转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004392; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022653-RA_Salv SmilChr05G004392 WRKY XP_057811204.1 MP00506 AAAAGTCAACGAC

可能结合的靶基因

9818 个结合位点 7173 个候选靶基因 第 76 / 144 下载 TSV

上一页 76 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000111 Chr02 NC_080388.1:1404493-1404505promoter 内 1210-1222 bp - 2779 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 1407284-1409535(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGAGTTGACTATT
SmilChr03G000365 Chr03 NC_080389.1:4087591-4087603promoter 内 1184-1196 bp + 2805 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 4083602-4084786(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TATGTTGACTATT
SmilChr01G004705 Chr01 NC_080387.1:65161890-65161902promoter 内 1161-1173 bp - 2828 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 65156414-65159062(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGAAGTCAATGAC
SmilChr01G004706 Chr01 NC_080387.1:65161890-65161902promoter 内 1149-1161 bp - 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 65164742-65166444(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTCATTGACTTCT
SmilChr03G004472 Chr03 NC_080389.1:62818630-62818642promoter 内 1072-1084 bp + 2917 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 62821559-62829024(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AATAGTCAACATA
SmilChr01G002762 Chr01 NC_080387.1:46024555-46024567promoter 内 1064-1076 bp + 2925 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 46027492-46030826(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAAACTC
SmilChr02G001513 Chr02 NC_080388.1:28216111-28216123promoter 内 966-978 bp - 3023 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 28219146-28222828(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGCCTTGACTTTT
SmilChr02G001263 Chr02 NC_080388.1:23133736-23133748promoter 内 838-850 bp - 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 23136899-23137839(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGAGTTGACTTCC
SmilChr03G002860 Chr03 NC_080389.1:45204013-45204025promoter 内 817-829 bp + 3172 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 45197546-45200841(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGCATTGACTTTA
SmilChr02G001040 Chr02 NC_080388.1:18486543-18486555promoter 内 708-720 bp + 3281 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 18489836-18489909(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TTAGGTCAACGTA
SmilChr02G003381 Chr02 NC_080388.1:54924385-54924397promoter 内 699-711 bp - 3290 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 54927687-54930592(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGAGTTGACTATT
SmilChr01G003080 Chr01 NC_080387.1:49640820-49640832promoter 内 585-597 bp - 3404 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 49644236-49647282(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CATGTTGACTTCG
SmilChr01G004216 Chr01 NC_080387.1:60567457-60567469promoter 内 573-585 bp - 3416 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 60562315-60564041(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGTAGTCAACAGC
SmilChr01G005361 Chr01 NC_080387.1:70845799-70845811promoter 内 509-521 bp + 3480 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 70840324-70842319(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATTGTTGACTATG
SmilChr02G004740 Chr02 NC_080388.1:69623458-69623470promoter 内 500-512 bp + 3489 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 69619134-69619969(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGGTTTGACTTTT
SmilChr03G002334 Chr03 NC_080389.1:36822807-36822819promoter 内 471-483 bp + 3518 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 36817041-36819289(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGCCTTGACTTTT
SmilChr04G001092 Chr04 NC_080390.1:15618514-15618526promoter 内 470-482 bp + 3519 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 15622045-15622702(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCAGTCAACGTG
SmilChr01G001672 Chr01 NC_080387.1:30845743-30845755promoter 内 437-449 bp + 3552 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 30849307-30850327(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCAAGTCAACCAA
SmilChr01G003320 Chr01 NC_080387.1:51907072-51907084promoter 内 401-413 bp - 3588 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 51910672-51913740(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGCATTGACTTTA
SmilChr02G004455 Chr02 NC_080388.1:66953050-66953062promoter 内 371-383 bp - 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 66940716-66949432(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAATGGA
SmilChr02G002451 Chr02 NC_080388.1:42756283-42756295promoter 内 282-294 bp - 3707 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 42760002-42761349(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCATTGACTTTA
SmilChr03G001036 Chr03 NC_080389.1:12060078-12060090promoter 内 265-277 bp + 3724 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 12055420-12056354(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCATTGACTTTA
SmilChr01G001928 Chr01 NC_080387.1:34455078-34455090promoter 内 261-273 bp + 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 34449221-34451350(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGCATTGACTTTA
SmilChr03G001758 Chr03 NC_080389.1:23939628-23939640promoter 内 183-195 bp - 3806 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 23931409-23935822(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACAGTCAACACA
SmilChr03G002409 Chr03 NC_080389.1:38275006-38275018promoter 内 173-185 bp + 3816 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 38278834-38280876(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAGAGTCAACACA
SmilChr02G005532 Chr02 NC_080388.1:75373756-75373768promoter 内 170-182 bp - 3819 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 75367749-75369937(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAATGC
SmilChr02G001265 Chr02 NC_080388.1:23216755-23216767promoter 内 166-178 bp - 3823 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 23212039-23212932(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAGAGTCAACACA
SmilChr02G000865 Chr02 NC_080388.1:14899808-14899820promoter 内 160-172 bp + 3829 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 14903649-14904287(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAACCA
SmilChr01G005577 Chr01 NC_080387.1:72500058-72500070promoter 内 156-168 bp + 3833 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 72503903-72505447(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCAGTCAACGCA
SmilChr02G001700 Chr02 NC_080388.1:31318719-31318731promoter 内 59-71 bp + 3930 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 31322661-31326472(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGAAGTCAAAGTG
SmilChr03G002819 Chr03 NC_080389.1:44664021-44664033promoter 内 2424-2436 bp - 1565 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 4 44659604-44662456(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAACTTT
SmilChr03G004441 Chr03 NC_080389.1:62553261-62553273promoter 内 3547-3559 bp - 442 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 3 62553715-62584049(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATCTTTGACTTGT
SmilChr03G001137 Chr03 NC_080389.1:13093703-13093715promoter 内 1947-1959 bp + 2042 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 3 13095757-13096290(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTTGGTCAACGGT
SmilChr02G004191 Chr02 NC_080388.1:64230648-64230660promoter 内 957-969 bp + 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 3 64233692-64234493(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCAAGTCAACAAC
SmilChr01G002024 Chr01 NC_080387.1:35795045-35795057promoter 内 3922-3934 bp + 67 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 35793992-35794978(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGCATTGACTTAT
SmilChr03G002957 Chr03 NC_080389.1:46314312-46314324promoter 内 3910-3922 bp + 79 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 46312661-46314233(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AATGTTGACTTGT
SmilChr03G001884 Chr03 NC_080389.1:26244434-26244446promoter 内 3802-3814 bp + 187 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 26243055-26244247(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTTGTTGACTTGA
SmilChr03G001280 Chr03 NC_080389.1:14985393-14985405promoter 内 3779-3791 bp - 210 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 14981267-14985183(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAAGGTC
SmilChr01G004602 Chr01 NC_080387.1:64005738-64005750promoter 内 3776-3788 bp + 213 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 64005963-64007353(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TACAGTCAACCAC
SmilChr01G005258 Chr01 NC_080387.1:70075021-70075033promoter 内 3679-3691 bp + 310 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 70075343-70078703(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAACTTT
SmilChr01G002633 Chr01 NC_080387.1:44621137-44621149promoter 内 3590-3602 bp + 399 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 44619423-44620738(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATCTTTGACTTCC
SmilChr03G003051 Chr03 NC_080389.1:47412185-47412197promoter 内 3345-3357 bp + 644 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 47410249-47411541(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCGTTGACCCCC
SmilChr02G000888 Chr02 NC_080388.1:15294263-15294275promoter 内 3064-3076 bp - 925 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 15289653-15293338(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGAAGTCAAAGAT
SmilChr04G000547 Chr04 NC_080390.1:6084873-6084885promoter 内 3040-3052 bp - 949 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 6085834-6087763(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAGTTGACTTTA
SmilChr01G003083 Chr01 NC_080387.1:49670119-49670131promoter 内 2681-2693 bp - 1308 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 49665340-49668811(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAACTAA
SmilChr02G002067 Chr02 NC_080388.1:37221996-37222008promoter 内 2625-2637 bp + 1364 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 37220526-37220632(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATGGTTGACTGTG
SmilChr03G003464 Chr03 NC_080389.1:53052449-53052461promoter 内 2614-2626 bp + 1375 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 53053836-53056129(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCAAGTCAACAAC
SmilChr01G001068 Chr01 NC_080387.1:22027557-22027569promoter 内 2570-2582 bp + 1419 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 22024948-22026138(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGCTTTGACTTAG
SmilChr02G001129 Chr02 NC_080388.1:20418307-20418319promoter 内 2504-2516 bp + 1485 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 20416119-20416822(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGCTTTGACTTAG
SmilChr01G003884 Chr01 NC_080387.1:57162710-57162722promoter 内 2500-2512 bp - 1489 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 57164211-57166340(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCTGTTGACTTAC