Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G006187; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027306-RA_Salv SmilChr01G006187 GRAS XP_057798078.1 MP00611 AAGAAAAAGACAAAAAAAAA

可能结合的靶基因

9807 个结合位点 6232 个候选靶基因 第 89 / 125 下载 TSV

上一页 89 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004479 Chr02 NC_080388.1:67218604-67218623promoter 内 1653-1672 bp + 2329 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 67220952-67222163(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAGGAAAAGAGAGGG
SmilChr02G000150 Chr02 NC_080388.1:1985921-1985940promoter 内 1531-1550 bp + 2451 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 1988391-1988951(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAGGAGGAAACCATG
SmilChr01G002983 Chr01 NC_080387.1:48757784-48757803promoter 内 1447-1466 bp - 2535 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 48760338-48763144(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CGATGCTTTGTCTTATTCTC
SmilChr01G004019 Chr01 NC_080387.1:58587321-58587340promoter 内 1426-1445 bp + 2556 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 58578309-58584765(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ATTTTTTTTGTTTGTTTCCG
SmilChr02G003471 Chr02 NC_080388.1:56014823-56014842promoter 内 1408-1427 bp - 2574 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 56017416-56023072(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTTCTTCTTTTTTTCTT
SmilChr01G006009 Chr01 NC_080387.1:75652798-75652817promoter 内 1363-1382 bp + 2619 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 75647259-75650179(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TGTTTTTTTGTTTTTTTTTT
SmilChr01G001246 Chr01 NC_080387.1:24976192-24976211promoter 内 1345-1364 bp + 2637 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 24971229-24973555(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTGTTTTTTGTTTTTCTTTC
SmilChr02G000579 Chr02 NC_080388.1:8330174-8330193promoter 内 1323-1342 bp - 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 8321882-8327515(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GATAAGACGACAAAACAGGT
SmilChr02G005455 Chr02 NC_080388.1:74876433-74876452promoter 内 1312-1331 bp - 2670 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 74879122-74883586(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTCTTTTCTTTTC
SmilChr02G000313 Chr02 NC_080388.1:3946866-3946885promoter 内 1259-1278 bp + 2723 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 3942894-3944143(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTGTTTTTTCTTTTTGTT
SmilChr01G004146 Chr01 NC_080387.1:59981105-59981124promoter 内 1225-1244 bp - 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 59983881-59989552(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTGACTTTGTCTTTAAGTG
SmilChr02G002397 Chr02 NC_080388.1:41861777-41861796promoter 内 1216-1235 bp - 2766 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 41864562-41864632(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTCTTTTCTTTTC
SmilChr02G004509 Chr02 NC_080388.1:67613612-67613631promoter 内 1190-1209 bp + 2792 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 67609877-67610820(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGTTTTTTTTTCTTTTTCTT
SmilChr02G004081 Chr02 NC_080388.1:63089516-63089535promoter 内 1145-1164 bp - 2837 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 63092372-63096688(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTCCAGCCTGTCTTTCTCTC
SmilChr01G000852 Chr01 NC_080387.1:18405925-18405944promoter 内 1121-1140 bp - 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 18408805-18412146(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GCTTTTTTTTTCCCCTTCTT
SmilChr02G000098 Chr02 NC_080388.1:1276558-1276577promoter 内 1113-1132 bp + 2869 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 1271452-1273689(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGCCCTTTCGTCTTTTCGTT
SmilChr02G001462 Chr02 NC_080388.1:27319776-27319795promoter 内 1032-1051 bp - 2950 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 27322745-27323768(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTCCCTTGTTTTTTTCTA
SmilChr01G002694 Chr01 NC_080387.1:45193313-45193332promoter 内 857-876 bp + 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 45196457-45199085(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AACTAAATGACAAAAAAGGG
SmilChr01G002864 Chr01 NC_080387.1:47232597-47232616promoter 内 851-870 bp + 3131 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 47228093-47229466(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTCGATTTCCTCTTTTTCCT
SmilChr02G002033 Chr02 NC_080388.1:36619041-36619060promoter 内 828-847 bp - 3154 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 36622214-36622996(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTGTTTTTGTTTCTGTTTT
SmilChr02G003688 Chr02 NC_080388.1:58284101-58284120promoter 内 828-847 bp + 3154 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 58274625-58280947(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TATTTTTTTCTCCTTCTTTG
SmilChr02G005480 Chr02 NC_080388.1:75015646-75015665promoter 内 777-796 bp + 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 75009909-75012441(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTCTTTTTGTTTTGTTGTT
SmilChr02G000099 Chr02 NC_080388.1:1276558-1276577promoter 内 741-760 bp + 3241 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 1279818-1284135(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AACGAAAAGACGAAAGGGCT
SmilChr01G000081 Chr01 NC_080387.1:1520018-1520037promoter 内 710-729 bp - 3272 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 1513404-1516746(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAGAAAAGAAAAAAAGA
SmilChr01G003787 Chr01 NC_080387.1:56266358-56266377promoter 内 702-721 bp + 3280 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 56262231-56263078(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CGTTGTTTTGTCTGTGTGCG
SmilChr03G002631 Chr03 NC_080389.1:41782118-41782137promoter 内 659-678 bp - 3323 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 41777927-41778795(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CGAAAAAAGAGGGAGGAAAG
SmilChr02G003267 Chr02 NC_080388.1:53933511-53933530promoter 内 633-652 bp + 3349 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 53936879-53938637(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAAACAAAAATAAA
SmilChr01G000716 Chr01 NC_080387.1:16037641-16037660promoter 内 608-627 bp + 3374 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 16041034-16043508(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAAAAGAAAAGAAAAAAAAA
SmilChr02G005056 Chr02 NC_080388.1:72265445-72265464promoter 内 578-597 bp + 3404 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 72268868-72276167(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AATAAAAAGAGAAAGGGGCA
SmilChr01G004081 Chr01 NC_080387.1:59225419-59225438promoter 内 543-562 bp + 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 59220331-59221980(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CATCTTTTTGTCTCTGTGTA
SmilChr01G004470 Chr01 NC_080387.1:62797627-62797646promoter 内 523-542 bp - 3459 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 62792722-62794168(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAGGAAGAAGAA
SmilChr02G004403 Chr02 NC_080388.1:66358661-66358680promoter 内 361-380 bp + 3621 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 66362301-66364636(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGGAAAATGACAAAATACAG
SmilChr02G004066 Chr02 NC_080388.1:62951412-62951431promoter 内 283-302 bp + 3699 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 62945020-62947713(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AACTCCTTTGTCTCCTCCGG
SmilChr01G005815 Chr01 NC_080387.1:74138044-74138063promoter 内 151-170 bp + 3831 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 74141894-74144092(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAGAGAAAGACAGGCTGGAG
SmilChr01G005857 Chr01 NC_080387.1:74510572-74510591promoter 内 134-153 bp + 3848 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 74497938-74506724(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTGTTCTTTGTCTTCCATTG
SmilChr01G004306 Chr01 NC_080387.1:61258208-61258227promoter 内 29-48 bp - 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 61252932-61254255(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAACCAGACAAAAAAGAA
SmilChr02G002702 Chr02 NC_080388.1:46866641-46866660promoter 内 11-30 bp + 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 46859463-46862670(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTTTTCTTTCGCCTTTTCTT
SmilChr01G003024 Chr01 NC_080387.1:49300416-49300435promoter 内 479-498 bp - 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 5 49291554-49296913(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGGGAAAAAAGAAAAAAAAA
SmilChr03G001068 Chr03 NC_080389.1:12385322-12385341promoter 内 2156-2175 bp + 1826 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 4 12387167-12387756(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAAAAAAAAAAG
SmilChr03G001017 Chr03 NC_080389.1:11704434-11704453promoter 内 959-978 bp + 3023 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 4 11707476-11708342(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAGAAAGAAAAAAAAAGA
SmilChr01G001545 Chr01 NC_080387.1:29448615-29448634promoter 内 3882-3901 bp - 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 3 29448734-29450543(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTTTTTCTTTTTTTTTT
SmilChr03G003215 Chr03 NC_080389.1:49795995-49796014promoter 内 2413-2432 bp - 1569 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 3 49791093-49794426(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAAAAAAAAAAG
SmilChr03G003314 Chr03 NC_080389.1:51376730-51376749promoter 内 2302-2321 bp - 1680 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 3 51372765-51375050(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAAAAAAAAAAG
SmilChr03G003216 Chr03 NC_080389.1:49795995-49796014promoter 内 1625-1644 bp - 2357 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 3 49798371-49799583(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTTTTTTTCTTTTTTTT
SmilChr02G003677 Chr02 NC_080388.1:58145632-58145651promoter 内 1245-1264 bp + 2737 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 3 58142824-58142895(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTTTTTTTCTTTTTTTT
SmilChr03G000934 Chr03 NC_080389.1:10651604-10651623promoter 内 1175-1194 bp - 2807 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 3 10647369-10648797(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAAAGAAAAAAAAG
SmilChr01G005020 Chr01 NC_080387.1:68193042-68193061promoter 内 1151-1170 bp + 2831 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 3 68185611-68190211(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTTTTTTTCTTTTTTTT
SmilChr02G000382 Chr02 NC_080388.1:4787357-4787376promoter 内 581-600 bp - 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 3 4780702-4783956(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAACAGAGAAAAAAAAT
SmilChr01G001268 Chr01 NC_080387.1:25352337-25352356promoter 内 407-426 bp - 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 3 25355931-25363173(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TATTTTTTTCTCTCTCCTTC
SmilChr02G004052 Chr02 NC_080388.1:62841022-62841041promoter 内 73-92 bp - 3909 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 3 62844950-62847799(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTTTTTTTCTTTTTTTT