转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 109 / 136 下载 TSV

上一页 109 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001416 Chr05 NC_080391.1:12794841-12794851promoter 内 1983-1993 bp - 2008 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 12790333-12792833(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr02G003165 Chr02 NC_080388.1:52686235-52686245promoter 内 1963-1973 bp + 2028 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 52681247-52684207(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGGT
SmilChr02G004924 Chr02 NC_080388.1:71255058-71255068promoter 内 1963-1973 bp - 2028 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 71252206-71253030(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr01G005137 Chr01 NC_080387.1:69158686-69158696promoter 内 1867-1877 bp + 2124 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 69160820-69162997(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr01G005136 Chr01 NC_080387.1:69158686-69158696promoter 内 1866-1876 bp + 2125 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 69154295-69156561(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr07G003123 Chr07 NC_080393.1:33146541-33146551promoter 内 1813-1823 bp - 2178 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 33143461-33144363(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
SmilChr07G003143 Chr07 NC_080393.1:33326274-33326284promoter 内 1813-1823 bp - 2178 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 33323194-33324096(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
SmilChr04G002735 Chr04 NC_080390.1:43013574-43013584promoter 内 1739-1749 bp - 2252 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 43009539-43011322(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
SmilChr01G002045 Chr01 NC_080387.1:36192989-36192999promoter 内 1681-1691 bp - 2310 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 36195309-36197167(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr04G002043 Chr04 NC_080390.1:33154187-33154197promoter 内 1645-1655 bp + 2346 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 33148031-33151841(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGGT
SmilChr01G002031 Chr01 NC_080387.1:35893229-35893239promoter 内 1625-1635 bp + 2366 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 35889237-35890863(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr06G000581 Chr06 NC_080392.1:4987878-4987888promoter 内 1594-1604 bp + 2397 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 4981630-4985481(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr01G002002 Chr01 NC_080387.1:35525707-35525717promoter 内 1536-1546 bp - 2455 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 35528172-35530481(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAACT
SmilChr07G000156 Chr07 NC_080393.1:931053-931063promoter 内 1515-1525 bp + 2476 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 926021-928577(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr05G002342 Chr05 NC_080391.1:25361489-25361499promoter 内 1512-1522 bp - 2479 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 25363978-25367330(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr04G003976 Chr04 NC_080390.1:55230075-55230085promoter 内 1510-1520 bp - 2481 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 55224294-55227594(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGAC
SmilChr06G000396 Chr06 NC_080392.1:3170859-3170869promoter 内 1495-1505 bp - 2496 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 3161647-3168363(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTTCAGCGCA
SmilChr07G002110 Chr07 NC_080393.1:19212108-19212118promoter 内 1392-1402 bp - 2599 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 19214717-19219518(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr02G000356 Chr02 NC_080388.1:4591996-4592006promoter 内 1369-1379 bp - 2622 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 4594628-4601151(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr07G004725 Chr07 NC_080393.1:60129283-60129293promoter 内 1351-1361 bp - 2640 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 60123770-60126643(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr04G002713 Chr04 NC_080390.1:42740622-42740632promoter 内 1307-1317 bp - 2684 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 42743316-42745112(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr08G002544 Chr08 NC_080394.1:24724353-24724363promoter 内 1303-1313 bp + 2688 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 24727051-24727158(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGAC
SmilChr02G000495 Chr02 NC_080388.1:6835612-6835622promoter 内 1299-1309 bp + 2692 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 6832840-6832920(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGGT
SmilChr03G004149 Chr03 NC_080389.1:60294661-60294671promoter 内 1262-1272 bp - 2729 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 60297400-60304823(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr05G001216 Chr05 NC_080391.1:10213127-10213137promoter 内 1253-1263 bp + 2738 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 10215875-10216327(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTA
SmilChr03G001693 Chr03 NC_080389.1:22444092-22444102promoter 内 1252-1262 bp - 2739 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 22446841-22447502(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr01G003590 Chr01 NC_080387.1:54441975-54441985promoter 内 1236-1246 bp - 2755 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 54437545-54439220(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
SmilChr01G003593 Chr01 NC_080387.1:54470473-54470483promoter 内 1236-1246 bp - 2755 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 54466042-54467718(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
SmilChr07G003828 Chr07 NC_080393.1:47355018-47355028promoter 内 1208-1218 bp - 2783 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 47357811-47358818(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr01G004714 Chr01 NC_080387.1:65321900-65321910promoter 内 1193-1203 bp - 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 65324708-65326861(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr07G000361 Chr07 NC_080393.1:2474306-2474316promoter 内 1193-1203 bp + 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 2477114-2479745(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
SmilChr01G002675 Chr01 NC_080387.1:44964323-44964333promoter 内 1142-1152 bp - 2849 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 44960668-44961474(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACA
SmilChr05G003892 Chr05 NC_080391.1:52642427-52642437promoter 内 1140-1150 bp - 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 52645288-52647911(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr02G003477 Chr02 NC_080388.1:56075876-56075886promoter 内 1100-1110 bp - 2891 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 56065876-56072985(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTTCAGCGCA
SmilChr06G001329 Chr06 NC_080392.1:13795268-13795278promoter 内 1074-1084 bp + 2917 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 13798195-13799504(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTA
SmilChr08G004210 Chr08 NC_080394.1:51487402-51487412promoter 内 1061-1071 bp + 2930 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 51490342-51497902(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTTCAGCGCA
SmilChr05G002405 Chr05 NC_080391.1:26558320-26558330promoter 内 1014-1024 bp - 2977 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 26561307-26562324(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGTT
SmilChr08G004572 Chr08 NC_080394.1:55293983-55293993promoter 内 1014-1024 bp - 2977 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 55287477-55291006(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
SmilChr07G004575 Chr07 NC_080393.1:58532240-58532250promoter 内 909-919 bp - 3082 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 58535332-58536933(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGGT
SmilChr01G001733 Chr01 NC_080387.1:31926192-31926202promoter 内 873-883 bp - 3118 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 31922968-31923074(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTTCAGCGCA
SmilChr01G002775 Chr01 NC_080387.1:46201638-46201648promoter 内 810-820 bp - 3181 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 46195111-46198457(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
SmilChr06G001725 Chr06 NC_080392.1:19899120-19899130promoter 内 791-801 bp - 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 19894920-19895920(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTTCAGCGCA
SmilChr07G001320 Chr07 NC_080393.1:10140219-10140229promoter 内 790-800 bp + 3201 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 10143430-10143798(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTA
SmilChr07G000155 Chr07 NC_080393.1:925966-925976promoter 内 771-781 bp + 3220 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 916953-922746(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr05G003207 Chr05 NC_080391.1:41111399-41111409promoter 内 765-775 bp + 3226 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 41106817-41108173(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr06G000240 Chr06 NC_080392.1:1608131-1608141promoter 内 765-775 bp + 3226 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 1611367-1611861(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGA
SmilChr04G001501 Chr04 NC_080390.1:24611341-24611351promoter 内 699-709 bp - 3292 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 24614643-24615796(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT
SmilChr01G003969 Chr01 NC_080387.1:58141334-58141344promoter 内 653-663 bp + 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 58134832-58137996(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr02G000749 Chr02 NC_080388.1:12187765-12187775promoter 内 645-655 bp + 3346 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 12179393-12184419(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGTGCTGAGCT
SmilChr05G000335 Chr05 NC_080391.1:2500788-2500798promoter 内 642-652 bp + 3349 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 2496943-2497439(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCT