转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G005851; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011948-RA_Salv SmilChr01G005851 MYB XP_057789306.1 MP00055 CAGATAAGGT

可能结合的靶基因

9685 个结合位点 6638 个候选靶基因 第 71 / 133 下载 TSV

上一页 71 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001578 Chr01 NC_080387.1:29810762-29810771promoter 内 189-198 bp - 3803 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 29805559-29806959(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATGATAAGGG
SmilChr02G000213 Chr02 NC_080388.1:2762975-2762984promoter 内 157-166 bp - 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2766819-2771340(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CCCTTATCAT
SmilChr02G003893 Chr02 NC_080388.1:61015102-61015111promoter 内 109-118 bp - 3883 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 61018994-61020289(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CCCTTATCAT
SmilChr02G003992 Chr02 NC_080388.1:62218279-62218288promoter 内 93-102 bp + 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 62222187-62223521(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATGATAAGGG
SmilChr01G004575 Chr01 NC_080387.1:63797754-63797763promoter 内 3911-3920 bp + 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 63793365-63797673(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GCCTTATCGT
SmilChr02G004237 Chr02 NC_080388.1:64551869-64551878promoter 内 3094-3103 bp + 898 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 64552776-64556602(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACGATAAGGC
SmilChr01G006037 Chr01 NC_080387.1:75872270-75872279promoter 内 1186-1195 bp - 2806 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 75875085-75878965(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GCCTTATCGT
SmilChr01G006035 Chr01 NC_080387.1:75872270-75872279promoter 内 895-904 bp - 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 75867731-75869173(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACGATAAGGC
SmilChr02G002377 Chr02 NC_080388.1:41660740-41660749promoter 内 3844-3853 bp - 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 41660897-41662976(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GCCTTATCGT
SmilChr02G001657 Chr02 NC_080388.1:30762924-30762933promoter 内 3106-3115 bp + 886 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 30763819-30765136(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACGATAAGGC
SmilChr01G000768 Chr01 NC_080387.1:16810533-16810542promoter 内 1649-1658 bp + 2343 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 16812885-16820170(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACGATAAGGC
SmilChr01G001636 Chr01 NC_080387.1:30404304-30404313promoter 内 2300-2309 bp - 1692 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 30406005-30409798(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GCCTTATCGT
SmilChr02G000857 Chr02 NC_080388.1:14641806-14641815promoter 内 730-739 bp - 3262 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 14637642-14638544(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACGATAAGGC
SmilChr01G002689 Chr01 NC_080387.1:45124492-45124501promoter 内 378-387 bp + 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 45128115-45129904(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACGATAAGGC
SmilChr02G003903 Chr02 NC_080388.1:61114149-61114158promoter 内 3708-3717 bp - 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 61114442-61115851(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTG
SmilChr02G004523 Chr02 NC_080388.1:67806849-67806858promoter 内 3543-3552 bp + 449 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 67804210-67806400(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTG
SmilChr01G002907 Chr01 NC_080387.1:47790896-47790905promoter 内 2659-2668 bp + 1333 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 47792238-47793432(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAACGT
SmilChr02G000239 Chr02 NC_080388.1:3101801-3101810promoter 内 2005-2014 bp - 1987 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 3099708-3099814(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGCT
SmilChr01G004754 Chr01 NC_080387.1:65742387-65742396promoter 内 2551-2560 bp - 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 65743837-65744217(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACGTTATCTG
SmilChr02G004105 Chr02 NC_080388.1:63350751-63350760promoter 内 2523-2532 bp + 1469 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 63352229-63361209(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGCT
SmilChr01G005491 Chr01 NC_080387.1:71835429-71835438promoter 内 2483-2492 bp + 1509 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 71833093-71833920(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTG
SmilChr02G005579 Chr02 NC_080388.1:75633402-75633411promoter 内 2422-2431 bp + 1570 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 75628944-75631832(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTG
SmilChr02G005443 Chr02 NC_080388.1:74804179-74804188promoter 内 1157-1166 bp + 2835 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 74807023-74811315(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGCT
SmilChr02G002825 Chr02 NC_080388.1:48351942-48351951promoter 内 550-559 bp + 3442 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 48355393-48357723(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGCT
SmilChr02G000904 Chr02 NC_080388.1:15602980-15602989promoter 内 515-524 bp + 3477 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 15591795-15599503(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACGTTATCTG
SmilChr02G002406 Chr02 NC_080388.1:41970049-41970058promoter 内 436-445 bp - 3556 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 41973614-42011446(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTG
SmilChr02G002928 Chr02 NC_080388.1:49680448-49680457promoter 内 378-387 bp + 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 49676011-49676834(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACGTTATCTG
SmilChr01G002099 Chr01 NC_080387.1:37034403-37034412promoter 内 374-383 bp + 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 37029265-37030785(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTG
SmilChr01G005159 Chr01 NC_080387.1:69350934-69350943promoter 内 175-184 bp + 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 69354760-69355445(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGCT
SmilChr02G002409 Chr02 NC_080388.1:42040748-42040757promoter 内 169-178 bp - 3823 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 42044580-42045591(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTG
SmilChr02G001191 Chr02 NC_080388.1:21832882-21832891promoter 内 3-12 bp + 3989 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 21836880-21838824(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAACGT
SmilChr01G004486 Chr01 NC_080387.1:62991480-62991489promoter 内 3535-3544 bp - 457 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 62987204-62991023(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGCT
SmilChr02G002814 Chr02 NC_080388.1:48195651-48195660promoter 内 3426-3435 bp + 566 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 48196226-48197047(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGCT
SmilChr02G002677 Chr02 NC_080388.1:46352340-46352349promoter 内 3403-3412 bp + 589 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 46349234-46351751(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTG
SmilChr01G003600 Chr01 NC_080387.1:54563293-54563302promoter 内 3383-3392 bp - 609 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 54563911-54565456(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTG
SmilChr01G004536 Chr01 NC_080387.1:63519477-63519486promoter 内 3010-3019 bp - 982 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 63520468-63524011(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTG
SmilChr03G000781 Chr03 NC_080389.1:8900909-8900918promoter 内 2672-2681 bp + 1320 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 8891005-8899589(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTG
SmilChr01G003921 Chr01 NC_080387.1:57466679-57466688promoter 内 2568-2577 bp + 1424 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 57468112-57474680(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGCT
SmilChr02G001189 Chr02 NC_080388.1:21832882-21832891promoter 内 1999-2008 bp + 1993 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 21827397-21830889(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACGTTATCTG
SmilChr01G004022 Chr01 NC_080387.1:58630131-58630140promoter 内 1928-1937 bp - 2064 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 58632204-58636130(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTG
SmilChr02G002616 Chr02 NC_080388.1:45391661-45391670promoter 内 1912-1921 bp - 2080 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 45393750-45408835(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTG
SmilChr01G002100 Chr01 NC_080387.1:37037089-37037098promoter 内 1773-1782 bp - 2219 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 37033679-37034870(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAACGT
SmilChr03G000863 Chr03 NC_080389.1:9835244-9835253promoter 内 1770-1779 bp + 2222 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 9837475-9839163(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGCT
SmilChr01G005445 Chr01 NC_080387.1:71546894-71546903promoter 内 1739-1748 bp - 2253 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71539560-71544641(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGCT
SmilChr01G005622 Chr01 NC_080387.1:72714554-72714563promoter 内 1668-1677 bp + 2324 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 72708889-72712230(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACGTTATCTG
SmilChr02G001358 Chr02 NC_080388.1:25405862-25405871promoter 内 1599-1608 bp - 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 25400788-25403469(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAACGT
SmilChr01G003353 Chr01 NC_080387.1:52280474-52280483promoter 内 1394-1403 bp + 2598 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 52283081-52286271(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGCT
SmilChr01G001848 Chr01 NC_080387.1:33417696-33417705promoter 内 1390-1399 bp - 2602 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 33420307-33422898(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTG
SmilChr02G002032 Chr02 NC_080388.1:36618055-36618064promoter 内 1266-1275 bp - 2726 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 36620790-36622199(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACGTTATCTG
SmilChr01G005061 Chr01 NC_080387.1:68524156-68524165promoter 内 1156-1165 bp + 2836 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 68527001-68528110(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGCT