转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 64 / 148 下载 TSV

上一页 64 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001654 Chr05 NC_080391.1:15613588-15613601promoter 内 1519-1532 bp + 2469 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 15616070-15616697(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTAAGTCACGTGT
SmilChr01G004457 Chr01 NC_080387.1:62688576-62688589promoter 内 792-805 bp - 3196 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 62691785-62695137(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGAGCAAC
SmilChr04G003016 Chr04 NC_080390.1:46558134-46558147promoter 内 719-732 bp - 3269 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 46553509-46554865(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTCTGCCACGTGG
SmilChr04G000627 Chr04 NC_080390.1:7136530-7136543promoter 内 646-659 bp - 3342 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 7132128-7133188(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGATCCCACGTGG
SmilChr03G004622 Chr03 NC_080389.1:63895458-63895471promoter 内 293-306 bp + 3695 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 63899166-63902492(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACGTCCCACGTGG
SmilChr01G004456 Chr01 NC_080387.1:62688576-62688589promoter 内 277-290 bp - 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 62681442-62684865(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTGCTCCACGTGG
SmilChr07G004185 Chr07 NC_080393.1:53833989-53834002promoter 内 238-251 bp + 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 53837752-53841072(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTGGAACACGTGG
SmilChr07G004183 Chr07 NC_080393.1:53822870-53822883promoter 内 207-220 bp + 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 53816357-53819089(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACACATC
SmilChr04G002165 Chr04 NC_080390.1:34925053-34925066promoter 内 3982-3995 bp - 6 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 34925072-34927779(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACAATAT
SmilChr04G002016 Chr04 NC_080390.1:32680057-32680070promoter 内 3942-3955 bp + 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 32677657-32680011(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCAGCAA
SmilChr06G000552 Chr06 NC_080392.1:4643696-4643709promoter 内 3933-3946 bp - 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 4643764-4646372(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACTCAA
SmilChr01G000903 Chr01 NC_080387.1:19086469-19086482promoter 内 3919-3932 bp - 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 19085731-19086400(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGTATATCACGTGG
SmilChr07G002091 Chr07 NC_080393.1:19024848-19024861promoter 内 3904-3917 bp + 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 19022989-19024764(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATCTGAT
SmilChr07G002847 Chr07 NC_080393.1:28586283-28586296promoter 内 3782-3795 bp + 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 28585103-28586077(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTACAT
SmilChr01G003012 Chr01 NC_080387.1:49158769-49158782promoter 内 3720-3733 bp + 268 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 49159050-49166685(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGAGTCCACGTGG
SmilChr02G002717 Chr02 NC_080388.1:47010905-47010918promoter 内 3715-3728 bp + 273 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 47011191-47012495(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGATGCACACGTGG
SmilChr01G005115 Chr01 NC_080387.1:68925246-68925259promoter 内 3657-3670 bp - 331 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 68919466-68924915(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGAGTCCACGTGG
SmilChr05G003919 Chr05 NC_080391.1:52948623-52948636promoter 内 3453-3466 bp - 535 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 52949171-52957577(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACTCAA
SmilChr06G000810 Chr06 NC_080392.1:7598372-7598385promoter 内 3451-3464 bp - 537 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7598922-7610826(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACATGTT
SmilChr05G002573 Chr05 NC_080391.1:28938777-28938790promoter 内 3398-3411 bp + 590 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 28939380-28941256(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGTTACACGTGG
SmilChr07G001101 Chr07 NC_080393.1:8120437-8120450promoter 内 3243-3256 bp - 745 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 8121195-8122470(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCAGTTAC
SmilChr05G003093 Chr05 NC_080391.1:39240688-39240701promoter 内 3230-3243 bp - 758 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 39234854-39239930(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCCTCTCACGTGG
SmilChr06G003107 Chr06 NC_080392.1:43917711-43917724promoter 内 3224-3237 bp + 764 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 43918488-43921710(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TACACCGCACGTGG
SmilChr02G003221 Chr02 NC_080388.1:53434523-53434536promoter 内 3149-3162 bp + 839 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 53426847-53433684(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTAATTCT
SmilChr08G000308 Chr08 NC_080394.1:2158761-2158774promoter 内 3140-3153 bp + 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 2156778-2157913(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTGCCAT
SmilChr07G002496 Chr07 NC_080393.1:23668991-23669004promoter 内 3106-3119 bp - 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 23665352-23668109(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTGGAACACGTGG
SmilChr02G000499 Chr02 NC_080388.1:6873192-6873205promoter 内 3081-3094 bp + 907 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 6874112-6877974(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGAGTCCACGTGG
SmilChr01G004275 Chr01 NC_080387.1:60985938-60985951promoter 内 2965-2978 bp + 1023 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 60984478-60984915(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCAGCAA
SmilChr01G004730 Chr01 NC_080387.1:65467320-65467333promoter 内 2964-2977 bp - 1024 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 65468357-65469247(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGCAGTC
SmilChr05G003106 Chr05 NC_080391.1:39516432-39516445promoter 内 2960-2973 bp - 1028 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 39517473-39519063(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGGAGCA
SmilChr07G001100 Chr07 NC_080393.1:8120437-8120450promoter 内 2959-2972 bp - 1029 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 8116164-8119408(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTAACTGCACGTGG
SmilChr03G000683 Chr03 NC_080389.1:7630359-7630372promoter 内 2758-2771 bp - 1230 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7631602-7633987(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCTAAAC
SmilChr06G003106 Chr06 NC_080392.1:43917711-43917724promoter 内 2699-2712 bp + 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 43913624-43916422(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGGTGTA
SmilChr04G002018 Chr04 NC_080390.1:32747850-32747863promoter 内 2697-2710 bp - 1291 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 32744425-32746559(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAGGACACACGTGG
SmilChr06G000125 Chr06 NC_080392.1:887744-887757promoter 内 2668-2681 bp + 1320 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 882277-886424(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACTATCA
SmilChr03G003725 Chr03 NC_080389.1:56267846-56267859promoter 内 2624-2637 bp + 1364 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 56269223-56269672(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCAGATCACGTGG
SmilChr07G004705 Chr07 NC_080393.1:59934670-59934683promoter 内 2613-2626 bp - 1375 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 59931458-59933295(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGATTTCACGTGG
SmilChr01G003443 Chr01 NC_080387.1:52999484-52999497promoter 内 2455-2468 bp + 1533 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 53001030-53003259(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTGTACACGTGG
SmilChr08G000461 Chr08 NC_080394.1:3301671-3301684promoter 内 2336-2349 bp + 1652 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 3303336-3305546(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGTATCACACGTGG
SmilChr01G001613 Chr01 NC_080387.1:30265429-30265442promoter 内 2253-2266 bp - 1735 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 30259574-30263694(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTGTACACGTGG
SmilChr02G002049 Chr02 NC_080388.1:36883392-36883405promoter 内 2218-2231 bp + 1770 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 36879878-36881622(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTCCACA
SmilChr04G001710 Chr04 NC_080390.1:28265843-28265856promoter 内 2215-2228 bp + 1773 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 28261211-28264070(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTCCACA
SmilChr07G001325 Chr07 NC_080393.1:10193175-10193188promoter 内 2099-2112 bp - 1889 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 10184553-10191286(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCAGTTCACGTGA
SmilChr04G000880 Chr04 NC_080390.1:11197548-11197561promoter 内 2006-2019 bp - 1982 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 11199543-11203389(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTCCACA
SmilChr07G000795 Chr07 NC_080393.1:5619522-5619535promoter 内 1977-1990 bp + 2011 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 5616209-5617511(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTCCACT
SmilChr03G002931 Chr03 NC_080389.1:46056744-46056757promoter 内 1880-1893 bp + 2108 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 46058865-46062019(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTGCTGCCACGTGG
SmilChr07G000423 Chr07 NC_080393.1:2953604-2953617promoter 内 1720-1733 bp + 2268 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 2949953-2951336(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGACTCAT
SmilChr04G004109 Chr04 NC_080390.1:56036303-56036316promoter 内 1436-1449 bp + 2552 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 56031789-56033751(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCAAGAA
SmilChr07G003168 Chr07 NC_080393.1:33688690-33688703promoter 内 1428-1441 bp - 2560 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 33684788-33686130(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTGTACACGTGG
SmilChr05G003566 Chr05 NC_080391.1:47602474-47602487promoter 内 1314-1327 bp + 2674 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 47605161-47608309(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTGGAACACGTGG