转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 31 / 134 下载 TSV

上一页 31 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004307 Chr01 NC_080387.1:61257776-61257788promoter 内 1862-1874 bp + 2127 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 4 61254262-61255649(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTAT
SmilChr01G004306 Chr01 NC_080387.1:61257776-61257788promoter 内 468-480 bp + 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 4 61252932-61254255(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTAT
SmilChr01G004025 Chr01 NC_080387.1:58658152-58658164promoter 内 3415-3427 bp - 574 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 58656647-58657578(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAAAAAGATAAGG
SmilChr02G002646 Chr02 NC_080388.1:45852257-45852269promoter 内 2962-2974 bp - 1027 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 45853296-45855741(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTTG
SmilChr02G002601 Chr02 NC_080388.1:45150516-45150528promoter 内 2940-2952 bp - 1049 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 45151577-45154195(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTTG
SmilChr01G002162 Chr01 NC_080387.1:37628463-37628475promoter 内 2797-2809 bp - 1192 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 37629667-37631655(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTACA
SmilChr03G000277 Chr03 NC_080389.1:3159275-3159287promoter 内 2401-2413 bp - 1588 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 3155663-3157687(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGAATGGATAAGA
SmilChr03G001104 Chr03 NC_080389.1:12719710-12719722promoter 内 2396-2408 bp + 1593 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 12721315-12723204(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCAATGGATAAGG
SmilChr02G000249 Chr02 NC_080388.1:3219492-3219504promoter 内 1342-1354 bp + 2647 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 3211379-3216845(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAAAGA
SmilChr02G001289 Chr02 NC_080388.1:23718368-23718380promoter 内 1169-1181 bp - 2820 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 23721200-23724166(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGAAAC
SmilChr02G000125 Chr02 NC_080388.1:1702253-1702265promoter 内 968-980 bp + 3021 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 1705286-1708522(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTTGGATAAGA
SmilChr03G000084 Chr03 NC_080389.1:977477-977489promoter 内 866-878 bp - 3123 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 973231-974354(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTTCAGATAAGG
SmilChr02G005194 Chr02 NC_080388.1:73212377-73212389promoter 内 779-791 bp + 3210 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 73208114-73209167(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCATACC
SmilChr03G002180 Chr03 NC_080389.1:33889287-33889299promoter 内 3900-3912 bp - 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 33889388-33890394(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTAT
SmilChr01G005452 Chr01 NC_080387.1:71574478-71574490promoter 内 3830-3842 bp - 159 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 71570016-71574319(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTAAGGATAAGA
SmilChr01G004885 Chr01 NC_080387.1:66915397-66915409promoter 内 3566-3578 bp - 423 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 66915832-66919325(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CGTTATCCAAAAC
SmilChr01G002842 Chr01 NC_080387.1:46987941-46987953promoter 内 3426-3438 bp + 563 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 46988516-46992084(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTTCAGATAAGG
SmilChr03G000729 Chr03 NC_080389.1:8213139-8213151promoter 内 3191-3203 bp + 798 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 8211273-8212341(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTATCC
SmilChr02G005229 Chr02 NC_080388.1:73495089-73495101promoter 内 3178-3190 bp + 811 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 73485092-73494278(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAAACA
SmilChr01G000683 Chr01 NC_080387.1:15198285-15198297promoter 内 3091-3103 bp + 898 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 15178556-15197387(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGTTAC
SmilChr03G000877 Chr03 NC_080389.1:9950146-9950158promoter 内 3038-3050 bp - 951 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 9951109-9955430(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTATTG
SmilChr01G000422 Chr01 NC_080387.1:8482298-8482310promoter 内 2997-3009 bp - 992 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 8472285-8481306(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAAAAGATAAGG
SmilChr02G002825 Chr02 NC_080388.1:48354326-48354338promoter 内 2934-2946 bp + 1055 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 48355393-48357723(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTAATGGATAACG
SmilChr02G002824 Chr02 NC_080388.1:48354326-48354338promoter 内 2668-2680 bp + 1321 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 48351833-48353005(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CGTTATCCATTAC
SmilChr02G001795 Chr02 NC_080388.1:32720549-32720561promoter 内 2558-2570 bp - 1431 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 32721992-32722846(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATGTT
SmilChr01G000232 Chr01 NC_080387.1:4388630-4388642promoter 内 2502-2514 bp + 1487 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 4385411-4387143(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTATTA
SmilChr03G002181 Chr03 NC_080389.1:33889287-33889299promoter 内 2498-2510 bp - 1491 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 33890790-33894444(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTAT
SmilChr03G001472 Chr03 NC_080389.1:17563580-17563592promoter 内 2400-2412 bp - 1589 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 17560909-17561991(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAGTGGATAATG
SmilChr01G001705 Chr01 NC_080387.1:31485107-31485119promoter 内 2278-2290 bp - 1711 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 31481695-31483396(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAAAAGATAAGG
SmilChr03G000876 Chr03 NC_080389.1:9950146-9950158promoter 内 2194-2206 bp - 1795 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 9944069-9948351(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAATAGGATAAGA
SmilChr03G000357 Chr03 NC_080389.1:4013632-4013644promoter 内 1851-1863 bp + 2138 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 4007968-4011494(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTAAAAG
SmilChr03G000253 Chr03 NC_080389.1:2997154-2997166promoter 内 1787-1799 bp - 2202 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 2993546-2994952(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGAATGGATAAGA
SmilChr01G002215 Chr01 NC_080387.1:38482408-38482420promoter 内 1693-1705 bp + 2296 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 38484716-38489024(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTGGTGGATAAGG
SmilChr01G002231 Chr01 NC_080387.1:38791857-38791869promoter 内 1687-1699 bp + 2302 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 38794171-38798479(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTGGTGGATAAGG
SmilChr02G003164 Chr02 NC_080388.1:52680814-52680826promoter 内 1387-1399 bp + 2602 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 52675067-52678212(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTATTA
SmilChr02G001794 Chr02 NC_080388.1:32720549-32720561promoter 内 1191-1203 bp - 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 32714814-32717751(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AACATGGATAAGG
SmilChr03G000584 Chr03 NC_080389.1:6508350-6508362promoter 内 1044-1056 bp - 2945 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 6504695-6505405(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGATAAGATAAGG
SmilChr01G002587 Chr01 NC_080387.1:44015862-44015874promoter 内 913-925 bp + 3076 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 44006619-44012786(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTAT
SmilChr01G000095 Chr01 NC_080387.1:1699398-1699410promoter 内 800-812 bp + 3189 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 1694350-1696209(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATGTT
SmilChr03G001650 Chr03 NC_080389.1:21427758-21427770promoter 内 246-258 bp + 3743 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 21431513-21432404(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAAAAGATAAGG
SmilChr01G003013 Chr01 NC_080387.1:49165196-49165208promoter 内 227-239 bp - 3762 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 49168970-49169650(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTAT
SmilChr03G000509 Chr03 NC_080389.1:5485408-5485420promoter 内 199-211 bp - 3790 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 5489210-5490217(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTTAGA
SmilChr03G000983 Chr03 NC_080389.1:11143212-11143224promoter 内 171-183 bp - 3818 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 11147042-11148049(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTTAGA
SmilChr02G001881 Chr02 NC_080388.1:34127447-34127459promoter 内 3943-3955 bp - 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 34127505-34128953(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATGTT
SmilChr02G002873 Chr02 NC_080388.1:48972439-48972451promoter 内 3900-3912 bp - 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 48969672-48972350(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTGGTGGATAAGG
SmilChr03G000196 Chr03 NC_080389.1:2222811-2222823promoter 内 3889-3901 bp - 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 2222923-2228958(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATTCA
SmilChr02G002987 Chr02 NC_080388.1:50503182-50503194promoter 内 3855-3867 bp + 134 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 50503328-50506990(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTGGTGGATAAGG
SmilChr03G000886 Chr03 NC_080389.1:10114372-10114384promoter 内 3606-3618 bp + 383 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 10111702-10113989(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTAT
SmilChr01G004816 Chr01 NC_080387.1:66342797-66342809promoter 内 3568-3580 bp + 421 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 66343230-66345748(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAAAAAGATAAGG
SmilChr02G003498 Chr02 NC_080388.1:56203326-56203338promoter 内 3519-3531 bp - 470 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 56202295-56202856(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTGAGGATAAGC