转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G004179; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00012156-RA_Salv SmilChr03G004179 WRKY XP_057799230.1 MP00464 AGCGTTGACTTTTT

可能结合的靶基因

9864 个结合位点 7299 个候选靶基因 第 97 / 146 下载 TSV

上一页 97 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002382 Chr02 NC_080388.1:41729942-41729955promoter 内 244-257 bp + 3744 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 41720892-41726198(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACCTAGTCAACGTA
SmilChr02G005601 Chr02 NC_080388.1:75723225-75723238promoter 内 218-231 bp - 3770 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 75717850-75719455(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACATTTGACTTTAG
SmilChr01G002189 Chr01 NC_080387.1:38044766-38044779promoter 内 212-225 bp + 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 38039935-38040990(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TAAAAGTCAAACTA
SmilChr03G004038 Chr03 NC_080389.1:59390934-59390947promoter 内 183-196 bp + 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 59383426-59387129(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACTAAGTCAACACA
SmilChr03G000051 Chr03 NC_080389.1:510866-510879promoter 内 172-185 bp + 3816 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 514695-517585(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGTGTTGACTGTTG
SmilChr01G000729 Chr01 NC_080387.1:16221516-16221529promoter 内 40-53 bp + 3948 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 16225477-16227754(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GACATTGACTTTAG
SmilChr02G004191 Chr02 NC_080388.1:64230647-64230660promoter 内 956-969 bp - 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 3 64233692-64234493(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATCAAGTCAACAAC
SmilChr01G003723 Chr01 NC_080387.1:55555858-55555871promoter 内 264-277 bp - 3724 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 3 55542510-55552134(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACTGTTGACTTCAT
SmilChr01G005701 Chr01 NC_080387.1:73260662-73260675promoter 内 3895-3908 bp + 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 73257396-73260569(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGATGGTCAACGTT
SmilChr04G003233 Chr04 NC_080390.1:49153004-49153017promoter 内 3891-3904 bp - 97 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 49151594-49152907(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TATGTTGACTTATG
SmilChr03G002889 Chr03 NC_080389.1:45563648-45563661promoter 内 3819-3832 bp + 169 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 45563830-45567466(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGAGTTGACTGTCC
SmilChr02G005269 Chr02 NC_080388.1:73776970-73776983promoter 内 3804-3817 bp - 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 73772664-73776786(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACTGTTGACTTGGA
SmilChr04G001903 Chr04 NC_080390.1:31103395-31103408promoter 内 3769-3782 bp - 219 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 31101454-31103176(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGAGTTGACTGTCC
SmilChr02G003312 Chr02 NC_080388.1:54363542-54363555promoter 内 3763-3776 bp + 225 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 54362925-54363317(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATAGAGTCAACCTT
SmilChr04G003530 Chr04 NC_080390.1:51660136-51660149promoter 内 3736-3749 bp + 252 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 51660401-51660480(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGTGTTGACTATAT
SmilChr02G004600 Chr02 NC_080388.1:68520711-68520724promoter 内 3653-3666 bp + 335 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 68521059-68526346(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TAAGTTGACTATGT
SmilChr01G002788 Chr01 NC_080387.1:46352190-46352203promoter 内 3640-3653 bp + 348 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 46347565-46351842(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGTTAGTCAACGCG
SmilChr04G001562 Chr04 NC_080390.1:25929802-25929815promoter 内 3355-3368 bp + 633 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 25928367-25929169(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGCAAGTCAACAAC
SmilChr03G000436 Chr03 NC_080389.1:4720051-4720064promoter 内 3331-3344 bp + 657 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 4717686-4719394(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATAAAGTCAATGAC
SmilChr04G001904 Chr04 NC_080390.1:31109039-31109052promoter 内 3212-3225 bp - 776 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 31107244-31108263(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGAGTTGACTGTCC
SmilChr04G000114 Chr04 NC_080390.1:985428-985441promoter 内 3093-3106 bp + 895 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 986336-987355(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGAGTTGACTGTCC
SmilChr02G005434 Chr02 NC_080388.1:74759461-74759474promoter 内 3091-3104 bp - 897 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 74755413-74758564(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTTTTTGACTTTGG
SmilChr02G004791 Chr02 NC_080388.1:70112417-70112430promoter 内 2974-2987 bp - 1014 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 70113444-70114579(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGTTAGTCAACGCG
SmilChr03G003919 Chr03 NC_080389.1:58287279-58287292promoter 内 2925-2938 bp - 1063 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 58283199-58286216(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GATGTTGACTCTGG
SmilChr03G004280 Chr03 NC_080389.1:61232028-61232041promoter 内 2809-2822 bp + 1179 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 61233220-61236207(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CGCGTTGACTAACA
SmilChr04G001279 Chr04 NC_080390.1:20367827-20367840promoter 内 2804-2817 bp - 1184 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 20365844-20366643(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTTGTTGACTTGAT
SmilChr01G003312 Chr01 NC_080387.1:51831562-51831575promoter 内 2787-2800 bp + 1201 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 51832776-51833922(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGAGTTGACTGTCC
SmilChr01G000129 Chr01 NC_080387.1:2192388-2192401promoter 内 2697-2710 bp - 1291 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 2188602-2191097(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CGCGTTGACTAACA
SmilChr03G001735 Chr03 NC_080389.1:23321825-23321838promoter 内 2546-2559 bp + 1442 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 23323280-23324585(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGAGTTGACTGTCC
SmilChr02G000563 Chr02 NC_080388.1:7941989-7942002promoter 内 2520-2533 bp + 1468 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 7939880-7940521(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CCGAAGTCAAAGAA
SmilChr01G004299 Chr01 NC_080387.1:61176074-61176087promoter 内 2398-2411 bp - 1590 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 61172693-61174484(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAATTTGACTTTCG
SmilChr01G005554 Chr01 NC_080387.1:72375427-72375440promoter 内 2188-2201 bp + 1800 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 72370681-72373627(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CAACAGTCAACTTT
SmilChr02G003843 Chr02 NC_080388.1:60171304-60171317promoter 内 2126-2139 bp + 1862 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 60173179-60175367(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGAGTTGACTGTCC
SmilChr03G004446 Chr03 NC_080389.1:62600488-62600501promoter 内 1813-1826 bp - 2175 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 62594368-62598313(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATTGTTGACTATGG
SmilChr02G003224 Chr02 NC_080388.1:53488345-53488358promoter 内 1642-1655 bp + 2346 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 53480965-53485999(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GAGTAGTCAACTCT
SmilChr02G002529 Chr02 NC_080388.1:43996154-43996167promoter 内 1628-1641 bp + 2360 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 43998527-44004981(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCCATTGACTTTTA
SmilChr03G001149 Chr03 NC_080389.1:13246360-13246373promoter 内 1592-1605 bp + 2396 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 13248769-13249803(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GAATTTGACTTTGA
SmilChr02G004179 Chr02 NC_080388.1:64075903-64075916promoter 内 1566-1579 bp + 2422 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 64078338-64090839(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CGCGTTGACTAACA
SmilChr04G001902 Chr04 NC_080390.1:31103395-31103408promoter 内 1541-1554 bp - 2447 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 31099298-31100948(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGAGTTGACTGTCC
SmilChr01G000816 Chr01 NC_080387.1:17605182-17605195promoter 内 1482-1495 bp + 2506 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 17602212-17602676(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAGGAGTCAACCAC
SmilChr03G002055 Chr03 NC_080389.1:31269427-31269440promoter 内 1472-1485 bp - 2516 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 31271956-31272420(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAGGAGTCAACCAC
SmilChr01G001642 Chr01 NC_080387.1:30455160-30455173promoter 内 1347-1360 bp + 2641 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 30457814-30464973(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCATTTGACTTTTA
SmilChr03G004279 Chr03 NC_080389.1:61232028-61232041promoter 内 1137-1150 bp + 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 61227793-61229177(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGTTAGTCAACGCG
SmilChr01G004019 Chr01 NC_080387.1:58587816-58587829promoter 内 937-950 bp - 3051 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 58578309-58584765(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGAGTTGACTGTCC
SmilChr03G003997 Chr03 NC_080389.1:59011160-59011173promoter 内 787-800 bp + 3201 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 59014374-59017640(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTGTTTGACTTTGT
SmilChr01G006075 Chr01 NC_080387.1:76201520-76201533promoter 内 591-604 bp + 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 76204930-76207442(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CCAGTTGACTTAGA
SmilChr01G001335 Chr01 NC_080387.1:26534299-26534312promoter 内 472-485 bp + 3516 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 26537828-26539671(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGTGTTGACTCTGC
SmilChr01G003837 Chr01 NC_080387.1:56724229-56724242promoter 内 350-363 bp + 3638 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 56719044-56720591(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CGAAAGTCAAATTT
SmilChr02G004178 Chr02 NC_080388.1:64075903-64075916promoter 内 316-329 bp + 3672 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 64068322-64072231(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGTTAGTCAACGCG
SmilChr02G005073 Chr02 NC_080388.1:72387874-72387887promoter 内 117-130 bp + 3871 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 72382260-72384003(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCATAGTCAACAAC