转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 58 / 149 下载 TSV

上一页 58 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002941 Chr01 NC_080387.1:48187989-48187999promoter 内 2154-2164 bp - 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 48189836-48193856(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr02G000641 Chr02 NC_080388.1:9701462-9701472promoter 内 2071-2081 bp - 1920 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 9703392-9706749(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr01G005509 Chr01 NC_080387.1:71946471-71946481promoter 内 2037-2047 bp + 1954 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 71948435-71949956(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGAG
SmilChr05G000974 Chr05 NC_080391.1:7876078-7876088promoter 内 2034-2044 bp + 1957 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 7878045-7879089(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAGGCTGTCA
SmilChr05G003928 Chr05 NC_080391.1:53033053-53033063promoter 内 2030-2040 bp + 1961 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 53030224-53031092(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr04G003835 Chr04 NC_080390.1:54402313-54402323promoter 内 2016-2026 bp - 1975 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 54390377-54400338(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCT
SmilChr01G002284 Chr01 NC_080387.1:39629420-39629430promoter 内 2011-2021 bp - 1980 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 39631410-39633211(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr01G002458 Chr01 NC_080387.1:42200644-42200654promoter 内 2011-2021 bp + 1980 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 42202634-42205023(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr05G001099 Chr05 NC_080391.1:9150785-9150795promoter 内 2001-2011 bp - 1990 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 9152785-9157046(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr02G001242 Chr02 NC_080388.1:22811018-22811028promoter 内 1991-2001 bp + 2000 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 22805990-22809018(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr02G001566 Chr02 NC_080388.1:29046816-29046826promoter 内 1984-1994 bp + 2007 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 29033101-29044809(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGC
SmilChr02G005143 Chr02 NC_080388.1:72840358-72840368promoter 内 1949-1959 bp - 2042 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 72835906-72838316(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCG
SmilChr01G004749 Chr01 NC_080387.1:65659320-65659330promoter 内 1934-1944 bp + 2057 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 65661387-65669695(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr04G001662 Chr04 NC_080390.1:27595467-27595477promoter 内 1878-1888 bp - 2113 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 27592220-27593354(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAGGCTGTCA
SmilChr04G001469 Chr04 NC_080390.1:24119543-24119553promoter 内 1837-1847 bp - 2154 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 24121707-24130736(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTT
SmilChr06G002542 Chr06 NC_080392.1:36461882-36461892promoter 内 1836-1846 bp + 2155 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 36458841-36459727(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGAC
SmilChr01G005854 Chr01 NC_080387.1:74484980-74484990promoter 内 1815-1825 bp - 2176 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 74487166-74489373(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTT
SmilChr02G005035 Chr02 NC_080388.1:72063752-72063762promoter 内 1813-1823 bp + 2178 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 72059711-72061574(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGG
SmilChr05G002348 Chr05 NC_080391.1:25460194-25460204promoter 内 1806-1816 bp - 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 25462389-25464809(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr01G001158 Chr01 NC_080387.1:23538164-23538174promoter 内 1695-1705 bp + 2296 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 23531645-23535868(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTT
SmilChr04G001952 Chr04 NC_080390.1:31720083-31720093promoter 内 1612-1622 bp - 2379 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 31722472-31724124(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTT
SmilChr01G004348 Chr01 NC_080387.1:61641866-61641876promoter 内 1565-1575 bp - 2426 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 61644302-61653705(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGG
SmilChr06G001733 Chr06 NC_080392.1:19972045-19972055promoter 内 1557-1567 bp + 2434 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 19974489-19975753(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCG
SmilChr02G002244 Chr02 NC_080388.1:39860293-39860303promoter 内 1538-1548 bp - 2453 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 39856971-39857840(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCT
SmilChr06G000109 Chr06 NC_080392.1:774999-775009promoter 内 1524-1534 bp - 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 767355-772532(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCC
SmilChr06G003148 Chr06 NC_080392.1:44507229-44507239promoter 内 1504-1514 bp + 2487 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 44502839-44504742(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTT
SmilChr05G002745 Chr05 NC_080391.1:31614494-31614504promoter 内 1497-1507 bp - 2494 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 31616998-31619627(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr06G001717 Chr06 NC_080392.1:19786701-19786711promoter 内 1491-1501 bp + 2500 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 19781952-19784201(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr01G001233 Chr01 NC_080387.1:24759755-24759765promoter 内 1463-1473 bp - 2528 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 24762293-24763434(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr01G003081 Chr01 NC_080387.1:49652534-49652544promoter 内 1459-1469 bp + 2532 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 49647605-49650002(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr04G003049 Chr04 NC_080390.1:47036260-47036270promoter 内 1434-1444 bp + 2557 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 47038827-47043832(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr02G004221 Chr02 NC_080388.1:64421792-64421802promoter 内 1412-1422 bp + 2579 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 64424381-64430938(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr03G002965 Chr03 NC_080389.1:46395624-46395634promoter 内 1390-1400 bp + 2601 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 46398235-46400041(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCT
SmilChr04G002397 Chr04 NC_080390.1:38530372-38530382promoter 内 1367-1377 bp + 2624 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 38524132-38527748(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr05G003249 Chr05 NC_080391.1:41859197-41859207promoter 内 1363-1373 bp - 2628 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 41861835-41865465(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr04G003166 Chr04 NC_080390.1:48274972-48274982promoter 内 1301-1311 bp - 2690 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 48267411-48272282(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr06G001486 Chr06 NC_080392.1:15825385-15825395promoter 内 1287-1297 bp + 2704 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 15828099-15837719(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr03G001839 Chr03 NC_080389.1:25223809-25223819promoter 内 1251-1261 bp - 2740 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 25226559-25230086(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr03G001838 Chr03 NC_080389.1:25212745-25212755promoter 内 1249-1259 bp - 2742 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 25215497-25218990(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr06G001427 Chr06 NC_080392.1:15112982-15112992promoter 内 1188-1198 bp + 2803 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 15105919-15110179(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
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SmilChr04G003272 Chr04 NC_080390.1:49413866-49413876promoter 内 1026-1036 bp + 2965 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 49408743-49410901(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr02G005598 Chr02 NC_080388.1:75712624-75712634promoter 内 1012-1022 bp - 2979 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 75708951-75709645(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGAG
SmilChr07G001751 Chr07 NC_080393.1:14851251-14851261promoter 内 979-989 bp - 3012 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 14837466-14848239(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCG
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SmilChr02G000088 Chr02 NC_080388.1:1147209-1147219promoter 内 922-932 bp - 3069 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 1143230-1144140(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCG
SmilChr02G001592 Chr02 NC_080388.1:29694965-29694975promoter 内 921-931 bp + 3070 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 29688601-29691895(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr05G000887 Chr05 NC_080391.1:7011446-7011456promoter 内 913-923 bp + 3078 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 7014534-7015857(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCG