转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 6 / 136 下载 TSV

上一页 6 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G003158 Chr06 NC_080392.1:44556551-44556561promoter 内 1468-1478 bp - 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 44559084-44560064(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGGC
SmilChr05G001157 Chr05 NC_080391.1:9692576-9692586promoter 内 1428-1438 bp + 2563 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 9695149-9695233(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCG
SmilChr03G000993 Chr03 NC_080389.1:11308340-11308350promoter 内 1379-1389 bp + 2612 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 11302850-11305728(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr06G000014 Chr06 NC_080392.1:295474-295484promoter 内 1323-1333 bp - 2668 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 235464-292806(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGGG
SmilChr03G001926 Chr03 NC_080389.1:27024108-27024118promoter 内 1298-1308 bp + 2693 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 27018285-27021415(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCA
SmilChr01G000105 Chr01 NC_080387.1:1842279-1842289promoter 内 1257-1267 bp + 2734 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 1837296-1839545(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGGC
SmilChr08G003332 Chr08 NC_080394.1:34619676-34619686promoter 内 1196-1206 bp + 2795 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 34622481-34624715(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCG
SmilChr06G000028 Chr06 NC_080392.1:295474-295484promoter 内 1112-1122 bp - 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 290243-292595(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGGG
SmilChr05G002005 Chr05 NC_080391.1:20748976-20748986promoter 内 1090-1100 bp + 2901 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 20751887-20755958(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr07G004603 Chr07 NC_080393.1:58837578-58837588promoter 内 1074-1084 bp - 2917 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 58840505-58844564(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCA
SmilChr02G004743 Chr02 NC_080388.1:69651002-69651012promoter 内 981-991 bp - 3010 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 69644540-69647992(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCG
SmilChr02G002619 Chr02 NC_080388.1:45506915-45506925promoter 内 914-924 bp + 3077 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 45500653-45503838(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCA
SmilChr07G004326 Chr07 NC_080393.1:55828729-55828739promoter 内 817-827 bp + 3174 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 55822442-55825555(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr07G004378 Chr07 NC_080393.1:56313787-56313797promoter 内 803-813 bp - 3188 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 56316985-56320063(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr06G000991 Chr06 NC_080392.1:9784908-9784918promoter 内 800-810 bp - 3191 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 9788109-9789554(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr02G004744 Chr02 NC_080388.1:69651002-69651012promoter 内 798-808 bp - 3193 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 69654205-69656876(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCA
SmilChr06G002161 Chr06 NC_080392.1:29686249-29686259promoter 内 743-753 bp + 3248 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 29682095-29683001(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr05G001155 Chr05 NC_080391.1:9692576-9692586promoter 内 691-701 bp + 3300 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 9686438-9689276(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCA
SmilChr06G000030 Chr06 NC_080392.1:295474-295484promoter 内 682-692 bp - 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 298793-301789(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGGC
SmilChr06G002499 Chr06 NC_080392.1:35881267-35881277promoter 内 340-350 bp + 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 35875595-35877616(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGGC
SmilChr03G001997 Chr03 NC_080389.1:29649567-29649577promoter 内 333-343 bp - 3658 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 29653235-29657533(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCA
SmilChr02G000887 Chr02 NC_080388.1:15275235-15275245promoter 内 25-35 bp - 3966 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 15279211-15279675(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr05G003914 Chr05 NC_080391.1:52862739-52862749promoter 内 1422-1432 bp - 2569 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 52859577-52860170(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGG
SmilChr04G002684 Chr04 NC_080390.1:42288282-42288292promoter 内 3871-3881 bp - 120 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 42285729-42288162(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGG
SmilChr08G001278 Chr08 NC_080394.1:10179832-10179842promoter 内 3594-3604 bp - 397 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 10180239-10182158(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGCT
SmilChr06G000224 Chr06 NC_080392.1:2050674-2050684promoter 内 3565-3575 bp - 426 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 1499006-2050248(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGG
SmilChr02G004074 Chr02 NC_080388.1:63026824-63026834promoter 内 2035-2045 bp + 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 63028790-63037407(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGG
SmilChr06G001131 Chr06 NC_080392.1:11354130-11354140promoter 内 1845-1855 bp + 2146 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 11356286-11358333(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGG
SmilChr01G005546 Chr01 NC_080387.1:72271893-72271903promoter 内 1155-1165 bp + 2836 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 72265015-72269057(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGCT
SmilChr05G002085 Chr05 NC_080391.1:21787758-21787768promoter 内 1098-1108 bp + 2893 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 21779712-21784865(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGCT
SmilChr05G000516 Chr05 NC_080391.1:3979677-3979687promoter 内 707-717 bp + 3284 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 3982971-3988809(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGG
SmilChr07G001074 Chr07 NC_080393.1:7905617-7905627promoter 内 620-630 bp + 3371 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 7900786-7902246(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGCT
SmilChr02G001944 Chr02 NC_080388.1:35060905-35060915promoter 内 311-321 bp + 3680 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 6 35064595-35070207(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCG
SmilChr06G000866 Chr06 NC_080392.1:8202939-8202949promoter 内 1496-1506 bp - 2495 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 8180435-8200444(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGCA
SmilChr01G005679 Chr01 NC_080387.1:73057136-73057146promoter 内 676-686 bp + 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 73060461-73061805(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCG
SmilChr03G001269 Chr03 NC_080389.1:14725534-14725544promoter 内 2835-2845 bp + 1156 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 14726700-14727998(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCG
SmilChr04G001633 Chr04 NC_080390.1:27096448-27096458promoter 内 828-838 bp + 3163 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 27088397-27093285(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCC
SmilChr02G003233 Chr02 NC_080388.1:53605597-53605607promoter 内 319-329 bp + 3672 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 53600462-53601925(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCC
SmilChr01G001291 Chr01 NC_080387.1:25694038-25694048promoter 内 2421-2431 bp - 1570 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 25689386-25692468(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCG
SmilChr02G003145 Chr02 NC_080388.1:52484727-52484737promoter 内 1583-1593 bp + 2408 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 52478208-52482319(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGT
SmilChr04G002065 Chr04 NC_080390.1:33380161-33380171promoter 内 1395-1405 bp - 2596 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 33375366-33377565(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGCA
SmilChr03G003812 Chr03 NC_080389.1:57168290-57168300promoter 内 1290-1300 bp + 2701 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 57162719-57165589(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCC
SmilChr05G001673 Chr05 NC_080391.1:15868211-15868221promoter 内 1264-1274 bp - 2727 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 15860542-15865484(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCG
SmilChr01G005680 Chr01 NC_080387.1:73076651-73076661promoter 内 1066-1076 bp + 2925 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 73072286-73073726(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGT
SmilChr02G003146 Chr02 NC_080388.1:52484727-52484737promoter 内 397-407 bp + 3594 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 52480406-52481133(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGT
SmilChr08G000917 Chr08 NC_080394.1:6783361-6783371promoter 内 54-64 bp + 3937 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 6787308-6789453(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGCA
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SmilChr02G000989 Chr02 NC_080388.1:17405559-17405569promoter 内 76-86 bp + 3915 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 4 17409484-17412883(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGGC
SmilChr03G003283 Chr03 NC_080389.1:50858691-50858701promoter 内 637-647 bp + 3354 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 50862055-50870593(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGGC
SmilChr03G003282 Chr03 NC_080389.1:50851812-50851822promoter 内 153-163 bp + 3838 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 50855660-50855766(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGGC