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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G001094; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021820-RA_Salv SmilChr04G001094 WRKY XP_057804404.1 MP00408 AGCGTTGACTTTT

可能结合的靶基因

9902 个结合位点 8149 个候选靶基因 第 12 / 163 下载 TSV

上一页 12 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G001056 Chr08 NC_080394.1:8112751-8112763promoter 内 268-280 bp - 3721 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 8105688-8109030(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACCGTTGACTATT
SmilChr02G000233 Chr02 NC_080388.1:3014264-3014276promoter 内 213-225 bp - 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 3006992-3010488(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TCCGTTGACCTTT
SmilChr05G003294 Chr05 NC_080391.1:43100114-43100126promoter 内 180-192 bp + 3809 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 43092449-43096305(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACTCC
SmilChr07G002876 Chr07 NC_080393.1:28960291-28960303promoter 内 75-87 bp - 3914 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 28954162-28956377(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGAGTTGACTTTT
SmilChr01G004434 Chr01 NC_080387.1:62429492-62429504promoter 内 8-20 bp - 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 62433485-62434688(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACGGA
SmilChr01G001681 Chr01 NC_080387.1:31010392-31010404promoter 内 3040-3052 bp - 949 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 3 31008781-31009443(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGCGTTGACTCTG
SmilChr01G001682 Chr01 NC_080387.1:31010392-31010404promoter 内 1102-1114 bp - 2887 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 3 31013291-31016406(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAGAGTCAACGCC
SmilChr01G001680 Chr01 NC_080387.1:31010392-31010404promoter 内 903-915 bp - 3086 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 3 31005862-31007306(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGCGTTGACTCTG
SmilChr05G000025 Chr05 NC_080391.1:129373-129385promoter 内 3973-3985 bp + 16 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 129401-132645(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCCGTTGACTTGC
SmilChr04G002462 Chr04 NC_080390.1:39446368-39446380promoter 内 3224-3236 bp + 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 39443057-39445603(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACGAC
SmilChr03G003343 Chr03 NC_080389.1:51767698-51767710promoter 内 1717-1729 bp + 2272 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 51757803-51765426(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAGAGTCAACGCC
SmilChr04G001898 Chr04 NC_080390.1:31006451-31006463promoter 内 1486-1498 bp + 2503 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 31008966-31011243(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGCGTTGACTCTG
SmilChr08G001943 Chr08 NC_080394.1:17047672-17047684promoter 内 865-877 bp - 3124 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 17050808-17051448(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACGAC
SmilChr08G001941 Chr08 NC_080394.1:17047672-17047684promoter 内 709-721 bp - 3280 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 17043379-17044392(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTCGTTGACTTCT
SmilChr02G002600 Chr02 NC_080388.1:45123519-45123531promoter 内 3872-3884 bp + 117 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 45123648-45124607(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTCGTTGACTTTC
SmilChr01G002768 Chr01 NC_080387.1:46132684-46132696promoter 内 3828-3840 bp + 161 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 46131516-46132523(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAAGTCAACGGC
SmilChr02G000958 Chr02 NC_080388.1:16670986-16670998promoter 内 3352-3364 bp - 637 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 16671635-16675520(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAGGTCAACGCG
SmilChr05G000317 Chr05 NC_080391.1:2376605-2376617promoter 内 3075-3087 bp + 914 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 2377531-2379708(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGCGTTGACTCTG
SmilChr05G000535 Chr05 NC_080391.1:4101247-4101259promoter 内 2320-2332 bp - 1669 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 4097265-4099578(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTCGTTGACTTTC
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SmilChr03G002533 Chr03 NC_080389.1:40395524-40395536promoter 内 1631-1643 bp - 2358 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 40387035-40393166(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCCGTTGACTTGC
SmilChr02G002967 Chr02 NC_080388.1:50192839-50192851promoter 内 653-665 bp + 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 50182192-50189503(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACGAC
SmilChr05G001019 Chr05 NC_080391.1:8362679-8362691promoter 内 109-121 bp + 3880 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 8356817-8358799(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAGAGTCAACGCC
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SmilChr01G004800 Chr01 NC_080387.1:66206997-66207009promoter 内 2498-2510 bp - 1491 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 66208500-66209420(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATAAGTCAACGGA
SmilChr02G004565 Chr02 NC_080388.1:68169822-68169834promoter 内 1956-1968 bp - 2033 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 68171867-68762800(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACCCC
SmilChr08G000498 Chr08 NC_080394.1:3645785-3645797promoter 内 1326-1338 bp + 2663 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 3641259-3643122(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TAAAGTCAACGAT
SmilChr08G000537 Chr08 NC_080394.1:3909937-3909949promoter 内 3495-3507 bp + 494 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 3908677-3909443(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACCCC
SmilChr06G001195 Chr06 NC_080392.1:12230584-12230596promoter 内 3040-3052 bp + 949 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 12224448-12229635(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACTGC
SmilChr05G002923 Chr05 NC_080391.1:35187611-35187623promoter 内 2606-2618 bp + 1383 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 35183081-35186228(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TAAAGTCAACGAT
SmilChr02G004034 Chr02 NC_080388.1:62634862-62634874promoter 内 2311-2323 bp + 1678 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 62630314-62633184(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACGAA
SmilChr06G003052 Chr06 NC_080392.1:43414175-43414187promoter 内 2137-2149 bp - 1852 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 43410461-43412323(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAGTTGACTTTT
SmilChr07G003822 Chr07 NC_080393.1:47259624-47259636promoter 内 1855-1867 bp + 2134 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 47261770-47262135(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTCGTTGACTTTC
SmilChr06G003000 Chr06 NC_080392.1:42884804-42884816promoter 内 1514-1526 bp + 2475 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 42881353-42882329(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACTGC
SmilChr03G001503 Chr03 NC_080389.1:18389985-18389997promoter 内 1320-1332 bp - 2669 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 18383325-18387316(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAGTTGACTTTT
SmilChr05G002160 Chr05 NC_080391.1:22847927-22847939promoter 内 143-155 bp + 3846 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 22841559-22844081(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAGGTCAACGCA
SmilChr05G003711 Chr05 NC_080391.1:50199572-50199584promoter 内 3910-3922 bp + 79 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 50197485-50199493(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAGGTCAACGCA
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SmilChr07G001572 Chr07 NC_080393.1:12965272-12965284promoter 内 3575-3587 bp - 414 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 12959426-12964858(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATCGTTGACTTTA
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SmilChr06G000008 Chr06 NC_080392.1:189584-189596promoter 内 3314-3326 bp - 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 186090-188909(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTCGTTGACTTTC
SmilChr02G001708 Chr02 NC_080388.1:31430607-31430619promoter 内 3224-3236 bp + 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 31428694-31429842(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACGTC
SmilChr03G001021 Chr03 NC_080389.1:11815961-11815973promoter 内 3201-3213 bp + 788 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 11814058-11815173(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAGGTCAACGCA
SmilChr02G003085 Chr02 NC_080388.1:51752936-51752948promoter 内 3166-3178 bp - 823 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 51753771-51754938(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACGAA
SmilChr04G000402 Chr04 NC_080390.1:4195143-4195155promoter 内 3118-3130 bp + 871 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 4196026-4201934(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAGTTGACTTTT
SmilChr07G000566 Chr07 NC_080393.1:3870326-3870338promoter 内 3094-3106 bp - 895 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 3867742-3869431(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAGTTGACTTTT
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SmilChr02G003086 Chr02 NC_080388.1:51752936-51752948promoter 内 2608-2620 bp - 1381 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 51754329-51754979(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACGAA