转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 24 / 134 下载 TSV

上一页 24 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000922 Chr01 NC_080387.1:19555519-19555533promoter 内 3847-3861 bp - 140 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 19555673-19556946(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTAATTTT
SmilChr02G003146 Chr02 NC_080388.1:52481572-52481586promoter 内 3548-3562 bp + 439 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 52480406-52481133(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATCGTAATC
SmilChr03G002465 Chr03 NC_080389.1:39104202-39104216promoter 内 3540-3554 bp - 447 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 39103129-39103755(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTTGGTGATGATTAC
SmilChr03G002207 Chr03 NC_080389.1:34772146-34772160promoter 内 3504-3518 bp + 483 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 34772643-34776230(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGGGATAATGATTAT
SmilChr01G003817 Chr01 NC_080387.1:56529765-56529779promoter 内 3501-3515 bp + 486 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 56527129-56529279(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACCATCATTAGCTTT
SmilChr01G004866 Chr01 NC_080387.1:66786049-66786063promoter 内 3451-3465 bp + 536 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 66786599-66790422(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATTATAATGATTGT
SmilChr01G003849 Chr01 NC_080387.1:56792807-56792821promoter 内 3406-3420 bp - 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 56793402-56795438(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACCATCATTAGCTTT
SmilChr01G001724 Chr01 NC_080387.1:32917724-32917738promoter 内 3397-3411 bp + 590 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 31775044-32917134(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTAATTTT
SmilChr02G000757 Chr02 NC_080388.1:12343908-12343922promoter 内 3088-3102 bp + 899 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 12340144-12343009(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTACATAA
SmilChr02G000179 Chr02 NC_080388.1:2285901-2285915promoter 内 3007-3021 bp - 980 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 2286895-2288286(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATTAAT
SmilChr03G000733 Chr03 NC_080389.1:8287475-8287489promoter 内 2891-2905 bp - 1096 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 8264709-8286379(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATATATAATGATTAT
SmilChr01G001462 Chr01 NC_080387.1:28427529-28427543promoter 内 2865-2879 bp + 1122 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 28428665-28432876(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAGCTAATGATGAT
SmilChr01G003191 Chr01 NC_080387.1:50654350-50654364promoter 内 2751-2765 bp + 1236 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 50648992-50653114(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTGTCTTT
SmilChr02G003702 Chr02 NC_080388.1:58495924-58495938promoter 内 2730-2744 bp - 1257 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 58486939-58494667(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTGATAATGATGGT
SmilChr03G000821 Chr03 NC_080389.1:9412538-9412552promoter 内 2562-2576 bp + 1425 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 9405709-9411113(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTGCATAT
SmilChr01G005373 Chr01 NC_080387.1:70955198-70955212promoter 内 2410-2424 bp + 1577 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 70956789-70962209(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAGGATAATGATTAT
SmilChr02G004993 Chr02 NC_080388.1:71786245-71786259promoter 内 2309-2323 bp + 1678 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 71782204-71784567(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATCATA
SmilChr01G003025 Chr01 NC_080387.1:49309911-49309925promoter 内 2123-2137 bp + 1864 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 49303042-49308047(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATATTA
SmilChr01G004454 Chr01 NC_080387.1:62667609-62667623promoter 内 1890-1904 bp + 2097 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 62661573-62665512(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCGCAATT
SmilChr01G001800 Chr01 NC_080387.1:32917724-32917738promoter 内 1743-1757 bp + 2244 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 32914803-32915480(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTAATTTT
SmilChr01G006112 Chr01 NC_080387.1:76655422-76655436promoter 内 1729-1743 bp + 2258 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 76657694-76660224(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAACTAATGATGGC
SmilChr01G001559 Chr01 NC_080387.1:29620189-29620203promoter 内 1683-1697 bp + 2304 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 29622507-29624733(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAGACTAATGATTAT
SmilChr02G003703 Chr02 NC_080388.1:58495924-58495938promoter 内 1488-1502 bp - 2499 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 58498437-58502230(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACCATCATTATCACC
SmilChr02G005545 Chr02 NC_080388.1:75455251-75455265promoter 内 1475-1489 bp - 2512 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 75446144-75452739(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTTTATAATGATTAT
SmilChr01G001521 Chr01 NC_080387.1:29129903-29129917promoter 内 1206-1220 bp + 2781 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 29132698-29133306(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTATGTAATGATGAA
SmilChr01G001723 Chr01 NC_080387.1:31777700-31777714promoter 内 1078-1092 bp + 2909 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 31774114-31774791(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTAATTTT
SmilChr02G000190 Chr02 NC_080388.1:2371211-2371225promoter 内 1062-1076 bp - 2925 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 2366670-2368286(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAATTAATGATGAC
SmilChr01G006141 Chr01 NC_080387.1:76918928-76918942promoter 内 1042-1056 bp + 2945 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 76913729-76915983(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCATTTTT
SmilChr02G002096 Chr02 NC_080388.1:37610219-37610233promoter 内 640-654 bp + 3347 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 37613580-37615449(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAGATAATGATGAT
SmilChr03G001716 Chr03 NC_080389.1:23012189-23012203promoter 内 436-450 bp - 3551 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 23006394-23008638(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTTATAATGATGGC
SmilChr03G001541 Chr03 NC_080389.1:19316402-19316416promoter 内 338-352 bp - 3649 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 5 19308598-19312753(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTTTGTGATGATTAT
SmilChr01G000208 Chr01 NC_080387.1:3623924-3623938promoter 内 3133-3147 bp - 854 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 3616537-3623070(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAGATAATGATGAA
SmilChr02G002915 Chr02 NC_080388.1:49469814-49469828promoter 内 1501-1515 bp + 2486 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 49464290-49467328(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTATAATA
SmilChr02G001259 Chr02 NC_080388.1:23096014-23096028promoter 内 137-151 bp + 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 23089378-23092164(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCACAAAC
SmilChr02G003322 Chr02 NC_080388.1:54481307-54481321promoter 内 2874-2888 bp - 1113 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 54473930-54480194(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAAATAATGATTAA
SmilChr02G004145 Chr02 NC_080388.1:63775749-63775763promoter 内 2476-2490 bp + 1511 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 63770923-63774238(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATTCTT
SmilChr01G001583 Chr01 NC_080387.1:29849586-29849600promoter 内 1992-2006 bp - 1995 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 29846602-29847591(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGAATAATGATTAA
SmilChr01G003601 Chr01 NC_080387.1:54566608-54566622promoter 内 1801-1815 bp - 2186 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 54568808-54571642(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATTTTA
SmilChr01G004854 Chr01 NC_080387.1:66732384-66732398promoter 内 1744-1758 bp + 2243 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 66724952-66730141(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATCATCATC
SmilChr01G004856 Chr01 NC_080387.1:66732384-66732398promoter 内 1379-1393 bp + 2608 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 66735006-66735652(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATGATGATGATTAG
SmilChr02G001376 Chr02 NC_080388.1:26027700-26027714promoter 内 1172-1186 bp + 2815 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 26030529-26038866(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTTTGTGATGATTAT
SmilChr03G000574 Chr03 NC_080389.1:6237732-6237746promoter 内 795-809 bp - 3192 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 6240938-6243384(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCCATCATTATTATC
SmilChr01G002671 Chr01 NC_080387.1:44920769-44920783promoter 内 737-751 bp - 3250 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 44924033-44932239(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTACCAGG
SmilChr02G004146 Chr02 NC_080388.1:63775749-63775763promoter 内 542-556 bp + 3445 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 63779208-63782520(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGAATAATGATTAA
SmilChr02G000204 Chr02 NC_080388.1:2635188-2635202promoter 内 3887-3901 bp - 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 2632721-2635088(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAACTAATGATTAA
SmilChr03G001073 Chr03 NC_080389.1:12434140-12434154promoter 内 3830-3844 bp - 157 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 12434311-12436577(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCACCACT
SmilChr02G003431 Chr02 NC_080388.1:55546510-55546524promoter 内 3559-3573 bp - 428 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 55544934-55546082(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATCACAATGATTGC
SmilChr03G000405 Chr03 NC_080389.1:4413711-4413725promoter 内 3302-3316 bp + 685 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 4411547-4413026(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCACCACT
SmilChr03G000237 Chr03 NC_080389.1:2826048-2826062promoter 内 3220-3234 bp + 767 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 2823443-2825281(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCACCACT
SmilChr02G000267 Chr02 NC_080388.1:3468348-3468362promoter 内 3195-3209 bp + 792 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 3469154-3470115(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATATGTGATGATTAT