转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 7 / 134 下载 TSV

上一页 7 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002057 Chr02 NC_080388.1:37045551-37045563promoter 内 2888-2900 bp + 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 37043521-37044450(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCTTC
SmilChr01G002429 Chr01 NC_080387.1:41831739-41831751promoter 内 2235-2247 bp - 1754 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 41833505-41837531(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCTTC
SmilChr03G000032 Chr03 NC_080389.1:404655-404667promoter 内 1746-1758 bp + 2243 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 399639-402412(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCTTC
SmilChr01G001120 Chr01 NC_080387.1:22824711-22824723promoter 内 2812-2824 bp - 1177 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 22825900-22826668(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACATA
SmilChr01G001455 Chr01 NC_080387.1:28237399-28237411promoter 内 2363-2375 bp - 1626 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 28239037-28242801(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATTAA
SmilChr01G002511 Chr01 NC_080387.1:43003248-43003260promoter 内 1598-1610 bp + 2391 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 43005651-43008379(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAGAAGATAAGG
SmilChr02G002845 Chr02 NC_080388.1:48591069-48591081promoter 内 731-743 bp + 3258 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 48594339-48599625(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTGTGGATAAGG
SmilChr01G001308 Chr01 NC_080387.1:26033212-26033224promoter 内 3622-3634 bp + 367 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 26033591-26035663(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATGTGGATAAGA
SmilChr01G004899 Chr01 NC_080387.1:67065487-67065499promoter 内 3473-3485 bp + 516 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 67057716-67064971(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTATTT
SmilChr02G000589 Chr02 NC_080388.1:8445715-8445727promoter 内 3104-3116 bp + 885 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 8446612-8447289(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATGTGGATAAGA
SmilChr02G004828 Chr02 NC_080388.1:70382246-70382258promoter 内 3025-3037 bp - 964 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 70383222-70384193(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCTTC
SmilChr01G002876 Chr01 NC_080387.1:47345327-47345339promoter 内 3024-3036 bp - 965 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 47346304-47347005(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACATA
SmilChr02G001021 Chr02 NC_080388.1:18038726-18038738promoter 内 2644-2656 bp - 1345 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 18031757-18037381(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAGAAGATAAGG
SmilChr03G001263 Chr03 NC_080389.1:14602636-14602648promoter 内 2460-2472 bp - 1529 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 14598107-14601107(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAGAAGATAAGG
SmilChr02G003236 Chr02 NC_080388.1:53633801-53633813promoter 内 1478-1490 bp + 2511 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 53636324-53638451(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTAATGGATAAGG
SmilChr02G004366 Chr02 NC_080388.1:65947318-65947330promoter 内 1317-1329 bp + 2672 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 65950002-65951101(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATGTGGATAAGA
SmilChr01G000248 Chr01 NC_080387.1:4673380-4673392promoter 内 1302-1314 bp + 2687 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 4670000-4670693(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACATA
SmilChr02G003987 Chr02 NC_080388.1:62122829-62122841promoter 内 1049-1061 bp + 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 62125781-62129586(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAGAAGATAAGG
SmilChr02G003863 Chr02 NC_080388.1:60578402-60578414promoter 内 877-889 bp + 3112 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 60574796-60575290(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCACAGC
SmilChr02G004826 Chr02 NC_080388.1:70382246-70382258promoter 内 785-797 bp - 3204 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 70369528-70379042(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAGAAGATAAGG
SmilChr03G000070 Chr03 NC_080389.1:829975-829987promoter 内 3573-3585 bp - 416 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 6 828588-829559(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAATTGGATAAGG
SmilChr03G001319 Chr03 NC_080389.1:15460423-15460435promoter 内 3319-3331 bp + 670 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 4 15458438-15459753(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTAAAT
SmilChr01G003200 Chr01 NC_080387.1:50788732-50788744promoter 内 3860-3872 bp + 129 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 50786783-50788603(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAAATC
SmilChr01G005034 Chr01 NC_080387.1:68290649-68290661promoter 内 2839-2851 bp - 1150 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 68288708-68289499(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATTTGGATAAGA
SmilChr02G000877 Chr02 NC_080388.1:15098719-15098731promoter 内 839-851 bp - 3150 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 15084624-15095569(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATTTGGATAAGA
SmilChr03G001434 Chr03 NC_080389.1:17022693-17022705promoter 内 599-611 bp + 3390 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 17026095-17027142(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATATAGATAAGG
SmilChr03G001753 Chr03 NC_080389.1:23809032-23809044promoter 内 3434-3446 bp + 555 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 23809599-23813666(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAGTGGATAAGA
SmilChr02G000888 Chr02 NC_080388.1:15295015-15295027promoter 内 2312-2324 bp - 1677 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 15289653-15293338(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATGTAGATAAGG
SmilChr01G000221 Chr01 NC_080387.1:3870177-3870189promoter 内 2085-2097 bp + 1904 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 3866939-3868273(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAAATC
SmilChr02G001683 Chr02 NC_080388.1:31070741-31070753promoter 内 746-758 bp - 3243 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 31066005-31067498(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAATTGGATAAGG
SmilChr02G003852 Chr02 NC_080388.1:60294028-60294040promoter 内 685-697 bp - 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 60290627-60290724(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATATTGGATAAGG
SmilChr03G000173 Chr03 NC_080389.1:1896611-1896623promoter 内 656-668 bp - 3333 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 1899956-1900505(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTACTAC
SmilChr01G001147 Chr01 NC_080387.1:23456304-23456316promoter 内 357-369 bp + 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 23437008-23452672(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAAATC
SmilChr03G001433 Chr03 NC_080389.1:17022693-17022705promoter 内 319-331 bp + 3670 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 17015322-17019023(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTATATC
SmilChr02G003454 Chr02 NC_080388.1:55820827-55820839promoter 内 32-44 bp - 3957 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 55824796-55826600(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACTTT
SmilChr01G003202 Chr01 NC_080387.1:50797354-50797366promoter 内 3941-3953 bp + 48 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 50795387-50797306(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAAATC
SmilChr01G005725 Chr01 NC_080387.1:73403635-73403647promoter 内 3858-3870 bp + 131 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 73403778-73406849(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATTTGGATAAGA
SmilChr02G001612 Chr02 NC_080388.1:30014861-30014873promoter 内 2989-3001 bp + 1000 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 30009153-30013861(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTATATC
SmilChr02G005603 Chr02 NC_080388.1:75735301-75735313promoter 内 2949-2961 bp - 1040 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 75736353-75739430(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGATTC
SmilChr02G001613 Chr02 NC_080388.1:30014861-30014873promoter 内 2926-2938 bp + 1063 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 30015936-30017916(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATATAGATAAGG
SmilChr02G002299 Chr02 NC_080388.1:40578582-40578594promoter 内 1750-1762 bp - 2239 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 40580833-40588306(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTATATC
SmilChr03G001715 Chr03 NC_080389.1:22978183-22978195promoter 内 1578-1590 bp + 2411 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 22980606-22980712(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAGTGGATAAGA
SmilChr02G003687 Chr02 NC_080388.1:58271463-58271475promoter 内 1525-1537 bp + 2464 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 58273939-58274025(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATTTGGATAAGA
SmilChr03G002497 Chr03 NC_080389.1:39762778-39762790promoter 内 1503-1515 bp + 2486 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 39758229-39760292(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGATTC
SmilChr01G003724 Chr01 NC_080387.1:55561494-55561506promoter 内 889-901 bp + 3100 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 55553418-55558394(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTATATC
SmilChr01G005709 Chr01 NC_080387.1:73319112-73319124promoter 内 401-413 bp - 3588 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 73322712-73323531(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACTTT
SmilChr01G006061 Chr01 NC_080387.1:76056713-76056725promoter 内 9-21 bp - 3980 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 76048442-76052733(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTTAGGATAAGG
SmilChr03G002380 Chr03 NC_080389.1:37548825-37548837promoter 内 1268-1280 bp - 2721 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 4 37551558-37552934(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAAAAG
SmilChr01G000418 Chr01 NC_080387.1:8435624-8435636promoter 内 3022-3034 bp + 967 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 8436603-8437870(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTTTTGGATAAGG
SmilChr01G000346 Chr01 NC_080387.1:7058528-7058540promoter 内 2765-2777 bp - 1224 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 7059764-7061098(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAAAAG