转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G002048; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00024366-RA_Salv SmilChr06G002048 bHLH XP_057770293.1 MP00035 CCCACGTGC

可能结合的靶基因

9903 个结合位点 6618 个候选靶基因 第 79 / 133 下载 TSV

上一页 79 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004057 Chr02 NC_080388.1:62885607-62885615promoter 内 604-612 bp + 3389 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 62878150-62882218(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr02G001499 Chr02 NC_080388.1:28034359-28034367promoter 内 549-557 bp + 3444 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 28037811-28041256(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGT
SmilChr01G001361 Chr01 NC_080387.1:26969162-26969170promoter 内 518-526 bp + 3475 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 26960517-26965687(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr03G003083 Chr03 NC_080389.1:47881927-47881935promoter 内 512-520 bp + 3481 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 47877677-47878446(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr01G001701 Chr01 NC_080387.1:31445101-31445109promoter 内 486-494 bp - 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 31448616-31451301(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr03G001809 Chr03 NC_080389.1:24704334-24704342promoter 内 486-494 bp - 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 24693455-24700827(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGT
SmilChr02G000072 Chr02 NC_080388.1:908987-908995promoter 内 470-478 bp + 3523 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 904943-905464(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr04G002461 Chr04 NC_080390.1:39432691-39432699promoter 内 454-462 bp - 3539 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 39436238-39442760(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr01G005583 Chr01 NC_080387.1:72531935-72531943promoter 内 444-452 bp - 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 72527807-72528386(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGT
SmilChr04G002122 Chr04 NC_080390.1:34241040-34241048promoter 内 416-424 bp - 3577 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 34244625-34244697(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr02G004126 Chr02 NC_080388.1:63505732-63505740promoter 内 411-419 bp - 3582 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 63509322-63511553(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr03G003084 Chr03 NC_080389.1:47881927-47881935promoter 内 402-410 bp + 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 47885526-47886527(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGT
SmilChr02G005018 Chr02 NC_080388.1:71961121-71961129promoter 内 386-394 bp + 3607 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 71955985-71957514(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr01G001761 Chr01 NC_080387.1:32338312-32338320promoter 内 368-376 bp - 3625 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 32341945-32346332(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr02G003368 Chr02 NC_080388.1:54813803-54813811promoter 内 368-376 bp - 3625 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 54804853-54810178(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGT
SmilChr01G004906 Chr01 NC_080387.1:67106330-67106338promoter 内 355-363 bp - 3638 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 67109976-67110610(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr02G003306 Chr02 NC_080388.1:54332933-54332941promoter 内 335-343 bp + 3658 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 54325880-54329275(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr01G005979 Chr01 NC_080387.1:75454731-75454739promoter 内 308-316 bp + 3685 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 75445761-75451046(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr01G004012 Chr01 NC_080387.1:58545859-58545867promoter 内 275-283 bp - 3718 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 58537138-58542141(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGT
SmilChr03G004386 Chr03 NC_080389.1:62063478-62063486promoter 内 265-273 bp - 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 62067214-62071808(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr03G002758 Chr03 NC_080389.1:43843946-43843954promoter 内 238-246 bp - 3755 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 43821928-43840191(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGT
SmilChr03G001571 Chr03 NC_080389.1:19838201-19838209promoter 内 236-244 bp + 3757 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 19841966-19849617(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGT
SmilChr03G001091 Chr03 NC_080389.1:12609010-12609018promoter 内 212-220 bp + 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 12612799-12615022(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGT
SmilChr01G002874 Chr01 NC_080387.1:47339170-47339178promoter 内 205-213 bp - 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 47334007-47335382(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGT
SmilChr01G000355 Chr01 NC_080387.1:7356701-7356709promoter 内 197-205 bp + 3796 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 7344787-7352905(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr03G001786 Chr03 NC_080389.1:24415089-24415097promoter 内 168-176 bp - 3825 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 24418922-24420385(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr04G000869 Chr04 NC_080390.1:11197547-11197555promoter 内 134-142 bp + 3859 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 10980515-11193688(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr02G003084 Chr02 NC_080388.1:51743956-51743964promoter 内 125-133 bp + 3868 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 51747832-51748908(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGT
SmilChr04G002382 Chr04 NC_080390.1:38372425-38372433promoter 内 55-63 bp + 3938 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 38365688-38368487(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr01G000509 Chr01 NC_080387.1:10350268-10350276promoter 内 42-50 bp - 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 10339985-10346317(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGT
SmilChr04G001176 Chr04 NC_080390.1:17739881-17739889promoter 内 36-44 bp + 3957 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 17733441-17735924(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr04G002041 Chr04 NC_080390.1:33144826-33144834promoter 内 33-41 bp - 3960 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 33138419-33140866(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGT
SmilChr02G004388 Chr02 NC_080388.1:66240728-66240736promoter 内 2-10 bp - 3991 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 66244727-66248655(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 ACACGTGGA
SmilChr01G005288 Chr01 NC_080387.1:70222577-70222585promoter 内 3879-3887 bp + 114 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 70222699-70224075(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGA
SmilChr01G004939 Chr01 NC_080387.1:67503516-67503524promoter 内 3781-3789 bp - 212 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 67503736-67512271(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCACGTGGA
SmilChr04G000010 Chr04 NC_080390.1:166015-166023promoter 内 2535-2543 bp + 1458 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 154530-164557(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCACGTGGA
SmilChr04G000180 Chr04 NC_080390.1:1591231-1591239promoter 内 1026-1034 bp + 2967 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 1594206-1597812(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGA
SmilChr01G003280 Chr01 NC_080387.1:51488921-51488929promoter 内 627-635 bp - 3366 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 51492295-51495595(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCACGTGGA
SmilChr03G000339 Chr03 NC_080389.1:3860511-3860519promoter 内 301-309 bp - 3692 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 3846142-3856819(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGA
SmilChr01G000874 Chr01 NC_080387.1:18622414-18622422promoter 内 3871-3879 bp + 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 18621521-18622292(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCACGTGGA
SmilChr01G002424 Chr01 NC_080387.1:41745395-41745403promoter 内 3861-3869 bp - 132 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 41745535-41746849(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCACGTGGA
SmilChr02G003421 Chr02 NC_080388.1:55425386-55425394promoter 内 3571-3579 bp + 422 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 55424065-55424964(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCACGTGGA
SmilChr03G002768 Chr03 NC_080389.1:44037443-44037451promoter 内 3532-3540 bp - 461 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 44035273-44036982(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGA
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SmilChr03G001937 Chr03 NC_080389.1:27502091-27502099promoter 内 3490-3498 bp - 503 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 27502602-27504582(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCACGTGGA
SmilChr03G000091 Chr03 NC_080389.1:1029907-1029915promoter 内 3313-3321 bp - 680 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 1027224-1029227(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGA
SmilChr02G003936 Chr02 NC_080388.1:61436727-61436735promoter 内 3268-3276 bp - 725 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 61434867-61436002(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCCACGTGA
SmilChr02G000958 Chr02 NC_080388.1:16670880-16670888promoter 内 3246-3254 bp - 747 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 16671635-16675520(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCACGTGGA
SmilChr01G006091 Chr01 NC_080387.1:76396319-76396327promoter 内 3194-3202 bp - 799 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 76397126-76481394(+) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCACGTGGA
SmilChr01G003781 Chr01 NC_080387.1:56197840-56197848promoter 内 3089-3097 bp + 904 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 56195870-56196936(-) SMil_00024366-RA_Salv MP00035 TCACGTGGA