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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 53 / 151 下载 TSV

上一页 53 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002741 Chr01 NC_080387.1:45714155-45714167promoter 内 3798-3810 bp - 191 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 45714358-45719100(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACATTAGGTAAA
SmilChr04G002528 Chr04 NC_080390.1:40363141-40363153promoter 内 3742-3754 bp - 247 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 40362097-40362894(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTACCTACTGCA
SmilChr04G000253 Chr04 NC_080390.1:2304683-2304695promoter 内 3651-3663 bp + 338 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 2305033-2307170(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATACG
SmilChr01G002683 Chr01 NC_080387.1:45044264-45044276promoter 内 2909-2921 bp + 1080 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 45041871-45043184(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTAAT
SmilChr01G002676 Chr01 NC_080387.1:44970715-44970727promoter 内 2664-2676 bp + 1325 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 44962530-44969390(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTAAT
SmilChr05G000448 Chr05 NC_080391.1:3400640-3400652promoter 内 2037-2049 bp + 1952 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 3402604-3405141(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCAACCTACCCCT
SmilChr05G000447 Chr05 NC_080391.1:3400640-3400652promoter 内 1778-1790 bp + 2211 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 3394795-3398429(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGGGTAGGTTGG
SmilChr02G004844 Chr02 NC_080388.1:70568400-70568412promoter 内 1737-1749 bp - 2252 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 70570664-70571957(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACATTAGGTAAA
SmilChr02G005068 Chr02 NC_080388.1:72347448-72347460promoter 内 1538-1550 bp + 2451 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 72342434-72344997(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTGGTAGGTGCA
SmilChr02G002082 Chr02 NC_080388.1:37407116-37407128promoter 内 1289-1301 bp + 2700 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 37393825-37404416(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGGGTAGGTTGG
SmilChr04G002979 Chr04 NC_080390.1:46203729-46203741promoter 内 1042-1054 bp - 2947 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 46193167-46200782(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAATTAA
SmilChr01G001203 Chr01 NC_080387.1:24255823-24255835promoter 内 891-903 bp + 3098 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 24250444-24252725(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACATTAGGTAAA
SmilChr04G003546 Chr04 NC_080390.1:51821260-51821272promoter 内 605-617 bp - 3384 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 51811688-51817876(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAATAAA
SmilChr04G002530 Chr04 NC_080390.1:40363141-40363153promoter 内 454-466 bp - 3535 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 40366688-40368533(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCAGTAGGTAGC
SmilChr01G001929 Chr01 NC_080387.1:34455878-34455890promoter 内 3982-3994 bp - 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 34455897-34457066(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACGTTAGGTAAC
SmilChr05G000078 Chr05 NC_080391.1:398117-398129promoter 内 3814-3826 bp + 175 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 397211-397942(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTAAT
SmilChr01G002646 Chr01 NC_080387.1:44771550-44771562promoter 内 3787-3799 bp + 202 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 44771764-44773241(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTACCTACTAAA
SmilChr04G002047 Chr04 NC_080390.1:33207671-33207683promoter 内 3731-3743 bp + 258 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 33207941-33210377(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATATG
SmilChr04G003885 Chr04 NC_080390.1:54678097-54678109promoter 内 3725-3737 bp + 264 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 54674283-54677833(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACATTAGGTAAA
SmilChr05G001227 Chr05 NC_080391.1:10360283-10360295promoter 内 3670-3682 bp - 319 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 10358360-10359964(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTACCTACTAAA
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SmilChr01G005287 Chr01 NC_080387.1:70220298-70220310promoter 内 3212-3224 bp + 777 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 70221087-70222094(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACCATA
SmilChr03G003591 Chr03 NC_080389.1:54564253-54564265promoter 内 3207-3219 bp - 782 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 54565047-54570287(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGGGTAGGTGTG
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SmilChr05G001228 Chr05 NC_080391.1:10360283-10360295promoter 内 3039-3051 bp - 950 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 10361245-10361646(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTAGTAGGTAGC
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SmilChr01G002088 Chr01 NC_080387.1:36863395-36863407promoter 内 2818-2830 bp + 1171 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 36861484-36862224(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTAGT
SmilChr01G002992 Chr01 NC_080387.1:48836146-48836158promoter 内 2777-2789 bp - 1212 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 48837370-48838063(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATATTAGGTAAA
SmilChr04G004022 Chr04 NC_080390.1:55454918-55454930promoter 内 2756-2768 bp - 1233 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 55456163-55456854(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAATTAGGTAAG
SmilChr05G001061 Chr05 NC_080391.1:8769281-8769293promoter 内 2722-2734 bp - 1267 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 8770560-8774801(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTAGT
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SmilChr02G001126 Chr02 NC_080388.1:20409905-20409917promoter 内 2653-2665 bp - 1336 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 20403583-20408569(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACCATA
SmilChr02G004855 Chr02 NC_080388.1:70707704-70707716promoter 内 2527-2539 bp - 1462 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 70702516-70706242(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTACCTACTGCA
SmilChr01G002308 Chr01 NC_080387.1:40012587-40012599promoter 内 2300-2312 bp - 1689 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 40014288-40021864(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGGGTAGGTTGG
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SmilChr02G000244 Chr02 NC_080388.1:3146959-3146971promoter 内 2132-2144 bp - 1857 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 3148828-3151320(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTATTAGGTAAG
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SmilChr01G005288 Chr01 NC_080387.1:70220298-70220310promoter 内 1600-1612 bp + 2389 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 70222699-70224075(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACCATA
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SmilChr01G004431 Chr01 NC_080387.1:62419778-62419790promoter 内 1510-1522 bp + 2479 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 62415542-62417299(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCGTTAGGTAAA
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SmilChr05G001060 Chr05 NC_080391.1:8769281-8769293promoter 内 1036-1048 bp - 2953 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 8762514-8766328(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCACA
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SmilChr04G003714 Chr04 NC_080390.1:53439381-53439393promoter 内 847-859 bp + 3142 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 53432832-53436239(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAGATTAGGTAAA
SmilChr01G006059 Chr01 NC_080387.1:76039334-76039346promoter 内 672-684 bp + 3317 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 76042663-76046903(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCATA