靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。
下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。
| 转录因子 ID | Family | Motifs | 候选靶基因 | 候选位点 | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| ARR-B | 1MP00010 |
8344 | 9778 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00059 |
8333 | 9940 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00296 |
8304 | 9873 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00114 |
8151 | 9897 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00408 |
8149 | 9902 | 查靶基因 | |
| Nin-like | 1MP00449 |
8096 | 9453 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00209 |
8083 | 9910 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00627 |
8075 | 9835 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00450 |
8044 | 9901 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00558 |
8044 | 9762 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00096 |
8019 | 9914 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00476 |
7981 | 9904 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00221 |
7965 | 9903 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00069 |
7882 | 9917 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00406 |
7839 | 9917 | 查靶基因 | |
| TALE | 1MP00670 |
7758 | 9906 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00555 |
7648 | 9805 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00021 |
7629 | 9812 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00132 |
7583 | 9926 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00609 |
7575 | 9941 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00529 |
7559 | 9247 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00510 |
7526 | 9799 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00058 |
7440 | 9855 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00303 |
7416 | 9868 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00565 |
7412 | 9785 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00026 |
7408 | 9854 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00071 |
7408 | 9764 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00033 |
7406 | 9827 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00074 |
7396 | 9969 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00216 |
7342 | 9832 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00539 |
7338 | 9848 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00574 |
7302 | 9846 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00464 |
7299 | 9864 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00315 |
7291 | 9567 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00525 |
7235 | 9838 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00171 |
7182 | 9833 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00506 |
7173 | 9818 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00272 |
7172 | 9889 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00184 |
7147 | 9840 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00647 |
7133 | 9953 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00485 |
7130 | 8059 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00134 |
7078 | 8676 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00312 |
7006 | 8490 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00564 |
6984 | 9893 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00022 |
6959 | 9720 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00040 |
6920 | 9919 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00151 |
6907 | 9976 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00455 |
6900 | 9792 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00482 |
6899 | 8940 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00291 |
6894 | 9321 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00307 |
6893 | 9755 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00195 |
6878 | 9832 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00388 |
6870 | 9774 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00318 |
6849 | 9413 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00633 |
6833 | 8026 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00308 |
6805 | 9826 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00082 |
6784 | 9435 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00080 |
6766 | 9850 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00028 |
6764 | 9024 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00191 |
6736 | 9690 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00081 |
6729 | 9942 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00500 |
6697 | 9681 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00452 |
6671 | 7783 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00531 |
6663 | 9784 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00200 |
6661 | 9930 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00034 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00660 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00055 |
6638 | 9685 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00634 |
6619 | 7771 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00035 |
6618 | 9903 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00568 |
6611 | 9696 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00039 |
6610 | 9936 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00284 |
6552 | 9774 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00422 |
6535 | 9791 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00153 |
6534 | 9706 | 查靶基因 | |
| YABBY | 1MP00620 |
6504 | 9844 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00169 |
6498 | 7295 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00252 |
6478 | 9780 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00108 |
6458 | 9810 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00062 |
6454 | 7249 | 查靶基因 | |
| RAV | 1MP00024 |
6450 | 9853 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00167 |
6439 | 9756 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00416 |
6433 | 9716 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00608 |
6398 | 9817 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00240 |
6368 | 9978 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00607 |
6362 | 9718 | 查靶基因 | |
| Dof | 1MP00402 |
6278 | 9875 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00409 |
6252 | 8429 | 查靶基因 | |
| GRAS | 1MP00611 |
6232 | 9807 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00648 |
6170 | 9939 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00120 |
6144 | 7514 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00251 |
6140 | 9713 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00077 |
6125 | 9815 | 查靶基因 | |
| GATA | 1MP00130 |
6015 | 9821 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00508 |
5979 | 7481 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00260 |
5932 | 9706 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00013 |
5927 | 9712 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00299 |
5919 | 9699 | 查靶基因 |
输入: SmilChr01G004579; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90
| TF ID | 新 Gene ID | 家族 | Protein | Motif | 共识序列 |
|---|---|---|---|---|---|
SMil_00010264-RA_Salv |
SmilChr01G004579 |
MYB | XP_057787263.1 |
MP00132 |
CTTTTCCAACCACCTTTTC |
9926 个结合位点 7583 个候选靶基因 第 15 / 152 下载 TSV
| 靶基因 | 染色体 | 最佳结合位点 | 链方向 | 靶基因上游距离 | 结合可能性 | 启动子命中位点 | 基因区间 | TF | Motif | 匹配序列 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SmilChr02G002757 |
Chr02 | NC_080388.1:47609851-47609869promoter 内 1557-1575 bp |
- | 2426 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 3 | 47612295-47615093(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GACGCTGTGGTTGGGGAGG |
SmilChr04G000756 |
Chr04 | NC_080390.1:9255255-9255273promoter 内 745-763 bp |
- | 3238 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 3 | 9249185-9252017(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GCCACCCAACCACCTAAAC |
SmilChr03G000286 |
Chr03 | NC_080389.1:3258970-3258988promoter 内 3874-3892 bp |
+ | 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 2 | 3256730-3258861(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
ATGAGGGTGGTTGGTGGCG |
SmilChr01G003581 |
Chr01 | NC_080387.1:54380193-54380211promoter 内 2462-2480 bp |
+ | 1521 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 2 | 54376761-54378672(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TAAGAGGTAGTTGGAAAGA |
SmilChr03G000229 |
Chr03 | NC_080389.1:2723607-2723625promoter 内 2332-2350 bp |
- | 1651 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 2 | 2725276-2727534(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GTCGAGGTGGTTGGCCTCG |
SmilChr05G000446 |
Chr05 | NC_080391.1:3385939-3385957promoter 内 2246-2264 bp |
- | 1737 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 2 | 3387694-3391765(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CGAAAGGTGGTTGGTGGCA |
SmilChr02G001610 |
Chr02 | NC_080388.1:29967335-29967353promoter 内 1901-1919 bp |
- | 2082 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 2 | 29969435-29972595(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
ACGCCAGTGGTTGGGGGGG |
SmilChr02G000793 |
Chr02 | NC_080388.1:13082900-13082918promoter 内 1771-1789 bp |
+ | 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 2 | 13079223-13080688(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CTGTTGGTGGTTGGGTCGG |
SmilChr04G000067 |
Chr04 | NC_080390.1:597779-597797promoter 内 1176-1194 bp |
+ | 2807 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 2 | 600604-619869(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CAGCCCCAACCACAAATGC |
SmilChr02G003845 |
Chr02 | NC_080388.1:60214263-60214281promoter 内 621-639 bp |
+ | 3362 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 2 | 60206723-60210901(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
ATGAAGGCGGTTGGAGAGG |
SmilChr04G002588 |
Chr04 | NC_080390.1:41292395-41292413promoter 内 470-488 bp |
- | 3513 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 2 | 41295926-41299896(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
ATAGAGGTGGTTGGATTGA |
SmilChr03G000230 |
Chr03 | NC_080389.1:2723607-2723625promoter 内 12-30 bp |
- | 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 2 | 2727596-2728591(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GTCGAGGTGGTTGGCCTCG |
SmilChr02G004847 |
Chr02 | NC_080388.1:70609860-70609878promoter 内 3949-3967 bp |
+ | 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 70609912-70613661(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AAATGCCAACCACCACTGC |
SmilChr04G002451 |
Chr04 | NC_080390.1:39230468-39230486promoter 内 3846-3864 bp |
- | 137 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 39230623-39236288(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
ATGTCGGTGGTTGAGGGAG |
SmilChr04G000758 |
Chr04 | NC_080390.1:9255255-9255273promoter 内 3802-3820 bp |
- | 181 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 9252657-9255074(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GCCACCCAACCACCTAAAC |
SmilChr02G001712 |
Chr02 | NC_080388.1:31514240-31514258promoter 内 3706-3724 bp |
+ | 277 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 31512651-31513963(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AGAGAGGTGGTTGCAAAAG |
SmilChr05G001589 |
Chr05 | NC_080391.1:14591026-14591044promoter 内 3486-3504 bp |
- | 497 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 14585567-14590529(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CTGCCGCAACCACCGCCCT |
SmilChr02G002890 |
Chr02 | NC_080388.1:49188433-49188451promoter 内 3358-3376 bp |
- | 625 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 49189076-49192507(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
ATGGAGGTGGTTGAGCCAC |
SmilChr03G001511 |
Chr03 | NC_080389.1:18521702-18521720promoter 内 3151-3169 bp |
+ | 832 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 18517639-18520870(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GATTTGGTGGTTGGGATGA |
SmilChr02G004980 |
Chr02 | NC_080388.1:71690005-71690023promoter 内 3068-3086 bp |
+ | 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 71690938-71693684(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
ACCTTCCACCCACCTTTCT |
SmilChr02G004902 |
Chr02 | NC_080388.1:71024285-71024303promoter 内 3054-3072 bp |
+ | 929 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 71021125-71023356(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GTGGTGGTGGTTGCAGGGA |
SmilChr02G000823 |
Chr02 | NC_080388.1:13850450-13850468promoter 内 3053-3071 bp |
+ | 930 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 13851398-13852798(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CGCCCTCACCCACCTTATT |
SmilChr02G001544 |
Chr02 | NC_080388.1:28694828-28694846promoter 内 3050-3068 bp |
+ | 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 28690398-28693895(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AGAGAGGTGGTTGAATCCG |
SmilChr03G002203 |
Chr03 | NC_080389.1:34689371-34689389promoter 内 2920-2938 bp |
- | 1063 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 34685805-34688308(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AGTCGTCAACCACCTCCGA |
SmilChr02G000822 |
Chr02 | NC_080388.1:13850450-13850468promoter 内 2843-2861 bp |
+ | 1140 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 13837220-13849310(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AATAAGGTGGGTGAGGGCG |
SmilChr05G002064 |
Chr05 | NC_080391.1:21503624-21503642promoter 内 2730-2748 bp |
+ | 1253 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 21501875-21502371(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TAGAAAGTGGTTGGCGTGG |
SmilChr05G002213 |
Chr05 | NC_080391.1:23591070-23591088promoter 内 2478-2496 bp |
+ | 1505 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 23592593-23593882(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CGGCATCAACCACCCCCTC |
SmilChr03G003289 |
Chr03 | NC_080389.1:51000044-51000062promoter 内 2468-2486 bp |
- | 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 50997014-50998529(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TTTCTCCAACCACTCTTTC |
SmilChr03G000287 |
Chr03 | NC_080389.1:3262005-3262023promoter 内 2415-2433 bp |
+ | 1568 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 3263591-3264484(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CGCCACCAACCACCCTCAT |
SmilChr02G000613 |
Chr02 | NC_080388.1:8947391-8947409promoter 内 2349-2367 bp |
- | 1634 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 8944679-8945757(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
ACTCTTCAACCACTTTCTT |
SmilChr03G002056 |
Chr03 | NC_080389.1:31296125-31296143promoter 内 1929-1947 bp |
- | 2054 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 31291352-31294071(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CCTTACCAACCACCATATC |
SmilChr02G000719 |
Chr02 | NC_080388.1:11556888-11556906promoter 内 1791-1809 bp |
+ | 2192 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 11542462-11554696(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CCCGCGGTGGTTGGAAGAG |
SmilChr01G002404 |
Chr01 | NC_080387.1:41393657-41393675promoter 内 1751-1769 bp |
+ | 2232 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 41395907-41396679(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CTCTTCCAACCACCAACAA |
SmilChr03G000228 |
Chr03 | NC_080389.1:2723607-2723625promoter 内 1604-1622 bp |
- | 2379 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 2719788-2721228(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CGAGGCCAACCACCTCGAC |
SmilChr02G002889 |
Chr02 | NC_080388.1:49188433-49188451promoter 内 1590-1608 bp |
- | 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 49185492-49186040(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GTGGCTCAACCACCTCCAT |
SmilChr03G003935 |
Chr03 | NC_080389.1:58409716-58409734promoter 内 1478-1496 bp |
+ | 2505 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 58412239-58412667(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CGCCACCAACCACCCTCAT |
SmilChr03G000772 |
Chr03 | NC_080389.1:8815179-8815197promoter 内 1280-1298 bp |
- | 2703 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 8810690-8812476(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CAGCCCCAACCACCAAGAA |
SmilChr03G001864 |
Chr03 | NC_080389.1:25756647-25756665promoter 内 1120-1138 bp |
+ | 2863 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 25749931-25753784(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CTGCTGGTGGTTGGAAAAG |
SmilChr01G004026 |
Chr01 | NC_080387.1:58673293-58673311promoter 内 729-747 bp |
- | 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 58667914-58670039(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TATCTCCAACCACCAATAT |
SmilChr01G003582 |
Chr01 | NC_080387.1:54380193-54380211promoter 内 362-380 bp |
+ | 3621 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 54383832-54388134(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TCTTTCCAACTACCTCTTA |
SmilChr01G003809 |
Chr01 | NC_080387.1:56467082-56467100promoter 内 174-192 bp |
+ | 3809 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 56461262-56463273(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GTGTTGGTGGTTGACGATG |
SmilChr02G000432 |
Chr02 | NC_080388.1:5624431-5624449promoter 内 104-122 bp |
- | 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 5617091-5620552(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CTTTTGCAACCACCTCTCT |
SmilChr02G000980 |
Chr02 | NC_080388.1:17173610-17173628promoter 内 3-21 bp |
- | 3980 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.4/ 100 | 1 | 17177608-17183859(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AAAGAAGTGGTTGAAACGG |
SmilChr04G003471 |
Chr04 | NC_080390.1:51173385-51173403promoter 内 3680-3698 bp |
+ | 303 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.3/ 100 | 3 | 51173706-51178967(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CCACCCCAACCACTAGGCC |
SmilChr02G005150 |
Chr02 | NC_080388.1:72880222-72880240promoter 内 2639-2657 bp |
+ | 1344 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.3/ 100 | 3 | 72881584-72885734(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CCAGCCCAACCACCTATTA |
SmilChr04G002466 |
Chr04 | NC_080390.1:39486218-39486236promoter 内 2344-2362 bp |
+ | 1639 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.3/ 100 | 3 | 39487875-39498206(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CTCACCCAACCACCATGCT |
SmilChr04G003744 |
Chr04 | NC_080390.1:53742652-53742670promoter 内 1392-1410 bp |
+ | 2591 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.3/ 100 | 3 | 53734711-53740061(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AATGAAGTGGTTGGTGAAG |
SmilChr03G000241 |
Chr03 | NC_080389.1:2860018-2860036promoter 内 772-790 bp |
- | 3211 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.3/ 100 | 3 | 2855374-2856807(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TGCCACCAACCACCTCTTA |
SmilChr01G005961 |
Chr01 | NC_080387.1:75335322-75335340promoter 内 665-683 bp |
+ | 3318 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.3/ 100 | 3 | 75338658-75341099(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TCCTCTCAACCACATCCAC |
SmilChr04G000003 |
Chr04 | NC_080390.1:70193-70211promoter 内 367-385 bp |
+ | 3616 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 94.3/ 100 | 3 | 63610-66577(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GAGGATGTGGTTGAGGTTT |