转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 73 / 149 下载 TSV

上一页 73 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G001110 Chr04 NC_080390.1:15936395-15936405promoter 内 1329-1339 bp - 2662 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 15929849-15933733(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAGGCTGTCA
SmilChr07G001208 Chr07 NC_080393.1:9233829-9233839promoter 内 1307-1317 bp + 2684 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 9224097-9231145(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAC
SmilChr02G003347 Chr02 NC_080388.1:54679549-54679559promoter 内 1299-1309 bp - 2692 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 54682251-54684804(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG
SmilChr04G001053 Chr04 NC_080390.1:14995070-14995080promoter 内 1299-1309 bp + 2692 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 14997772-15001653(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAGGCTGTCA
SmilChr05G002660 Chr05 NC_080391.1:30114473-30114483promoter 内 1293-1303 bp + 2698 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 30109115-30111775(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG
SmilChr01G005705 Chr01 NC_080387.1:73282591-73282601promoter 内 1117-1127 bp + 2874 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 73285475-73291615(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCG
SmilChr07G002608 Chr07 NC_080393.1:25085910-25085920promoter 内 1102-1112 bp - 2889 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 25077373-25083021(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCG
SmilChr07G001061 Chr07 NC_080393.1:7815365-7815375promoter 内 1089-1099 bp + 2902 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 7818277-7819189(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr04G003356 Chr04 NC_080390.1:50155469-50155479promoter 内 1086-1096 bp + 2905 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 50158384-50167188(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCG
SmilChr04G000027 Chr04 NC_080390.1:272776-272786promoter 内 1077-1087 bp + 2914 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 275700-279476(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAGGCTGTCA
SmilChr03G003977 Chr03 NC_080389.1:58793065-58793075promoter 内 1056-1066 bp + 2935 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 58788338-58790130(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAG
SmilChr02G003345 Chr02 NC_080388.1:54679549-54679559promoter 内 1015-1025 bp - 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 54672454-54676573(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAGGCTGTCA
SmilChr04G003208 Chr04 NC_080390.1:48933326-48933336promoter 内 999-1009 bp + 2992 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 48936328-48941246(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCT
SmilChr06G001681 Chr06 NC_080392.1:19070189-19070199promoter 内 986-996 bp + 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 19073204-19074525(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAGGCTGTCA
SmilChr02G000079 Chr02 NC_080388.1:1039195-1039205promoter 内 890-900 bp + 3101 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 1032482-1036094(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGG
SmilChr05G000066 Chr05 NC_080391.1:327730-327740promoter 内 890-900 bp - 3101 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 323560-324629(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCG
SmilChr03G004212 Chr03 NC_080389.1:60721441-60721451promoter 内 883-893 bp + 3108 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 60715972-60718333(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTC
SmilChr03G000442 Chr03 NC_080389.1:4752307-4752317promoter 内 833-843 bp - 3158 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 4748217-4749149(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCA
SmilChr05G000240 Chr05 NC_080391.1:1834918-1834928promoter 内 817-827 bp - 3174 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 1838102-1840714(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGT
SmilChr04G000941 Chr04 NC_080390.1:12410321-12410331promoter 内 755-765 bp + 3236 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 12405617-12407085(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr05G003035 Chr05 NC_080391.1:38048842-38048852promoter 内 754-764 bp + 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 38042036-38045605(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG
SmilChr05G002132 Chr05 NC_080391.1:22412389-22412399promoter 内 752-762 bp + 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 22415638-22421688(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCG
SmilChr06G003226 Chr06 NC_080392.1:45009279-45009289promoter 内 744-754 bp - 3247 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 45012536-45016027(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGG
SmilChr04G002020 Chr04 NC_080390.1:32768771-32768781promoter 内 732-742 bp + 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 32772040-32773361(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAGGCTGTCA
SmilChr01G003172 Chr01 NC_080387.1:50531317-50531327promoter 内 654-664 bp - 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 50522332-50527980(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCA
SmilChr07G002692 Chr07 NC_080393.1:26256035-26256045promoter 内 613-623 bp - 3378 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 26259423-26264419(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTC
SmilChr01G005155 Chr01 NC_080387.1:69321213-69321223promoter 内 581-591 bp + 3410 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 69324633-69326962(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAGGCTGTCA
SmilChr01G000769 Chr01 NC_080387.1:16819472-16819482promoter 内 550-560 bp - 3441 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 16822923-16823270(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGG
SmilChr05G000058 Chr05 NC_080391.1:270220-270230promoter 内 543-553 bp - 3448 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 273678-276275(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGT
SmilChr03G000262 Chr03 NC_080389.1:3054401-3054411promoter 内 530-540 bp - 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 3049996-3050940(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAGGCTGTCA
SmilChr04G000634 Chr04 NC_080390.1:7208858-7208868promoter 内 514-524 bp - 3477 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 7202489-7205381(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCG
SmilChr07G002169 Chr07 NC_080393.1:19872047-19872057promoter 内 501-511 bp + 3490 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 19866630-19868557(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr06G002315 Chr06 NC_080392.1:33414883-33414893promoter 内 499-509 bp - 3492 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 33408187-33411391(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCA
SmilChr03G000640 Chr03 NC_080389.1:7050250-7050260promoter 内 481-491 bp + 3510 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 7043582-7046740(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG
SmilChr01G000137 Chr01 NC_080387.1:2306915-2306925promoter 内 414-424 bp + 3577 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 2303232-2303338(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGG
SmilChr05G002106 Chr05 NC_080391.1:22071220-22071230promoter 内 386-396 bp + 3605 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 22065041-22067615(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr01G003989 Chr01 NC_080387.1:58310557-58310567promoter 内 351-361 bp - 3640 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 58314207-58315187(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGG
SmilChr01G003078 Chr01 NC_080387.1:49606989-49606999promoter 内 345-355 bp - 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 49610645-49613660(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG
SmilChr02G002867 Chr02 NC_080388.1:48847765-48847775promoter 内 342-352 bp + 3649 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 48826093-48844116(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGG
SmilChr04G003655 Chr04 NC_080390.1:53030210-53030220promoter 内 332-342 bp - 3659 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 53033879-53036528(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGT
SmilChr03G001383 Chr03 NC_080389.1:16350335-16350345promoter 内 257-267 bp - 3734 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 16354079-16356884(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr02G003147 Chr02 NC_080388.1:52489361-52489371promoter 内 209-219 bp + 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 52483738-52485579(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAC
SmilChr04G000999 Chr04 NC_080390.1:13844555-13844565promoter 内 183-193 bp - 3808 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 13848373-13849597(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr01G001224 Chr01 NC_080387.1:24529378-24529388promoter 内 161-171 bp - 3830 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 24524688-24525548(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCG
SmilChr03G003887 Chr03 NC_080389.1:57957737-57957747promoter 内 130-140 bp - 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 57952358-57953876(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCA
SmilChr05G002309 Chr05 NC_080391.1:24939892-24939902promoter 内 118-128 bp + 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 24933878-24936019(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG
SmilChr05G001936 Chr05 NC_080391.1:19701833-19701843promoter 内 109-119 bp + 3882 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 19705725-19708507(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCT
SmilChr04G000025 Chr04 NC_080390.1:272776-272786promoter 内 101-111 bp + 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 264758-268886(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG
SmilChr01G002998 Chr01 NC_080387.1:48933316-48933326promoter 内 85-95 bp - 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 48927161-48929410(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCA
SmilChr02G003219 Chr02 NC_080388.1:53362069-53362079promoter 内 57-67 bp + 3934 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 53366013-53373533(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCG