转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 23 / 134 下载 TSV

上一页 23 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002991 Chr02 NC_080388.1:50580541-50580553promoter 内 1002-1014 bp + 2987 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 50574042-50577554(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTAAT
SmilChr02G001158 Chr02 NC_080388.1:21149239-21149251promoter 内 982-994 bp + 3007 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 21145507-21146232(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATTA
SmilChr01G005990 Chr01 NC_080387.1:75513031-75513043promoter 内 721-733 bp - 3268 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 75506859-75509763(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATTTGGATAAGC
SmilChr01G000588 Chr01 NC_080387.1:12740229-12740241promoter 内 701-713 bp + 3288 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 12743529-12746523(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATTGGATAAGA
SmilChr01G000587 Chr01 NC_080387.1:12740229-12740241promoter 内 696-708 bp + 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 12736830-12736936(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATTA
SmilChr02G002849 Chr02 NC_080388.1:48665667-48665679promoter 内 694-706 bp + 3295 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 48668974-48673486(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGTAAAGATAAGG
SmilChr02G001159 Chr02 NC_080388.1:21149239-21149251promoter 内 643-655 bp + 3346 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 21152597-21153340(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATTGGATAAGA
SmilChr01G000719 Chr01 NC_080387.1:16089823-16089835promoter 内 428-440 bp + 3561 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 16093396-16094636(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATAAGGATAAGA
SmilChr01G000219 Chr01 NC_080387.1:3862491-3862503promoter 内 376-388 bp - 3613 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 3854243-3858878(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATTGGATAAGA
SmilChr01G006022 Chr01 NC_080387.1:75809399-75809411promoter 内 282-294 bp - 3707 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 75800542-75805692(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGTTTAGATAAGG
SmilChr01G000517 Chr01 NC_080387.1:10613913-10613925promoter 内 220-232 bp - 3769 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 10617694-10624408(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATTA
SmilChr02G002253 Chr02 NC_080388.1:39972737-39972749promoter 内 197-209 bp - 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 39965687-39968945(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATTGGATAAGA
SmilChr02G002812 Chr02 NC_080388.1:48174554-48174566promoter 内 190-202 bp + 3799 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 48178365-48180165(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCATTGGATAAGG
SmilChr01G001781 Chr01 NC_080387.1:32687659-32687671promoter 内 106-118 bp + 3883 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 32691554-32693498(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATAAAGATAAGG
SmilChr02G005261 Chr02 NC_080388.1:73700348-73700360promoter 内 3404-3416 bp - 585 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 73698250-73699763(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTGTGGATAAGC
SmilChr01G003324 Chr01 NC_080387.1:51930360-51930372promoter 内 1153-1165 bp - 2836 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 51933208-51936060(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGCACC
SmilChr01G002664 Chr01 NC_080387.1:44879867-44879879promoter 内 188-200 bp - 3801 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 44872611-44876066(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAAGGGATAAGG
SmilChr03G002259 Chr03 NC_080389.1:35583393-35583405promoter 内 3092-3104 bp + 897 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 35581768-35582496(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTTTA
SmilChr01G004568 Chr01 NC_080387.1:63739713-63739725promoter 内 2635-2647 bp - 1354 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 63735680-63738359(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCAAAGGATAAGG
SmilChr03G002067 Chr03 NC_080389.1:31561696-31561708promoter 内 2199-2211 bp + 1790 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 31563498-31563962(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAGGTGGATAAGG
SmilChr02G001401 Chr02 NC_080388.1:26596425-26596437promoter 内 787-799 bp - 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 26591744-26593223(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGTTCGGATAAGG
SmilChr02G000292 Chr02 NC_080388.1:3703577-3703589promoter 内 3279-3291 bp - 710 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 3704299-3707126(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCATAC
SmilChr02G000344 Chr02 NC_080388.1:4495671-4495683promoter 内 3267-3279 bp + 722 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 4492434-4494949(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCATAC
SmilChr02G004668 Chr02 NC_080388.1:69049449-69049461promoter 内 3010-3022 bp - 979 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 69045149-69048470(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATGTGGATAAGC
SmilChr03G002285 Chr03 NC_080389.1:36031943-36031955promoter 内 2804-2816 bp + 1185 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 36027752-36030758(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCATAC
SmilChr02G000469 Chr02 NC_080388.1:6344878-6344890promoter 内 2648-2660 bp + 1341 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 6341401-6343537(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATAAG
SmilChr02G003006 Chr02 NC_080388.1:50695431-50695443promoter 内 2631-2643 bp + 1358 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 50696801-50700421(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTTTGGATAAGA
SmilChr03G001281 Chr03 NC_080389.1:14990612-14990624promoter 内 2518-2530 bp + 1471 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 14986288-14989141(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAGTAG
SmilChr02G001466 Chr02 NC_080388.1:27393250-27393262promoter 内 2517-2529 bp - 1472 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 27390573-27391778(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTTTGGATAAGA
SmilChr02G000294 Chr02 NC_080388.1:3719234-3719246promoter 内 2419-2431 bp - 1570 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 3720816-3723614(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCATAC
SmilChr02G003005 Chr02 NC_080388.1:50695431-50695443promoter 内 2098-2110 bp + 1891 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 50690724-50693540(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAAAAA
SmilChr02G001390 Chr02 NC_080388.1:26384182-26384194promoter 内 1985-1997 bp + 2004 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 26379470-26382178(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTATAAA
SmilChr01G000132 Chr01 NC_080387.1:2220649-2220661promoter 内 1486-1498 bp + 2503 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 2216359-2218146(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTATAAA
SmilChr02G001334 Chr02 NC_080388.1:24802408-24802420promoter 内 1138-1150 bp - 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 24805271-24808516(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCACCTT
SmilChr01G003905 Chr01 NC_080387.1:57313918-57313930promoter 内 1010-1022 bp + 2979 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 57316909-57323551(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTAATGGATAAGA
SmilChr01G001634 Chr01 NC_080387.1:30400699-30400711promoter 内 810-822 bp + 3179 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 30392990-30397520(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCATAC
SmilChr01G003921 Chr01 NC_080387.1:57464793-57464805promoter 内 682-694 bp + 3307 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 57468112-57474680(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTAATGGATAAGA
SmilChr02G005357 Chr02 NC_080388.1:74308608-74308620promoter 内 539-551 bp + 3450 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 74302413-74305158(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTATAAA
SmilChr02G002737 Chr02 NC_080388.1:47300850-47300862promoter 内 421-433 bp + 3568 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 47304430-47306172(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTATAGATAAGG
SmilChr01G000766 Chr01 NC_080387.1:16793785-16793797promoter 内 283-295 bp + 3706 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 16797503-16798633(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTATAGATAAGG
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SmilChr02G005126 Chr02 NC_080388.1:72733538-72733550promoter 内 3607-3619 bp - 382 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 72733932-72743060(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTAATTT
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SmilChr01G003693 Chr01 NC_080387.1:55296219-55296231promoter 内 2736-2748 bp - 1253 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 55297484-55299992(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGCACC
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SmilChr01G001043 Chr01 NC_080387.1:21679386-21679398promoter 内 2514-2526 bp - 1475 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 21673892-21677911(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCAGCGGATAAGG