转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 85 / 136 下载 TSV

上一页 85 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G001465 Chr08 NC_080394.1:11803994-11804004promoter 内 2592-2602 bp + 1399 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11795788-11802595(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr02G004577 Chr02 NC_080388.1:68274330-68274340promoter 内 2420-2430 bp + 1571 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 68262909-68272759(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGG
SmilChr03G003732 Chr03 NC_080389.1:56354176-56354186promoter 内 2369-2379 bp - 1622 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 56355808-56360808(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGACCT
SmilChr07G004388 Chr07 NC_080393.1:56467090-56467100promoter 内 2315-2325 bp - 1676 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 56464152-56465414(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr08G003046 Chr08 NC_080394.1:30611133-30611143promoter 内 2305-2315 bp + 1686 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 30612829-30613604(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr01G005732 Chr01 NC_080387.1:73456120-73456130promoter 内 2227-2237 bp + 1764 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 73457894-73458595(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr08G004375 Chr08 NC_080394.1:53519280-53519290promoter 内 2198-2208 bp + 1793 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 53514673-53517487(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr06G001020 Chr06 NC_080392.1:10102559-10102569promoter 内 2177-2187 bp + 1814 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 10089281-10100745(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr05G002886 Chr05 NC_080391.1:34571682-34571692promoter 内 2168-2178 bp - 1823 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 34566940-34569859(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGAG
SmilChr05G002074 Chr05 NC_080391.1:21650633-21650643promoter 内 2134-2144 bp + 1857 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 21641784-21648776(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGG
SmilChr04G000942 Chr04 NC_080390.1:12477412-12477422promoter 内 2111-2121 bp - 1880 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 12479302-12480618(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGACCT
SmilChr05G000527 Chr05 NC_080391.1:4041732-4041742promoter 内 2092-2102 bp - 1899 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4039003-4039833(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr05G000530 Chr05 NC_080391.1:4068093-4068103promoter 内 2089-2099 bp - 1902 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4065395-4066191(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr05G001299 Chr05 NC_080391.1:11211121-11211131promoter 内 1951-1961 bp + 2040 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11213171-11220589(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr07G002182 Chr07 NC_080393.1:20035819-20035829promoter 内 1931-1941 bp + 2060 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 20037889-20042123(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr06G000561 Chr06 NC_080392.1:4788720-4788730promoter 内 1885-1895 bp + 2106 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4783392-4786614(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGG
SmilChr02G002917 Chr02 NC_080388.1:49473634-49473644promoter 内 1736-1746 bp + 2255 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 49475899-49478067(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGGG
SmilChr06G000139 Chr06 NC_080392.1:990781-990791promoter 内 1713-1723 bp + 2278 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 988162-988503(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr08G003035 Chr08 NC_080394.1:30527149-30527159promoter 内 1610-1620 bp - 2381 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 30522151-30524768(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr03G000111 Chr03 NC_080389.1:1226589-1226599promoter 内 1570-1580 bp - 2421 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 1229020-1261784(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr04G000460 Chr04 NC_080390.1:4903869-4903879promoter 内 1538-1548 bp + 2453 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4896849-4901416(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr02G000378 Chr02 NC_080388.1:4761486-4761496promoter 内 1529-1539 bp - 2462 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4763958-4767482(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGT
SmilChr04G002905 Chr04 NC_080390.1:45327100-45327110promoter 内 1385-1395 bp + 2606 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 45323556-45324494(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGAT
SmilChr05G000525 Chr05 NC_080391.1:4035354-4035364promoter 内 1371-1381 bp - 2620 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4031826-4032734(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr02G001468 Chr02 NC_080388.1:27411943-27411953promoter 内 1346-1356 bp + 2645 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 27407029-27409298(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGG
SmilChr08G004422 Chr08 NC_080394.1:53930032-53930042promoter 内 1320-1330 bp + 2671 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 53923675-53927361(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGG
SmilChr01G004667 Chr01 NC_080387.1:64791583-64791593promoter 内 1209-1219 bp - 2782 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 64786058-64788801(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGGG
SmilChr01G000282 Chr01 NC_080387.1:5536071-5536081promoter 内 1188-1198 bp + 2803 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 5531763-5533268(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGAT
SmilChr05G001967 Chr05 NC_080391.1:20236077-20236087promoter 内 971-981 bp - 3020 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 20229411-20233057(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGAG
SmilChr08G000736 Chr08 NC_080394.1:5461081-5461091promoter 内 823-833 bp - 3168 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 5450491-5457913(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGGG
SmilChr06G002088 Chr06 NC_080392.1:27588085-27588095promoter 内 735-745 bp + 3256 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 27591351-27591989(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTTCAGCGCC
SmilChr08G000507 Chr08 NC_080394.1:3704018-3704028promoter 内 649-659 bp - 3342 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 3707370-3709422(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGG
SmilChr01G004219 Chr01 NC_080387.1:60581641-60581651promoter 内 629-639 bp - 3362 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 60576167-60578279(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTTCAGCGCC
SmilChr01G006022 Chr01 NC_080387.1:75809156-75809166promoter 内 527-537 bp + 3464 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 75800542-75805692(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr08G002657 Chr08 NC_080394.1:26038168-26038178promoter 内 520-530 bp - 3471 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 26041649-26042323(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGAT
SmilChr07G003600 Chr07 NC_080393.1:42078339-42078349promoter 内 462-472 bp - 3529 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 42073016-42074810(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTTCAGCGCC
SmilChr02G002446 Chr02 NC_080388.1:42692951-42692961promoter 内 370-380 bp - 3621 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 42688073-42689330(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGAG
SmilChr07G004593 Chr07 NC_080393.1:58732780-58732790promoter 内 357-367 bp + 3634 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 58727250-58729146(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr08G002139 Chr08 NC_080394.1:19263264-19263274promoter 内 324-334 bp - 3667 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 19257741-19259597(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGGG
SmilChr08G004376 Chr08 NC_080394.1:53519280-53519290promoter 内 283-293 bp + 3708 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 53522998-53525731(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr03G000046 Chr03 NC_080389.1:503220-503230promoter 内 85-95 bp - 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 497834-499314(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCA
SmilChr04G002709 Chr04 NC_080390.1:42719927-42719937promoter 内 68-78 bp + 3923 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 42713807-42716004(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGT
SmilChr01G002627 Chr01 NC_080387.1:44548479-44548489promoter 内 66-76 bp - 3925 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 44552414-44559077(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCT
SmilChr08G004952 Chr08 NC_080394.1:58383037-58383047promoter 内 59-69 bp - 3932 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 58377994-58379105(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCA
SmilChr01G000778 Chr01 NC_080387.1:16977613-16977623promoter 内 863-873 bp + 3128 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 5 16980751-16982877(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGCA
SmilChr03G001750 Chr03 NC_080389.1:23740882-23740892promoter 内 2615-2625 bp - 1376 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 4 23736896-23739506(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAA
SmilChr03G001973 Chr03 NC_080389.1:28455417-28455427promoter 内 1737-1747 bp + 2254 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 4 28457681-28461400(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGCA
SmilChr01G001509 Chr01 NC_080387.1:28924657-28924667promoter 内 2875-2885 bp + 1116 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 28925783-28929363(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGCA
SmilChr07G003171 Chr07 NC_080393.1:33757360-33757370promoter 内 1491-1501 bp - 2500 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 33759870-33762067(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGAC
SmilChr06G002663 Chr06 NC_080392.1:38470520-38470530promoter 内 3985-3995 bp - 6 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 38469561-38470514(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGGC