Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001059; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00014491-RA_Salv SmilChr06G001059 Dof XP_057768449.1 MP00402 TTTTTTTTTTTTTTACTTTTT

可能结合的靶基因

9875 个结合位点 6278 个候选靶基因 第 9 / 126 下载 TSV

上一页 9 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005329 Chr02 NC_080388.1:74145290-74145310promoter 内 1939-1959 bp + 2042 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 74141865-74143248(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGAAAAAGGAAAAAAAA
SmilChr01G004377 Chr01 NC_080387.1:61968877-61968897promoter 内 1721-1741 bp + 2260 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 61971157-61977289(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTTCCTTTATTTTAACTTTTT
SmilChr01G002280 Chr01 NC_080387.1:39597666-39597686promoter 内 1615-1635 bp - 2366 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 39592366-39595300(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTCTCTTTCATTTTACTTTTT
SmilChr02G000352 Chr02 NC_080388.1:4528795-4528815promoter 内 1538-1558 bp + 2443 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 4531258-4532840(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTCTTTTTTTAACTTTTT
SmilChr02G000287 Chr02 NC_080388.1:3673374-3673394promoter 内 1519-1539 bp - 2462 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 3669304-3670912(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTCTTTTTTTAACTTTTT
SmilChr01G004050 Chr01 NC_080387.1:58958890-58958910promoter 内 1299-1319 bp + 2682 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 58955005-58956208(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAATAAAAAAAGAAG
SmilChr02G000730 Chr02 NC_080388.1:11838204-11838224promoter 内 692-712 bp + 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 11841513-11842947(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CATTTCTCTCTTCTACTTTTT
SmilChr01G003292 Chr01 NC_080387.1:51607088-51607108promoter 内 478-498 bp + 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 51610611-51610717(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CCTTTCCCTTGTCTACTTTTT
SmilChr01G005990 Chr01 NC_080387.1:75510775-75510795promoter 内 2969-2989 bp - 1012 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 75506859-75509763(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTCTTTTATTTTTTACTTTTC
SmilChr01G005059 Chr01 NC_080387.1:68497353-68497373promoter 内 741-761 bp + 3240 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 68500613-68523773(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TCCCACCTCCTTTTACTTTTT
SmilChr02G004566 Chr02 NC_080388.1:68183005-68183025promoter 内 3780-3800 bp - 201 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 68183226-68185283(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGTAAGAAAGAAAGAAC
SmilChr01G003810 Chr01 NC_080387.1:56477901-56477921promoter 内 3572-3592 bp + 409 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 56475330-56477492(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGTAGAAGAAAAAAATA
SmilChr02G004018 Chr02 NC_080388.1:62475563-62475583promoter 内 3066-3086 bp - 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 62476498-62479981(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGAAGAAAGGAAAAAAA
SmilChr01G004265 Chr01 NC_080387.1:60915019-60915039promoter 内 1852-1872 bp + 2129 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 60911850-60912890(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAAAAAAAGATAAAG
SmilChr01G001003 Chr01 NC_080387.1:21117366-21117386promoter 内 1065-1085 bp + 2916 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 21120302-21128904(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TATTTCTCTTTTCTACTTTTT
SmilChr01G004769 Chr01 NC_080387.1:65865189-65865209promoter 内 851-871 bp + 3130 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 65858151-65862059(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAAGAAAAGAAAATG
SmilChr01G004266 Chr01 NC_080387.1:60915019-60915039promoter 内 204-224 bp + 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 60918816-60919703(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTTTATCTTTTTTTACTTTTT
SmilChr01G002449 Chr01 NC_080387.1:42086768-42086788promoter 内 3477-3497 bp - 504 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 42081671-42086264(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TCCTTTCGATTTTTACTTTTT
SmilChr01G005468 Chr01 NC_080387.1:71671372-71671392promoter 内 3454-3474 bp - 527 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 71667769-71670845(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTTTTTATTTTTTTACTTTTT
SmilChr02G004186 Chr02 NC_080388.1:64189549-64189569promoter 内 2959-2979 bp + 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 64190591-64195426(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTCTTTTCAACTTTTG
SmilChr01G002519 Chr01 NC_080387.1:43149567-43149587promoter 内 811-831 bp - 3170 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 43152757-43154134(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGGGAAAAACAAAAAAA
SmilChr02G000499 Chr02 NC_080388.1:6870809-6870829promoter 内 698-718 bp + 3283 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 6874112-6877974(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTGATTTTTTTTTTACTTTTT
SmilChr01G004363 Chr01 NC_080387.1:61820334-61820354promoter 内 471-491 bp - 3510 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 61814118-61816824(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ACTCTTTCCTTTTTACTTTAT
SmilChr01G004832 Chr01 NC_080387.1:66453514-66453534promoter 内 1612-1632 bp - 2369 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 6 66455903-66457952(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGAAAAAAAAATAAA
SmilChr02G000590 Chr02 NC_080388.1:8461192-8461212promoter 内 3076-3096 bp - 905 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 8462117-8462620(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGAAGAGAAAGAGGA
SmilChr02G001145 Chr02 NC_080388.1:20837058-20837078promoter 内 958-978 bp + 3023 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 20831301-20834035(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGAAAAAAAAAAAAAAA
SmilChr01G000021 Chr01 NC_080387.1:398373-398393promoter 内 215-235 bp + 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 392106-394607(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAAAATGAAAGAGAA
SmilChr02G005390 Chr02 NC_080388.1:74526514-74526534promoter 内 3955-3975 bp - 26 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 74526560-74528656(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CAAAAGTAAAAGGGGGAAAAA
SmilChr02G003318 Chr02 NC_080388.1:54454727-54454747promoter 内 3668-3688 bp - 313 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 54453435-54454414(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTTTTTTTTTCTTTTC
SmilChr02G003371 Chr02 NC_080388.1:54838942-54838962promoter 内 3356-3376 bp + 625 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 54839587-54841481(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTCTCATCTTTTTTACTTTTT
SmilChr02G000914 Chr02 NC_080388.1:15870924-15870944promoter 内 1747-1767 bp - 2234 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 15850486-15868690(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTTTTTTTCTCTTTTT
SmilChr02G000915 Chr02 NC_080388.1:15870924-15870944promoter 内 1728-1748 bp - 2253 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 15852719-15868671(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTTTTTTTCTCTTTTT
SmilChr02G002649 Chr02 NC_080388.1:45898350-45898370promoter 内 1592-1612 bp + 2389 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 45900759-45903568(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTTTTTTTTTCTTTTC
SmilChr01G005164 Chr01 NC_080387.1:69418976-69418996promoter 内 1402-1422 bp - 2579 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 69421575-69426516(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGAAAAATAAGAGAA
SmilChr01G003906 Chr01 NC_080387.1:57348541-57348561promoter 内 1229-1249 bp - 2752 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 57351313-57354688(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGAAAAGTGAAAGGA
SmilChr01G003924 Chr01 NC_080387.1:57492687-57492707promoter 内 1212-1232 bp - 2769 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 57495476-57498897(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGAAAAGTGAAAGGA
SmilChr03G000130 Chr03 NC_080389.1:1422147-1422167promoter 内 1104-1124 bp + 2877 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 1418005-1419270(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAGAGAGAAGAGAAA
SmilChr02G002511 Chr02 NC_080388.1:43573960-43573980promoter 内 966-986 bp + 3015 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 43567218-43570945(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGAAAAAAAAAAAAAAA
SmilChr02G005391 Chr02 NC_080388.1:74526514-74526534promoter 内 694-714 bp - 3287 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 74529821-74531940(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CAAAAGTAAAAGGGGGAAAAA
SmilChr02G001183 Chr02 NC_080388.1:21736772-21736792promoter 内 551-571 bp + 3430 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 21740222-21749211(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ATTATTTTTTTTTTACTTTTT
SmilChr02G001939 Chr02 NC_080388.1:34834347-34834367promoter 内 373-393 bp + 3608 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 34837975-34841390(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTTTTTTTTTCTTTTC
SmilChr01G004831 Chr01 NC_080387.1:66453514-66453534promoter 内 49-69 bp - 3932 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 66440004-66449582(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTATTTTTTTTTCACTTTTT
SmilChr02G002512 Chr02 NC_080388.1:43573960-43573980promoter 内 3977-3997 bp + 4 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 43572007-43573956(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGAAAAAAAAAAAAAAA
SmilChr01G003230 Chr01 NC_080387.1:51077178-51077198promoter 内 3923-3943 bp + 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 51075306-51077120(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGCAAAAGCCAAAAAAA
SmilChr02G001528 Chr02 NC_080388.1:28476809-28476829promoter 内 3890-3910 bp + 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 28476920-28477391(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTTTCTTCTTTTCGACTTTTT
SmilChr01G003486 Chr01 NC_080387.1:53418301-53418321promoter 内 3809-3829 bp - 172 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 53416969-53418129(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CCCCCTGCCCTTTTACTTTTC
SmilChr01G000212 Chr01 NC_080387.1:3724665-3724685promoter 内 3552-3572 bp - 429 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 3725114-3727547(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGCCAAAAAAAAAAAAA
SmilChr02G002129 Chr02 NC_080388.1:38144442-38144462promoter 内 3418-3438 bp + 563 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 38142935-38143879(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGAAGAGAAAGAGGA
SmilChr01G002430 Chr01 NC_080387.1:41844059-41844079promoter 内 2827-2847 bp - 1154 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 41837718-41842905(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TCCTCTCTTCTGTAACTTTTT
SmilChr01G003485 Chr01 NC_080387.1:53418301-53418321promoter 内 2672-2692 bp - 1309 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 53414664-53416992(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CCCCCTGCCCTTTTACTTTTC