转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 94 / 143 下载 TSV

上一页 94 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000980 Chr03 NC_080389.1:11073988-11073999promoter 内 2717-2728 bp - 1273 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 11075272-11146287(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTT
SmilChr03G004098 Chr03 NC_080389.1:59858223-59858234promoter 内 2694-2705 bp - 1296 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 59859530-59869953(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC
SmilChr03G000855 Chr03 NC_080389.1:9772394-9772405promoter 内 2686-2697 bp - 1304 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 9768373-9771090(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAA
SmilChr03G000206 Chr03 NC_080389.1:2363036-2363047promoter 内 2680-2691 bp - 1310 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 2364357-2367604(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC
SmilChr07G002896 Chr07 NC_080393.1:29345216-29345227promoter 内 2668-2679 bp - 1322 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 29340027-29343894(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGTT
SmilChr03G003036 Chr03 NC_080389.1:47259040-47259051promoter 内 2667-2678 bp - 1323 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 47260374-47261035(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCAT
SmilChr05G001315 Chr05 NC_080391.1:11319493-11319504promoter 内 2636-2647 bp - 1354 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 11320858-11323001(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAGT
SmilChr02G002812 Chr02 NC_080388.1:48176969-48176980promoter 内 2605-2616 bp - 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 48178365-48180165(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCGT
SmilChr07G002529 Chr07 NC_080393.1:23955890-23955901promoter 内 2571-2582 bp + 1419 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 23957320-23959273(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTATT
SmilChr06G000510 Chr06 NC_080392.1:4240122-4240133promoter 内 2522-2533 bp + 1468 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 4233496-4238654(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTA
SmilChr07G001056 Chr07 NC_080393.1:7706279-7706290promoter 内 2519-2530 bp + 1471 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 7703301-7704808(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGCAGCTGTCAC
SmilChr07G003666 Chr07 NC_080393.1:43854358-43854369promoter 内 2438-2449 bp + 1552 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 43850136-43852806(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAACTGTCAA
SmilChr05G000029 Chr05 NC_080391.1:144644-144655promoter 内 2428-2439 bp + 1562 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 146217-147062(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAA
SmilChr03G000508 Chr03 NC_080389.1:5482172-5482183promoter 内 2424-2435 bp - 1566 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 5483749-5488480(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTT
SmilChr08G002612 Chr08 NC_080394.1:25479562-25479573promoter 内 2424-2435 bp + 1566 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 25481139-25483358(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAA
SmilChr01G002356 Chr01 NC_080387.1:40744749-40744760promoter 内 2407-2418 bp - 1583 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 40740704-40743166(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAA
SmilChr01G001492 Chr01 NC_080387.1:28730143-28730154promoter 内 2393-2404 bp + 1597 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 28731751-28735693(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCAG
SmilChr07G003793 Chr07 NC_080393.1:46647793-46647804promoter 内 2379-2390 bp - 1611 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 46644089-46646182(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAC
SmilChr01G003014 Chr01 NC_080387.1:49171079-49171090promoter 内 2316-2327 bp + 1674 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 49172764-49176736(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGCG
SmilChr04G001582 Chr04 NC_080390.1:26303909-26303920promoter 内 2290-2301 bp + 1700 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 26301584-26302209(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC
SmilChr03G000939 Chr03 NC_080389.1:10679072-10679083promoter 内 2243-2254 bp - 1747 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 10680830-10685763(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTT
SmilChr02G004257 Chr02 NC_080388.1:64781364-64781375promoter 内 2218-2229 bp + 1772 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 64783147-64783219(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAA
SmilChr08G000219 Chr08 NC_080394.1:1490956-1490967promoter 内 2193-2204 bp - 1797 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 1492764-1493609(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCAT
SmilChr08G001537 Chr08 NC_080394.1:12508020-12508031promoter 内 2179-2190 bp + 1811 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 12509842-12514562(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAC
SmilChr02G001168 Chr02 NC_080388.1:21446983-21446994promoter 内 2158-2169 bp - 1832 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 21441617-21445151(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAC
SmilChr02G004670 Chr02 NC_080388.1:69057855-69057866promoter 内 2147-2158 bp + 1843 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 69053031-69056012(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCAT
SmilChr01G003711 Chr01 NC_080387.1:55457222-55457233promoter 内 2121-2132 bp + 1869 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 55459102-55462477(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAC
SmilChr03G004088 Chr03 NC_080389.1:59781176-59781187promoter 内 2093-2104 bp - 1897 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 59775918-59779279(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAA
SmilChr05G003836 Chr05 NC_080391.1:51809966-51809977promoter 内 2056-2067 bp - 1934 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 51811911-51812653(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC
SmilChr05G004045 Chr05 NC_080391.1:54427111-54427122promoter 内 2056-2067 bp + 1934 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 54423744-54425177(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACACCTGTCAA
SmilChr06G002154 Chr06 NC_080392.1:29355267-29355278promoter 内 2046-2057 bp - 1944 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 29357222-29360226(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC
SmilChr07G003161 Chr07 NC_080393.1:33588371-33588382promoter 内 1931-1942 bp + 2059 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 33578182-33586312(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC
SmilChr06G003036 Chr06 NC_080392.1:43218126-43218137promoter 内 1924-1935 bp + 2066 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 43210346-43216060(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC
SmilChr08G002133 Chr08 NC_080394.1:19228209-19228220promoter 内 1924-1935 bp + 2066 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 19230286-19232979(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTAAT
SmilChr07G004385 Chr07 NC_080393.1:56383817-56383828promoter 内 1923-1934 bp + 2067 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 56380831-56381750(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTT
SmilChr03G002435 Chr03 NC_080389.1:38666925-38666936promoter 内 1912-1923 bp + 2078 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 38669014-38669828(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGTT
SmilChr06G000511 Chr06 NC_080392.1:4240122-4240133promoter 内 1908-1919 bp + 2082 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 4242215-4242634(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCAA
SmilChr03G003771 Chr03 NC_080389.1:56849320-56849331promoter 内 1866-1877 bp - 2124 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 56851455-56857112(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCAT
SmilChr06G000870 Chr06 NC_080392.1:8235553-8235564promoter 内 1842-1853 bp - 2148 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 8230821-8233405(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTATT
SmilChr03G003777 Chr03 NC_080389.1:56920442-56920453promoter 内 1819-1830 bp + 2171 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 56922624-56925507(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCTT
SmilChr03G000783 Chr03 NC_080389.1:8932946-8932957promoter 内 1788-1799 bp + 2202 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 8926994-8930744(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTT
SmilChr03G004012 Chr03 NC_080389.1:59104332-59104343promoter 内 1685-1696 bp - 2305 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 59106648-59109420(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCGA
SmilChr05G001562 Chr05 NC_080391.1:14305179-14305190promoter 内 1584-1595 bp + 2406 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 14300146-14302773(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAACTGTCAA
SmilChr06G002397 Chr06 NC_080392.1:34750010-34750021promoter 内 1522-1533 bp + 2468 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 34745009-34747542(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC
SmilChr06G001530 Chr06 NC_080392.1:16541738-16541749promoter 内 1508-1519 bp - 2482 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 16544231-16545318(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC
SmilChr03G000847 Chr03 NC_080389.1:9663612-9663623promoter 内 1474-1485 bp + 2516 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 9654315-9661096(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTT
SmilChr03G000482 Chr03 NC_080389.1:5133765-5133776promoter 内 1465-1476 bp + 2525 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 5127291-5131240(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTT
SmilChr08G001534 Chr08 NC_080394.1:12476400-12476411promoter 内 1448-1459 bp + 2542 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 12472944-12473858(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAACTGTCAA
SmilChr06G000512 Chr06 NC_080392.1:4240122-4240133promoter 内 1433-1444 bp + 2557 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 4242690-4243718(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCAA
SmilChr04G002232 Chr04 NC_080390.1:36029832-36029843promoter 内 1410-1421 bp - 2580 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 36032423-36033049(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC