转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G001516; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019310-RA_Salv SmilChr01G001516 bZIP XP_057803325.1 MP00648 ACACGTGG

可能结合的靶基因

9939 个结合位点 6170 个候选靶基因 第 67 / 124 下载 TSV

上一页 67 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G003277 Chr06 NC_080392.1:45346857-45346864promoter 内 3927-3934 bp + 67 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 45346931-45354017(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr05G001285 Chr05 NC_080391.1:11000470-11000477promoter 内 3925-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 11000546-11003333(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr02G004034 Chr02 NC_080388.1:62633257-62633264promoter 内 3921-3928 bp - 73 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 62630314-62633184(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr03G002857 Chr03 NC_080389.1:45146997-45147004promoter 内 3921-3928 bp + 73 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 45147077-45165612(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr01G005065 Chr01 NC_080387.1:68547122-68547129promoter 内 3918-3925 bp - 76 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 68543297-68547046(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr05G000175 Chr05 NC_080391.1:1379944-1379951promoter 内 3915-3922 bp - 79 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 1376826-1379865(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr03G000031 Chr03 NC_080389.1:381758-381765promoter 内 3914-3921 bp - 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 379389-381678(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr04G003097 Chr04 NC_080390.1:47579212-47579219promoter 内 3913-3920 bp - 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 47577940-47579131(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr04G003349 Chr04 NC_080390.1:50116546-50116553promoter 内 3913-3920 bp - 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 50113305-50116465(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr07G000413 Chr07 NC_080393.1:2859402-2859409promoter 内 3912-3919 bp - 82 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 2855138-2859320(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr02G004612 Chr02 NC_080388.1:68651352-68651359promoter 内 3911-3918 bp - 83 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 68633935-68651269(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr04G004064 Chr04 NC_080390.1:55775854-55775861promoter 内 3908-3915 bp - 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 55775345-55775768(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr03G003468 Chr03 NC_080389.1:53126774-53126781promoter 内 3906-3913 bp + 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 53126869-53130043(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr04G003251 Chr04 NC_080390.1:49259807-49259814promoter 内 3901-3908 bp - 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 49256655-49259714(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr04G001966 Chr04 NC_080390.1:31888089-31888096promoter 内 3900-3907 bp + 94 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 31888190-31890819(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr01G000728 Chr01 NC_080387.1:16190528-16190535promoter 内 3898-3905 bp - 96 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 16188523-16190432(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr01G004984 Chr01 NC_080387.1:67890028-67890035promoter 内 3898-3905 bp - 96 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 67888541-67889932(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr01G002266 Chr01 NC_080387.1:39447878-39447885promoter 内 3897-3904 bp + 97 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 39447982-39450838(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr03G003691 Chr03 NC_080389.1:55852235-55852242promoter 内 3896-3903 bp + 98 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 55852340-55858688(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr01G004088 Chr01 NC_080387.1:59287607-59287614promoter 内 3893-3900 bp + 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 59287715-59289915(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr04G001181 Chr04 NC_080390.1:17914600-17914607promoter 内 3893-3900 bp + 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 17914708-17915253(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr04G001182 Chr04 NC_080390.1:17918723-17918730promoter 内 3893-3900 bp + 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 17918831-17919376(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr04G003601 Chr04 NC_080390.1:52451741-52451748promoter 内 3893-3900 bp - 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 52450900-52451640(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr03G002096 Chr03 NC_080389.1:32414728-32414735promoter 内 3892-3899 bp + 102 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 32414837-32415415(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr01G005657 Chr01 NC_080387.1:72917247-72917254promoter 内 3891-3898 bp + 103 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 72917357-72919095(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr03G003562 Chr03 NC_080389.1:54265498-54265505promoter 内 3891-3898 bp - 103 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 54260703-54265395(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr02G003005 Chr02 NC_080388.1:50693646-50693653promoter 内 3888-3895 bp - 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 50690724-50693540(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr06G001817 Chr06 NC_080392.1:21329024-21329031promoter 内 3888-3895 bp + 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 21329137-21332450(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr04G001684 Chr04 NC_080390.1:27874590-27874597promoter 内 3887-3894 bp - 107 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 27872470-27874483(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr03G001718 Chr03 NC_080389.1:23048322-23048329promoter 内 3886-3893 bp + 108 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 23048437-23049338(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr02G001540 Chr02 NC_080388.1:28663796-28663803promoter 内 3884-3891 bp + 110 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 28663913-28666472(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr05G004059 Chr05 NC_080391.1:54543421-54543428promoter 内 3880-3887 bp + 114 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 54543542-54546931(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr05G004141 Chr05 NC_080391.1:55373221-55373228promoter 内 3879-3886 bp - 115 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 55371173-55373106(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr02G004146 Chr02 NC_080388.1:63779084-63779091promoter 内 3877-3884 bp + 117 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 63779208-63782520(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr04G002906 Chr04 NC_080390.1:45324869-45324876promoter 内 3877-3884 bp + 117 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 45324993-45326126(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr01G004155 Chr01 NC_080387.1:60062759-60062766promoter 内 3874-3881 bp + 120 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 60062886-60068092(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr04G001676 Chr04 NC_080390.1:27777019-27777026promoter 内 3874-3881 bp + 120 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 27777146-27779100(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr03G001742 Chr03 NC_080389.1:23511250-23511257promoter 内 3873-3880 bp + 121 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 23511378-23515094(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr04G003401 Chr04 NC_080390.1:50567741-50567748promoter 内 3873-3880 bp + 121 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 50567869-50569304(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr01G001337 Chr01 NC_080387.1:26560273-26560280promoter 内 3869-3876 bp + 125 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 26560405-26567016(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr01G002963 Chr01 NC_080387.1:48522251-48522258promoter 内 3869-3876 bp - 125 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 48521423-48522126(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr03G000680 Chr03 NC_080389.1:7591781-7591788promoter 内 3869-3876 bp + 125 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 7591913-7594348(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr01G001103 Chr01 NC_080387.1:22576597-22576604promoter 内 3865-3872 bp - 129 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 22569983-22576468(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr05G000640 Chr05 NC_080391.1:4849162-4849169promoter 内 3862-3869 bp + 132 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 4849301-4850342(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr03G002237 Chr03 NC_080389.1:35251575-35251582promoter 内 3860-3867 bp - 134 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 35249368-35251441(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr01G002746 Chr01 NC_080387.1:45769612-45769619promoter 内 3858-3865 bp + 136 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 45769755-45771498(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr06G000068 Chr06 NC_080392.1:533360-533367promoter 内 3856-3863 bp + 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 533505-537233(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr01G001077 Chr01 NC_080387.1:22195691-22195698promoter 内 3853-3860 bp + 141 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 22195839-22202144(+) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr01G002810 Chr01 NC_080387.1:46655116-46655123promoter 内 3853-3860 bp - 141 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 46650825-46654975(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT
SmilChr06G001149 Chr06 NC_080392.1:11651547-11651554promoter 内 3852-3859 bp - 142 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 11650242-11651405(-) SMil_00019310-RA_Salv MP00648 ACACGTGT