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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 1 / 126 下载 TSV

1 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G001974 Chr07 NC_080393.1:17306417-17306431promoter 内 3747-3761 bp - 240 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 17303669-17306177(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGGACACGTGGCA
SmilChr07G001970 Chr07 NC_080393.1:17262860-17262874promoter 内 3576-3590 bp - 411 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 17254652-17262449(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGGACACGTGGCA
SmilChr03G001437 Chr03 NC_080389.1:17057573-17057587promoter 内 988-1002 bp + 2999 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.7/ 100 2 17050990-17054574(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCCTCC
SmilChr06G000193 Chr06 NC_080392.1:1332317-1332331promoter 内 3457-3471 bp + 530 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.7/ 100 1 1332861-1333806(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGGGGACACGTGGCA
SmilChr06G000192 Chr06 NC_080392.1:1332317-1332331promoter 内 2004-2018 bp + 1983 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.7/ 100 1 1326955-1330334(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCCCCC
SmilChr03G000536 Chr03 NC_080389.1:5778414-5778428promoter 内 2330-2344 bp + 1657 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 4 5780085-5827863(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGGGGACACGTGGCA
SmilChr03G000535 Chr03 NC_080389.1:5778414-5778428promoter 内 1698-1712 bp + 2289 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 4 5773432-5776125(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCCCCT
SmilChr02G004221 Chr02 NC_080388.1:64421227-64421241promoter 内 847-861 bp + 3140 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 3 64424381-64430938(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGGGGAGACGTGGCA
SmilChr04G003099 Chr04 NC_080390.1:47588364-47588378promoter 内 2085-2099 bp - 1902 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 1 47582813-47586462(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GATGGTGACGTGGCA
SmilChr07G003398 Chr07 NC_080393.1:36873258-36873272promoter 内 2058-2072 bp - 1929 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 3 36870640-36871329(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAGGCCACGTGGCA
SmilChr03G000967 Chr03 NC_080389.1:10938187-10938201promoter 内 1687-1701 bp + 2300 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 4 10940501-10942103(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATGGAGACGTGGCA
SmilChr06G002338 Chr06 NC_080392.1:33971635-33971649promoter 内 150-164 bp + 3837 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 33975486-33976604(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATGGAGACGTGGCA
SmilChr06G002301 Chr06 NC_080392.1:33245400-33245414promoter 内 2753-2767 bp + 1234 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 33241591-33244166(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCTCCATT
SmilChr01G000692 Chr01 NC_080387.1:15534497-15534511promoter 内 1424-1438 bp + 2563 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 15537074-15537938(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATGGAGACGTGGCA
SmilChr02G004647 Chr02 NC_080388.1:68912446-68912460promoter 内 3661-3675 bp + 326 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 68906280-68912120(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCACCTTC
SmilChr01G002639 Chr01 NC_080387.1:44676814-44676828promoter 内 3907-3921 bp - 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 44675989-44676734(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAGGTGACGTGGCA
SmilChr01G005145 Chr01 NC_080387.1:69237629-69237643promoter 内 3858-3872 bp + 129 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 69236880-69237500(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCCTCA
SmilChr03G002352 Chr03 NC_080389.1:37158412-37158426promoter 内 3445-3459 bp - 542 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 37158968-37164609(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCACCATT
SmilChr07G003422 Chr07 NC_080393.1:37389762-37389776promoter 内 2980-2994 bp - 1007 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 37388165-37388755(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GAGGGTGACGTGGCA
SmilChr04G002297 Chr04 NC_080390.1:37229922-37229936promoter 内 2240-2254 bp - 1747 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 37224694-37228175(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATGGGACACGTGGCA
SmilChr04G000491 Chr04 NC_080390.1:5337850-5337864promoter 内 1819-1833 bp + 2168 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 5340032-5340947(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGGGGACACGTGGCA
SmilChr05G000471 Chr05 NC_080391.1:3577382-3577396promoter 内 660-674 bp - 3327 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 3571933-3574055(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATAGGACACGTGGCA
SmilChr06G001934 Chr06 NC_080392.1:23552008-23552022promoter 内 2673-2687 bp + 1314 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 3 23545456-23550694(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCCAAA
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SmilChr07G004352 Chr07 NC_080393.1:56064976-56064990promoter 内 980-994 bp + 3007 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 56067997-56070217(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AAGGGTGACGTGGCA
SmilChr07G004336 Chr07 NC_080393.1:55921002-55921016promoter 内 940-954 bp - 3047 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 55915666-55917955(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AAGGGTGACGTGGCA
SmilChr01G003611 Chr01 NC_080387.1:54658900-54658914promoter 内 2634-2648 bp - 1353 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 54660267-54661448(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCCAAA
SmilChr04G001327 Chr04 NC_080390.1:21411280-21411294promoter 内 2382-2396 bp + 1605 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 21405779-21409675(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCCAAA
SmilChr06G000086 Chr06 NC_080392.1:626675-626689promoter 内 1739-1753 bp - 2248 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 623048-624427(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAAGGACACGTGGCA
SmilChr05G002568 Chr05 NC_080391.1:28854014-28854028promoter 内 967-981 bp + 3020 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 28849769-28850994(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCACCTTT
SmilChr06G000169 Chr06 NC_080392.1:1172286-1172300promoter 内 3932-3946 bp + 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 1172355-1176043(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGTGGACACGTGGCA
SmilChr07G002886 Chr07 NC_080393.1:29131957-29131971promoter 内 3320-3334 bp + 667 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 29132638-29135783(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAGGCGACGTGGCA
SmilChr08G003666 Chr08 NC_080394.1:40479343-40479357promoter 内 3760-3774 bp + 227 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 4 40475763-40479116(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGTCCTCC
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SmilChr04G003338 Chr04 NC_080390.1:50052260-50052274promoter 内 3840-3854 bp - 147 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 50052421-50058572(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGTCCTCC
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SmilChr05G002225 Chr05 NC_080391.1:23779693-23779707promoter 内 1562-1576 bp + 2425 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 3 23782132-23783671(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATGGGTGACGTGGCA
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SmilChr01G003689 Chr01 NC_080387.1:55270766-55270780promoter 内 3016-3030 bp - 971 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 55267026-55269795(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTAGGACACGTGGCA
SmilChr05G002759 Chr05 NC_080391.1:31937656-31937670promoter 内 2875-2889 bp + 1112 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 31938782-31944492(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GCTGGTGACGTGGCA
SmilChr03G002679 Chr03 NC_080389.1:42582969-42582983promoter 内 2256-2270 bp - 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 42584714-42588608(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCACCCAT
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SmilChr05G001740 Chr05 NC_080391.1:16824124-16824138promoter 内 3952-3966 bp + 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 16815950-16824089(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGTCCAAC
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SmilChr01G003232 Chr01 NC_080387.1:51092173-51092187promoter 内 3935-3949 bp - 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 51088112-51092121(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAGGACACGTGGCG
SmilChr02G003765 Chr02 NC_080388.1:59351524-59351538promoter 内 3016-3030 bp + 971 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 59352509-59353943(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGGGGTCACGTGGCG