转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 39 / 143 下载 TSV

上一页 39 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G004069 Chr04 NC_080390.1:55791857-55791868promoter 内 1826-1837 bp - 2164 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 55794032-55796974(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCAG
SmilChr06G000024 Chr06 NC_080392.1:265861-265872promoter 内 1752-1763 bp + 2238 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 268110-270508(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCGA
SmilChr04G003289 Chr04 NC_080390.1:49576363-49576374promoter 内 1746-1757 bp + 2244 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 49571951-49574119(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCGC
SmilChr06G002754 Chr06 NC_080392.1:40084997-40085008promoter 内 1425-1436 bp + 2565 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 40087573-40111467(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCGA
SmilChr04G000433 Chr04 NC_080390.1:4599551-4599562promoter 内 1344-1355 bp + 2646 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 4602208-4604343(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTATG
SmilChr07G004099 Chr07 NC_080393.1:52561393-52561404promoter 内 1186-1197 bp + 2804 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 52564208-52566731(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTAGT
SmilChr03G001201 Chr03 NC_080389.1:13849610-13849621promoter 内 1162-1173 bp - 2828 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 13852449-13853402(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCAC
SmilChr02G001486 Chr02 NC_080388.1:27834054-27834065promoter 内 986-997 bp + 3004 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 27837069-27839080(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCGA
SmilChr02G003848 Chr02 NC_080388.1:60215839-60215850promoter 内 985-996 bp + 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 60218855-60219814(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCGA
SmilChr05G003772 Chr05 NC_080391.1:51057601-51057612promoter 内 945-956 bp + 3045 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 51060657-51062234(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCGA
SmilChr03G004608 Chr03 NC_080389.1:63828114-63828125promoter 内 910-921 bp - 3080 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 63824041-63825034(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGTG
SmilChr04G002372 Chr04 NC_080390.1:38219067-38219078promoter 内 881-892 bp - 3109 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 38222187-38234717(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAG
SmilChr01G003750 Chr01 NC_080387.1:55871435-55871446promoter 内 864-875 bp - 3126 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 55874572-55875555(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCGC
SmilChr06G003124 Chr06 NC_080392.1:44108725-44108736promoter 内 777-788 bp - 3213 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 44093385-44105512(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGTG
SmilChr02G004528 Chr02 NC_080388.1:67865792-67865803promoter 内 677-688 bp + 3313 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 67869116-67873893(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCAC
SmilChr02G005126 Chr02 NC_080388.1:72730504-72730515promoter 内 573-584 bp - 3417 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 72733932-72743060(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCGC
SmilChr01G000480 Chr01 NC_080387.1:9873277-9873288promoter 内 372-383 bp - 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 9876906-9879740(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCTT
SmilChr08G001966 Chr08 NC_080394.1:17344467-17344478promoter 内 273-284 bp - 3717 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 17348195-17353428(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCAC
SmilChr02G002694 Chr02 NC_080388.1:46669835-46669846promoter 内 243-254 bp - 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 46673593-46680047(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAT
SmilChr03G001198 Chr03 NC_080389.1:13810619-13810630promoter 内 176-187 bp + 3814 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 13814444-13815013(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCGA
SmilChr07G004597 Chr07 NC_080393.1:58767503-58767514promoter 内 84-95 bp - 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 58760805-58763597(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCGA
SmilChr02G000801 Chr02 NC_080388.1:13397566-13397577promoter 内 2796-2807 bp + 1194 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 13392078-13396372(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr03G002112 Chr03 NC_080389.1:32866917-32866928promoter 内 2325-2336 bp + 1665 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 32862369-32865252(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr07G003369 Chr07 NC_080393.1:36293193-36293204promoter 内 130-141 bp + 3860 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 36297064-36298039(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGTA
SmilChr03G001729 Chr03 NC_080389.1:23242881-23242892promoter 内 3543-3554 bp + 447 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 23241387-23242434(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr02G001353 Chr02 NC_080388.1:25296440-25296451promoter 内 1996-2007 bp - 1994 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 25292448-25294446(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGTA
SmilChr07G003357 Chr07 NC_080393.1:36058571-36058582promoter 内 1649-1660 bp + 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 36054366-36056230(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr04G001206 Chr04 NC_080390.1:18658065-18658076promoter 内 1533-1544 bp - 2457 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 18660533-18661421(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr04G003579 Chr04 NC_080390.1:52212666-52212677promoter 内 3918-3929 bp - 72 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 52212749-52216297(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAC
SmilChr05G002161 Chr05 NC_080391.1:22852890-22852901promoter 内 3447-3458 bp + 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 22845596-22852347(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr06G002816 Chr06 NC_080392.1:40866402-40866413promoter 内 3195-3206 bp - 795 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 40867208-40869335(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCCG
SmilChr05G003075 Chr05 NC_080391.1:38819588-38819599promoter 内 3020-3031 bp - 970 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 38816599-38818618(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGTA
SmilChr06G002234 Chr06 NC_080392.1:31610234-31610245promoter 内 2995-3006 bp - 995 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 31607576-31609239(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGTA
SmilChr01G000455 Chr01 NC_080387.1:9256735-9256746promoter 内 2929-2940 bp - 1061 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 9247288-9255674(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGTA
SmilChr06G002587 Chr06 NC_080392.1:37077495-37077506promoter 内 2861-2872 bp - 1129 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 37075459-37076366(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGTA
SmilChr04G000829 Chr04 NC_080390.1:10446818-10446829promoter 内 2637-2648 bp - 1353 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 10448182-10451174(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr01G005185 Chr01 NC_080387.1:69567889-69567900promoter 内 2559-2570 bp - 1431 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 69569331-69575575(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr01G001352 Chr01 NC_080387.1:26800351-26800362promoter 内 2238-2249 bp + 1752 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 26794181-26798599(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAC
SmilChr01G000259 Chr01 NC_080387.1:4967095-4967106promoter 内 2089-2100 bp + 1901 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 4969007-4969875(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGTA
SmilChr04G001012 Chr04 NC_080390.1:14113023-14113034promoter 内 1896-1907 bp - 2094 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 14115128-14116548(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr06G000764 Chr06 NC_080392.1:7122467-7122478promoter 内 1861-1872 bp + 2129 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 7109058-7120338(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr08G000999 Chr08 NC_080394.1:7511531-7511542promoter 内 1618-1629 bp - 2372 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 7513914-7520777(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGAGT
SmilChr01G000268 Chr01 NC_080387.1:5189904-5189915promoter 内 1455-1466 bp - 2535 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 5192450-5194560(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr06G001884 Chr06 NC_080392.1:22480926-22480937promoter 内 1390-1401 bp - 2600 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 22483537-22505151(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr03G002168 Chr03 NC_080389.1:33726075-33726086promoter 内 1327-1338 bp + 2663 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 33722564-33723412(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr02G001053 Chr02 NC_080388.1:18777857-18777868promoter 内 1186-1197 bp - 2804 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 18780672-18786763(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr01G005186 Chr01 NC_080387.1:69567889-69567900promoter 内 1173-1184 bp - 2817 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 69570717-69574197(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTG
SmilChr02G001653 Chr02 NC_080388.1:30691293-30691304promoter 内 1156-1167 bp + 2834 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 30686091-30688459(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCCG
SmilChr04G001181 Chr04 NC_080390.1:17911657-17911668promoter 内 950-961 bp + 3040 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 17914708-17915253(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGTA
SmilChr01G000223 Chr01 NC_080387.1:3958889-3958900promoter 内 855-866 bp - 3135 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 3953812-3955754(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGTA