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATTGGACACGTGGCT
SmilChr02G000793 Chr02 NC_080388.1:13084120-13084134promoter 内 555-569 bp - 3432 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 13079223-13080688(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTGTTCGACGTGGCA
SmilChr01G005483 Chr01 NC_080387.1:71789381-71789395promoter 内 429-443 bp + 3558 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 71792953-71796786(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AAAGACCACGTGGCC
SmilChr06G001479 Chr06 NC_080392.1:15760925-15760939promoter 内 369-383 bp + 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 15755666-15757307(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCCACGTGTCATTC
SmilChr07G003179 Chr07 NC_080393.1:33855246-33855260promoter 内 361-375 bp + 3626 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 33849962-33851620(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGACCTAA
SmilChr01G005893 Chr01 NC_080387.1:74870371-74870385promoter 内 280-294 bp + 3707 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 74865435-74866664(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCCACGTCTGCAGT
SmilChr01G001775 Chr01 NC_080387.1:32655010-32655024promoter 内 254-268 bp + 3733 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 32658757-32659365(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATTTGTCACGTGTCA
SmilChr07G001801 Chr07 NC_080393.1:15374277-15374291promoter 内 242-256 bp + 3745 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 15378036-15379512(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATTTGTCACGTGTCA
SmilChr01G001264 Chr01 NC_080387.1:25342851-25342865promoter 内 225-239 bp + 3762 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 25338009-25339089(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGACCTTG
SmilChr04G000496 Chr04 NC_080390.1:5421921-5421935promoter 内 11-25 bp - 3976 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 5408334-5417945(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AAGTAACACGTGGCA
SmilChr04G003536 Chr04 NC_080390.1:51724847-51724861promoter 内 3795-3809 bp - 192 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 5 51720969-51724655(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CATTTCCACGTGGCG
SmilChr07G000850 Chr07 NC_080393.1:6062681-6062695promoter 内 3511-3525 bp + 476 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 4 6063171-6068599(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CATTTCCACGTGGCG
SmilChr06G001076 Chr06 NC_080392.1:10661682-10661696promoter 内 3393-3407 bp + 594 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 10659329-10661088(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGACCCCA
SmilChr04G003537 Chr04 NC_080390.1:51727049-51727063promoter 内 1828-1842 bp + 2159 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 51729222-51732261(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CATTTCCACGTGGCG
SmilChr01G004973 Chr01 NC_080387.1:67816916-67816930promoter 内 1350-1364 bp + 2637 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 67819567-67820587(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCTTCCACGTGGCG
SmilChr03G004132 Chr03 NC_080389.1:60159372-60159386promoter 内 3947-3961 bp - 40 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 60155499-60159332(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCGCCTACGTGGCA
SmilChr05G003910 Chr05 NC_080391.1:52831458-52831472promoter 内 3907-3921 bp + 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 52825024-52831378(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGGCGGAA
SmilChr01G002667 Chr01 NC_080387.1:44895125-44895139promoter 内 3832-3846 bp - 155 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 44886469-44894970(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TCGGATGACGTGGCG
SmilChr08G002249 Chr08 NC_080394.1:20716605-20716619promoter 内 3696-3710 bp - 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 20716910-20721967(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTCAAAATT
SmilChr05G001623 Chr05 NC_080391.1:15093363-15093377promoter 内 3493-3507 bp + 494 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 15089812-15092869(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTCAGCAGC
SmilChr03G003172 Chr03 NC_080389.1:49095281-49095295promoter 内 3281-3295 bp - 706 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 49092602-49094575(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGTTTTGACGTGGCG
SmilChr01G002455 Chr01 NC_080387.1:42156871-42156885promoter 内 3181-3195 bp + 806 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 42152156-42156065(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCATTTTC
SmilChr04G001266 Chr04 NC_080390.1:20083047-20083061promoter 内 3003-3017 bp - 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 20084045-20087692(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTCAAAATT
SmilChr04G000074 Chr04 NC_080390.1:690560-690574promoter 内 2689-2703 bp - 1298 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 691872-693812(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGGGTAGT
SmilChr02G003049 Chr02 NC_080388.1:51285813-51285827promoter 内 2374-2388 bp - 1613 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 51287440-51289156(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTCAGCAGC
SmilChr06G002500 Chr06 NC_080392.1:35877282-35877296promoter 内 2277-2291 bp + 1710 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 35879006-35881427(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCTTCCACGTGGCG
SmilChr02G002733 Chr02 NC_080388.1:47250650-47250664promoter 内 2099-2113 bp + 1888 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 47252552-47261659(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GCTGCTGACGTGGCT
SmilChr03G002998 Chr03 NC_080389.1:46799628-46799642promoter 内 1851-1865 bp + 2136 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 46795834-46797492(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGTTATG
SmilChr03G001716 Chr03 NC_080389.1:23010821-23010835promoter 内 1804-1818 bp + 2183 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 23006394-23008638(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGAAGAA
SmilChr02G000720 Chr02 NC_080388.1:11589366-11589380promoter 内 1230-1244 bp - 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 11592137-11595069(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTCAGCAGC
SmilChr06G002910 Chr06 NC_080392.1:41948843-41948857promoter 内 1071-1085 bp - 2916 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 41943215-41945927(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GCTGCTGACGTGGCT
SmilChr08G002792 Chr08 NC_080394.1:27624527-27624541promoter 内 954-968 bp + 3033 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 27627574-27628949(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGATTCCACGTGGCG