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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 55 / 134 下载 TSV

上一页 55 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000784 Chr03 NC_080389.1:8941901-8941913promoter 内 2266-2278 bp + 1723 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 8937178-8940178(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTACAT
SmilChr02G000387 Chr02 NC_080388.1:4806012-4806024promoter 内 1913-1925 bp + 2076 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 4808100-4810743(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGGATGGATAAGG
SmilChr01G004721 Chr01 NC_080387.1:65403444-65403456promoter 内 1893-1905 bp - 2096 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 65405552-65406580(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTATCTC
SmilChr01G000540 Chr01 NC_080387.1:11110528-11110540promoter 内 1598-1610 bp - 2391 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 11112931-11117794(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTCGGC
SmilChr03G001607 Chr03 NC_080389.1:20432272-20432284promoter 内 1110-1122 bp - 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 20435163-20436275(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTTGCT
SmilChr02G004050 Chr02 NC_080388.1:62838155-62838167promoter 内 1087-1099 bp - 2902 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 62833526-62835253(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTTGGATAAGA
SmilChr01G000322 Chr01 NC_080387.1:6321876-6321888promoter 内 985-997 bp + 3004 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 6324892-6328186(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAAGAGATAAGG
SmilChr02G004802 Chr02 NC_080388.1:70209949-70209961promoter 内 824-836 bp + 3165 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 70202246-70206784(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCATAC
SmilChr02G003169 Chr02 NC_080388.1:52705230-52705242promoter 内 618-630 bp + 3371 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 52708613-52716242(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCAAAAGATAAGG
SmilChr02G000305 Chr02 NC_080388.1:3844284-3844296promoter 内 572-584 bp + 3417 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 3847713-3851771(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTTCAAGATAAGG
SmilChr02G002260 Chr02 NC_080388.1:40036626-40036638promoter 内 469-481 bp - 3520 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 40040158-40046431(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCCAC
SmilChr01G005645 Chr01 NC_080387.1:72856977-72856989promoter 内 436-448 bp - 3553 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 72860542-72865349(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTCTC
SmilChr01G004778 Chr01 NC_080387.1:65952400-65952412promoter 内 338-350 bp + 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 65956063-65956945(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTATGGATAACA
SmilChr01G004904 Chr01 NC_080387.1:67106813-67106825promoter 内 239-251 bp + 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 67101257-67103063(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCGAATT
SmilChr03G000623 Chr03 NC_080389.1:6882745-6882757promoter 内 118-130 bp + 3871 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 6886628-6890764(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCCGAGGATAAGG
SmilChr01G001142 Chr01 NC_080387.1:23366321-23366333promoter 内 3973-3985 bp + 16 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 23363977-23366305(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCTAATT
SmilChr03G000651 Chr03 NC_080389.1:7240699-7240711promoter 内 3903-3915 bp + 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 7240797-7244004(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATTTTGATAAGG
SmilChr03G001148 Chr03 NC_080389.1:13246933-13246945promoter 内 3903-3915 bp - 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 13245752-13246847(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATTTTGATAAGG
SmilChr01G000786 Chr01 NC_080387.1:17137805-17137817promoter 内 3779-3791 bp - 210 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 17138027-17138815(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAACTC
SmilChr01G004872 Chr01 NC_080387.1:66833272-66833284promoter 内 3707-3719 bp + 282 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 66831346-66832990(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CGTTATCCAATAA
SmilChr02G000594 Chr02 NC_080388.1:8524803-8524815promoter 内 3681-3693 bp + 308 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 8523336-8524495(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTACTG
SmilChr01G002087 Chr01 NC_080387.1:36856070-36856082promoter 内 3667-3679 bp - 322 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 36856404-36857548(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTACTG
SmilChr02G000901 Chr02 NC_080388.1:15472254-15472266promoter 内 3664-3676 bp - 325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 15472591-15473370(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAACTC
SmilChr03G000542 Chr03 NC_080389.1:5887665-5887677promoter 内 3623-3635 bp - 366 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 5888043-5890586(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTCTC
SmilChr01G002878 Chr01 NC_080387.1:47380719-47380731promoter 内 3614-3626 bp - 375 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 47381106-47389482(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCACGTC
SmilChr01G000270 Chr01 NC_080387.1:5329272-5329284promoter 内 3552-3564 bp + 437 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 5329721-5330807(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAGAAGGATAAGA
SmilChr01G005106 Chr01 NC_080387.1:68852408-68852420promoter 内 3552-3564 bp - 437 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 68852857-68853840(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCCAC
SmilChr01G005070 Chr01 NC_080387.1:68586007-68586019promoter 内 3351-3363 bp + 638 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 68583423-68585369(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACAAG
SmilChr01G002195 Chr01 NC_080387.1:38108206-38108218promoter 内 3200-3212 bp + 789 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 38109007-38109480(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTAGGGATAAGA
SmilChr01G000352 Chr01 NC_080387.1:7327264-7327276promoter 内 3184-3196 bp + 805 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 7325434-7326459(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACAAG
SmilChr01G006188 Chr01 NC_080387.1:77419831-77419843promoter 内 3094-3106 bp + 895 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 77420738-77421968(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTATAGATAAGG
SmilChr01G000170 Chr01 NC_080387.1:2799916-2799928promoter 内 3027-3039 bp - 962 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 2800890-2804009(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTATAGT
SmilChr01G002448 Chr01 NC_080387.1:42069867-42069879promoter 内 2985-2997 bp - 1004 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 42070883-42073649(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCAATTT
SmilChr01G003546 Chr01 NC_080387.1:54045313-54045325promoter 内 2966-2978 bp - 1023 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 54046348-54049957(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAACTTT
SmilChr02G000902 Chr02 NC_080388.1:15484684-15484696promoter 内 2920-2932 bp - 1069 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 15482008-15483615(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTGGAAGATAAGG
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SmilChr01G001716 Chr01 NC_080387.1:31639627-31639639promoter 内 2558-2570 bp + 1431 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 31635137-31638196(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCCAC
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SmilChr03G000576 Chr03 NC_080389.1:6326798-6326810promoter 内 2277-2289 bp + 1712 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 6324433-6325086(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTAGAA
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SmilChr02G003971 Chr02 NC_080388.1:61881957-61881969promoter 内 2117-2129 bp + 1872 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 61879309-61880085(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCGAATT
SmilChr01G003821 Chr01 NC_080387.1:56548936-56548948promoter 内 1970-1982 bp + 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 56550967-56554598(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGCAAGGATAAGG
SmilChr03G002221 Chr03 NC_080389.1:34981240-34981252promoter 内 1687-1699 bp - 2302 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 34983554-35016343(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTATCTC
SmilChr01G003126 Chr01 NC_080387.1:50069968-50069980promoter 内 1676-1688 bp + 2313 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 50072293-50074276(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAGATAGATAAGG
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SmilChr02G002047 Chr02 NC_080388.1:36864476-36864488promoter 内 1588-1600 bp - 2401 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 36866889-36867572(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCATAAC