转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G003597; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008984-RA_Salv SmilChr07G003597 Nin-like XP_057773587.1 MP00449 ATTTGGCTTTTCGGA

可能结合的靶基因

9453 个结合位点 8096 个候选靶基因 第 84 / 162 下载 TSV

上一页 84 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004760 Chr01 NC_080387.1:65787660-65787674promoter 内 962-976 bp - 3025 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 65790699-65793386(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CATAAAAAGCCAATT
SmilChr07G000174 Chr07 NC_080393.1:1092294-1092308promoter 内 932-946 bp + 3055 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 1086376-1089239(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CTTTAAAAGCCAAAA
SmilChr01G003125 Chr01 NC_080387.1:50073799-50073813promoter 内 890-904 bp - 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 50069069-50070702(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CCTTGGCTTTTCCCT
SmilChr02G004332 Chr02 NC_080388.1:65587634-65587648promoter 内 846-860 bp + 3141 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 65590789-65592409(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATCTGGCTTTTCCTC
SmilChr07G000752 Chr07 NC_080393.1:5299495-5299509promoter 内 830-844 bp + 3157 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 5292566-5296338(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CCAGAGAAGCCAAAT
SmilChr02G001891 Chr02 NC_080388.1:34214619-34214633promoter 内 820-834 bp + 3167 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 34217800-34219981(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TCTTGGCTTTTTCGG
SmilChr03G002942 Chr03 NC_080389.1:46129182-46129196promoter 内 816-830 bp + 3171 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 46132367-46137049(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TAGTGGCTTTTGCTC
SmilChr01G000186 Chr01 NC_080387.1:3186139-3186153promoter 内 807-821 bp - 3180 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 3181788-3182959(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CTTTGTCTTTTCGTT
SmilChr08G003635 Chr08 NC_080394.1:39672891-39672905promoter 内 777-791 bp - 3210 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 39676115-39676858(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CTGCAAAAGCCAGCG
SmilChr01G005398 Chr01 NC_080387.1:71247411-71247425promoter 内 718-732 bp + 3269 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 71250694-71253099(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GATTGTCTTTTCGTC
SmilChr01G005164 Chr01 NC_080387.1:69418281-69418295promoter 内 707-721 bp - 3280 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 69421575-69426516(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CTTTAAAAGCCAAAA
SmilChr04G001543 Chr04 NC_080390.1:25531296-25531310promoter 内 666-680 bp + 3321 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 25524323-25527975(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GACGAAAAGTCGAGA
SmilChr03G000622 Chr03 NC_080389.1:6865670-6865684promoter 内 613-627 bp + 3374 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 6861170-6862296(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CCCCGAAAGCCATAT
SmilChr06G003228 Chr06 NC_080392.1:45027935-45027949promoter 内 599-613 bp - 3388 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 45017852-45024547(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AAATGGCTTTTTAGC
SmilChr08G000794 Chr08 NC_080394.1:5846077-5846091promoter 内 535-549 bp - 3452 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 5839676-5842625(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATGTGGCTTTTGTTG
SmilChr07G000369 Chr07 NC_080393.1:2522960-2522974promoter 内 534-548 bp + 3453 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 2518673-2519507(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATCTAAAAGCCACCT
SmilChr01G004473 Chr01 NC_080387.1:62823392-62823406promoter 内 525-539 bp + 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 62826868-62826970(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTATGGCTTTTAAGA
SmilChr03G001176 Chr03 NC_080389.1:13518447-13518461promoter 内 451-465 bp - 3536 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 13521997-13523176(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CCCCGAAAGCCATAT
SmilChr07G000590 Chr07 NC_080393.1:4030555-4030569promoter 内 432-446 bp - 3555 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 4023528-4027000(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTTTGGCTTTTAAAG
SmilChr03G004706 Chr03 NC_080389.1:64338406-64338420promoter 内 413-427 bp + 3574 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 64341994-64343642(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CGTTGGCTTCTCGAT
SmilChr01G004713 Chr01 NC_080387.1:65285889-65285903promoter 内 406-420 bp - 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 65278485-65282308(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTTTGGCTTTTTGAT
SmilChr01G003644 Chr01 NC_080387.1:54921496-54921510promoter 内 376-390 bp + 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 54925121-54932996(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GGCCGCCTTTTCGTG
SmilChr08G001735 Chr08 NC_080394.1:14598204-14598218promoter 内 367-381 bp - 3620 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 14589670-14594584(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AAACGGCTTTTCCAC
SmilChr08G000872 Chr08 NC_080394.1:6465731-6465745promoter 内 331-345 bp - 3656 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 6469401-6470078(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GTCAAAAAGCCAAAA
SmilChr08G003723 Chr08 NC_080394.1:41894858-41894872promoter 内 261-275 bp - 3726 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 41898598-41900158(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TCCTAGGAGCCAAAT
SmilChr01G003928 Chr01 NC_080387.1:57558297-57558311promoter 内 260-274 bp - 3727 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 57551499-57554570(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATATGGCTTTTCTAA
SmilChr05G001515 Chr05 NC_080391.1:13894740-13894754promoter 内 236-250 bp + 3751 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 13898505-13899420(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATTTGGCGCTTTGGA
SmilChr07G002641 Chr07 NC_080393.1:25561944-25561958promoter 内 134-148 bp - 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 25565811-25567329(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TGCAAAAAGCCATTT
SmilChr04G001946 Chr04 NC_080390.1:31583399-31583413promoter 内 3821-3835 bp - 166 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 31583579-31585735(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GACTAAAAGCCAAAT
SmilChr04G003007 Chr04 NC_080390.1:46443295-46443309promoter 内 3730-3744 bp - 257 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 46443566-46448065(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ACCGAAAAGCTAACT
SmilChr04G003209 Chr04 NC_080390.1:48946320-48946334promoter 内 3720-3734 bp + 267 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 48941580-48946053(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ACCGAAAAGCTAACT
SmilChr01G002760 Chr01 NC_080387.1:46001422-46001436promoter 内 3676-3690 bp + 311 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 46001747-46006775(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATGTGGCTTTTTGCC
SmilChr01G000583 Chr01 NC_080387.1:12596436-12596450promoter 内 2585-2599 bp + 1402 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 12597852-12601439(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AGTTGGCTTCTCAAT
SmilChr01G001987 Chr01 NC_080387.1:35302414-35302428promoter 内 907-921 bp + 3080 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 35294455-35299334(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AAACAAAGGCCAAAT
SmilChr02G003505 Chr02 NC_080388.1:56236867-56236881promoter 内 278-292 bp + 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 56240590-56243338(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATCTGGCTTTTGCTA
SmilChr04G003006 Chr04 NC_080390.1:46443295-46443309promoter 内 3942-3956 bp - 45 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 46439302-46443250(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AGTTAGCTTTTCGGT
SmilChr02G003320 Chr02 NC_080388.1:54463988-54464002promoter 内 3934-3948 bp - 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 54458988-54463935(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TCACGGCTTTTGAAA
SmilChr05G001656 Chr05 NC_080391.1:15656268-15656282promoter 内 3932-3946 bp - 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 15656337-15656442(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTAGAAAAGCCACGT
SmilChr03G004460 Chr03 NC_080389.1:62689170-62689184promoter 内 3913-3927 bp + 74 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 62687438-62689096(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GGTCAAAAGCCAGCA
SmilChr06G002316 Chr06 NC_080392.1:33421098-33421112promoter 内 3841-3855 bp - 146 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 33421258-33423414(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GACTAAAAGCCAAAT
SmilChr03G004551 Chr03 NC_080389.1:63478384-63478398promoter 内 3729-3743 bp - 258 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 63478656-63481096(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AATGAAGCGCCAAAT
SmilChr01G003944 Chr01 NC_080387.1:57770892-57770906promoter 内 3589-3603 bp - 398 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 57771304-57775906(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AATCAAAAGCCATCG
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SmilChr07G003157 Chr07 NC_080393.1:33486441-33486455promoter 内 3380-3394 bp + 607 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 33487062-33491968(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 GATTGGCTTTTGCCT
SmilChr03G003901 Chr03 NC_080389.1:58115286-58115300promoter 内 3225-3239 bp - 762 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 58111893-58114524(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTTCGTCTTTTCGTA
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SmilChr08G000499 Chr08 NC_080394.1:3650306-3650320promoter 内 3174-3188 bp - 813 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 3651133-3653320(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CCCGAAAAGCTACTG
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SmilChr04G000200 Chr04 NC_080390.1:1793017-1793031promoter 内 3137-3151 bp + 850 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 1790354-1792167(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CTGCAGGAGCCAAAA
SmilChr03G002946 Chr03 NC_080389.1:46202452-46202466promoter 内 3068-3082 bp - 919 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 46198180-46201533(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CTACGACTTTTCGAT