转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G001094; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021820-RA_Salv SmilChr04G001094 WRKY XP_057804404.1 MP00408 AGCGTTGACTTTT

可能结合的靶基因

9902 个结合位点 8149 个候选靶基因 第 58 / 163 下载 TSV

上一页 58 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G002191 Chr08 NC_080394.1:19789461-19789473promoter 内 2755-2767 bp - 1234 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 19787523-19788227(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAGTTGACTCTG
SmilChr07G000641 Chr07 NC_080393.1:4320200-4320212promoter 内 2706-2718 bp - 1283 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 4316350-4318917(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGAGTTGACTTGT
SmilChr08G001279 Chr08 NC_080394.1:10185725-10185737promoter 内 2615-2627 bp + 1374 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 10182200-10184351(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAATGCT
SmilChr07G000642 Chr07 NC_080393.1:4320200-4320212promoter 内 2605-2617 bp - 1384 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 4321596-4322944(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACAAGTCAACTCA
SmilChr02G002151 Chr02 NC_080388.1:38725104-38725116promoter 内 2579-2591 bp + 1410 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 38726526-38737738(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTAGTTGACTTTC
SmilChr01G002160 Chr01 NC_080387.1:37602702-37602714promoter 内 2290-2302 bp + 1699 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 37604413-37606391(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGTGTTGACTTAT
SmilChr02G001154 Chr02 NC_080388.1:21015842-21015854promoter 内 2110-2122 bp + 1879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 21009999-21013963(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAACGTCAACGCC
SmilChr02G003320 Chr02 NC_080388.1:54465959-54465971promoter 内 1965-1977 bp - 2024 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 54458988-54463935(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACCGTTGACCATA
SmilChr01G004790 Chr01 NC_080387.1:66118358-66118370promoter 内 1860-1872 bp + 2129 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 66120499-66122980(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTAGTTGACTTTC
SmilChr02G001813 Chr02 NC_080388.1:32968749-32968761promoter 内 1775-1787 bp + 2214 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 32970975-32982329(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACCGTTGACTCCC
SmilChr05G000973 Chr05 NC_080391.1:7871213-7871225promoter 内 1361-1373 bp - 2628 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 7873853-7877402(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGGAGTCAACGGT
SmilChr02G000329 Chr02 NC_080388.1:4205461-4205473promoter 内 1198-1210 bp - 2791 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 4201138-4202670(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACCGTTGACCGTT
SmilChr02G000332 Chr02 NC_080388.1:4213449-4213461promoter 内 1198-1210 bp - 2791 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 4209441-4210658(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACCGTTGACCGTT
SmilChr03G002258 Chr03 NC_080389.1:35557787-35557799promoter 内 957-969 bp - 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 35560831-35561946(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAAGTCAACCCC
SmilChr05G000534 Chr05 NC_080391.1:4093686-4093698promoter 内 662-674 bp + 3327 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 4084664-4090359(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCAAGTCAACCCT
SmilChr04G001502 Chr04 NC_080390.1:24623873-24623885promoter 内 609-621 bp + 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 24627265-24628260(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TCGGTTGACTTCT
SmilChr05G002890 Chr05 NC_080391.1:34668687-34668699promoter 内 599-611 bp + 3390 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 34672089-34681025(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAGTTGACTCTG
SmilChr05G002953 Chr05 NC_080391.1:35685278-35685290promoter 内 579-591 bp - 3410 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 35680942-35681868(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACCGTTGACTCCC
SmilChr01G000551 Chr01 NC_080387.1:11461478-11461490promoter 内 564-576 bp - 3425 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 11464915-11488037(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAGAGTCAACTGC
SmilChr04G003638 Chr04 NC_080390.1:52875448-52875460promoter 内 146-158 bp - 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 52871520-52871605(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAGTTGACTCTG
SmilChr04G001035 Chr04 NC_080390.1:14710433-14710445promoter 内 76-88 bp + 3913 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 14714358-14715337(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAGTTGACTCTG
SmilChr08G002173 Chr08 NC_080394.1:19652444-19652456promoter 内 3905-3917 bp + 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 19649183-19652360(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AATAGTCAACCGT
SmilChr07G002164 Chr07 NC_080393.1:19812013-19812025promoter 内 3888-3900 bp - 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 19798184-19811912(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACCGTTGACTCCC
SmilChr06G000643 Chr06 NC_080392.1:5699127-5699139promoter 内 3858-3870 bp + 131 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 5698318-5698996(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATAAGTCAACCCG
SmilChr01G002730 Chr01 NC_080387.1:45657965-45657977promoter 内 3840-3852 bp - 149 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 45658126-45662265(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACGGTCAACGGT
SmilChr08G000039 Chr08 NC_080394.1:265715-265727promoter 内 3807-3819 bp - 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 263971-265533(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCCGTTGACCTAA
SmilChr08G000049 Chr08 NC_080394.1:303989-304001promoter 内 3701-3713 bp - 288 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 304289-305808(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACTTC
SmilChr02G000159 Chr02 NC_080388.1:2062360-2062372promoter 内 3645-3657 bp - 344 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 2061494-2062016(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGGGTTGACTTGC
SmilChr08G003041 Chr08 NC_080394.1:30575803-30575815promoter 内 3645-3657 bp + 344 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 30576159-30576794(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGGGTTGACTTGC
SmilChr03G000652 Chr03 NC_080389.1:7246162-7246174promoter 内 3644-3656 bp + 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 7246519-7247247(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGGGTTGACTTGC
SmilChr05G003037 Chr05 NC_080391.1:38116681-38116693promoter 内 3644-3656 bp - 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 38115557-38116336(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGGGTTGACTTGC
SmilChr07G002980 Chr07 NC_080393.1:30363693-30363705promoter 内 3644-3656 bp + 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 30364050-30364430(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGGGTTGACTTGC
SmilChr04G003647 Chr04 NC_080390.1:52977758-52977770promoter 内 3639-3651 bp + 350 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 52975421-52977408(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GATGGTCAACGGA
SmilChr03G000206 Chr03 NC_080389.1:2363795-2363807promoter 内 3439-3451 bp - 550 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 2364357-2367604(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAAGTCAACCCC
SmilChr07G002979 Chr07 NC_080393.1:30363693-30363705promoter 内 3431-3443 bp + 558 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 30362342-30363135(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAAGTCAACCCC
SmilChr05G001654 Chr05 NC_080391.1:15615410-15615422promoter 内 3341-3353 bp + 648 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 15616070-15616697(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCAGTTGACTTGT
SmilChr02G003321 Chr02 NC_080388.1:54465959-54465971promoter 内 3322-3334 bp - 667 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 54466638-54472850(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TATGGTCAACGGT
SmilChr06G001584 Chr06 NC_080392.1:17277404-17277416promoter 内 3308-3320 bp + 681 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 17278097-17283063(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGGGTTGACTTGC
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SmilChr08G000777 Chr08 NC_080394.1:5730185-5730197promoter 内 3117-3129 bp - 872 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 5731069-5732410(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACTTG
SmilChr02G002796 Chr02 NC_080388.1:48056523-48056535promoter 内 3067-3079 bp + 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 48039990-48055601(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTAAGTCAACCGT
SmilChr04G000595 Chr04 NC_080390.1:6665969-6665981promoter 内 2957-2969 bp - 1032 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 6662870-6664937(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATCGTTGACTAAT
SmilChr04G002983 Chr04 NC_080390.1:46256089-46256101promoter 内 2906-2918 bp + 1083 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 46254345-46255006(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGGAGTCAACGAC
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SmilChr08G001066 Chr08 NC_080394.1:8230391-8230403promoter 内 2812-2824 bp - 1177 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 8227790-8229214(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCAGTTGACTTGT
SmilChr02G002706 Chr02 NC_080388.1:46912399-46912411promoter 内 2748-2760 bp - 1241 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 46906815-46911158(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTAGTTGACTTTC
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SmilChr04G002083 Chr04 NC_080390.1:33592042-33592054promoter 内 2740-2752 bp + 1249 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 33587826-33590793(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TATGGTCAACGGT