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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 108 / 136 下载 TSV

上一页 108 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005340 Chr02 NC_080388.1:74249810-74249820promoter 内 1610-1620 bp - 2381 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 74243664-74247429(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGCCAGCGCG
SmilChr04G001965 Chr04 NC_080390.1:31876053-31876063promoter 内 957-967 bp + 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 31879097-31880597(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
SmilChr07G003379 Chr07 NC_080393.1:36548999-36549009promoter 内 672-682 bp + 3319 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 36552328-36556762(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr01G000785 Chr01 NC_080387.1:17066554-17066564promoter 内 3925-3935 bp + 66 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 17066630-17072528(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
SmilChr03G004429 Chr03 NC_080389.1:62430079-62430089promoter 内 3901-3911 bp - 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 62425990-62429989(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGCCAGCGCG
SmilChr02G000355 Chr02 NC_080388.1:4591996-4592006promoter 内 3859-3869 bp - 132 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 4592138-4593203(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr08G001341 Chr08 NC_080394.1:10706787-10706797promoter 内 3769-3779 bp - 222 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 10704333-10706565(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGCCAGCGCG
SmilChr03G003214 Chr03 NC_080389.1:49752626-49752636promoter 内 3751-3761 bp - 240 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 49752876-49754132(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr01G003159 Chr01 NC_080387.1:50420951-50420961promoter 内 3712-3722 bp + 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 50417757-50420672(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGTT
SmilChr02G000426 Chr02 NC_080388.1:5428016-5428026promoter 内 3627-3637 bp + 364 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 5428390-5432739(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
SmilChr02G005587 Chr02 NC_080388.1:75672770-75672780promoter 内 3603-3613 bp - 388 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 75668157-75672382(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
SmilChr08G004209 Chr08 NC_080394.1:51487402-51487412promoter 内 3548-3558 bp + 443 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 51487855-51488273(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTTCAGCGCA
SmilChr01G002776 Chr01 NC_080387.1:46201638-46201648promoter 内 3452-3462 bp - 539 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 46202187-46210470(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr01G006163 Chr01 NC_080387.1:77056369-77056379promoter 内 3421-3431 bp - 570 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 77045680-77055799(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGAC
SmilChr02G004702 Chr02 NC_080388.1:69329361-69329371promoter 内 3392-3402 bp - 599 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 69329970-69333125(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr03G004451 Chr03 NC_080389.1:62638578-62638588promoter 内 3302-3312 bp + 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 62639277-62641939(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
SmilChr01G003481 Chr01 NC_080387.1:53366742-53366752promoter 内 3277-3287 bp + 714 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 53363761-53366028(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGGT
SmilChr05G002777 Chr05 NC_080391.1:32364367-32364377promoter 内 3194-3204 bp - 797 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 32338545-32363570(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
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SmilChr02G005588 Chr02 NC_080388.1:75672770-75672780promoter 内 3140-3150 bp - 851 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 75673631-75675457(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
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SmilChr08G001349 Chr08 NC_080394.1:10799591-10799601promoter 内 3020-3030 bp - 971 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 10793915-10798620(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr06G001378 Chr06 NC_080392.1:14444318-14444328promoter 内 3011-3021 bp - 980 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 14441203-14443338(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr05G002197 Chr05 NC_080391.1:23435496-23435506promoter 内 2969-2979 bp + 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 23433538-23434474(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr05G000697 Chr05 NC_080391.1:5264825-5264835promoter 内 2946-2956 bp + 1045 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 5263707-5263780(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr08G004481 Chr08 NC_080394.1:54423486-54423496promoter 内 2845-2855 bp - 1146 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 54417793-54422340(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTA
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SmilChr06G001085 Chr06 NC_080392.1:10849248-10849258promoter 内 2784-2794 bp + 1207 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 10850465-10854304(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr01G002437 Chr01 NC_080387.1:41964581-41964591promoter 内 2745-2755 bp + 1246 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 41959720-41963335(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr01G001690 Chr01 NC_080387.1:31120290-31120300promoter 内 2704-2714 bp + 1287 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 31115878-31119003(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGTT
SmilChr08G003341 Chr08 NC_080394.1:34717004-34717014promoter 内 2703-2713 bp + 1288 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 34713848-34715716(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr06G000372 Chr06 NC_080392.1:2875153-2875163promoter 内 2641-2651 bp - 1350 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 2867019-2873803(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTTCAGCGCA
SmilChr08G001180 Chr08 NC_080394.1:9468895-9468905promoter 内 2639-2649 bp - 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 9465364-9467543(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr06G001190 Chr06 NC_080392.1:12119659-12119669promoter 内 2583-2593 bp + 1408 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 12117309-12118251(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr03G003098 Chr03 NC_080389.1:48038261-48038271promoter 内 2538-2548 bp - 1453 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 48039724-48041670(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGGT
SmilChr03G003178 Chr03 NC_080389.1:49238541-49238551promoter 内 2533-2543 bp + 1458 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 49240009-49241631(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTTCAGCGCA
SmilChr06G002657 Chr06 NC_080392.1:38389006-38389016promoter 内 2524-2534 bp - 1467 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 38390483-38392999(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
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SmilChr02G000425 Chr02 NC_080388.1:5428016-5428026promoter 内 2355-2365 bp + 1636 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 5424566-5426380(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr06G001735 Chr06 NC_080392.1:20017506-20017516promoter 内 2284-2294 bp + 1707 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 20011098-20015799(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGGT
SmilChr03G000847 Chr03 NC_080389.1:9662821-9662831promoter 内 2266-2276 bp + 1725 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 9654315-9661096(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr07G000854 Chr07 NC_080393.1:6081443-6081453promoter 内 2237-2247 bp - 1754 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 6083207-6091922(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGGT
SmilChr07G000138 Chr07 NC_080393.1:823834-823844promoter 内 2193-2203 bp - 1798 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 820621-822036(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr07G004574 Chr07 NC_080393.1:58532240-58532250promoter 内 2189-2199 bp - 1802 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 58534052-58535131(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGGT
SmilChr05G004204 Chr05 NC_080391.1:55912913-55912923promoter 内 2173-2183 bp - 1818 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 55908894-55911095(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr05G000400 Chr05 NC_080391.1:3007004-3007014promoter 内 2097-2107 bp + 1894 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 3008908-3013875(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
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SmilChr02G002923 Chr02 NC_080388.1:49632410-49632420promoter 内 2039-2049 bp + 1952 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 49629524-49630458(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr01G001165 Chr01 NC_080387.1:23671547-23671557promoter 内 2000-2010 bp - 1991 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 23673548-23687383(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGTT