转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G001094; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021820-RA_Salv SmilChr04G001094 WRKY XP_057804404.1 MP00408 AGCGTTGACTTTT

可能结合的靶基因

9902 个结合位点 8149 个候选靶基因 第 16 / 163 下载 TSV

上一页 16 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G001204 Chr08 NC_080394.1:9731301-9731313promoter 内 2447-2459 bp + 1542 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 4 9726949-9729759(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TATAGTCAACGCC
SmilChr03G001060 Chr03 NC_080389.1:12297941-12297953promoter 内 3597-3609 bp + 392 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 12298345-12300900(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GACGTTGACTTGG
SmilChr02G000672 Chr02 NC_080388.1:10359402-10359414promoter 内 45-57 bp + 3944 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 10363358-10368799(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACAGTTGACTTTT
SmilChr08G002146 Chr08 NC_080394.1:19332272-19332284promoter 内 3920-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 19331378-19332203(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCAAGTCAACGTC
SmilChr04G002782 Chr04 NC_080390.1:43626193-43626205promoter 内 3894-3906 bp + 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 43624422-43626098(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACAGTCAACGCC
SmilChr02G003332 Chr02 NC_080388.1:54563570-54563582promoter 内 3718-3730 bp + 271 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 54563853-54572590(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TACGTTGACTTTA
SmilChr03G001047 Chr03 NC_080389.1:12196301-12196313promoter 内 3312-3324 bp + 677 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 12196990-12199512(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GACGTTGACTTGG
SmilChr02G003441 Chr02 NC_080388.1:55689003-55689015promoter 内 3174-3186 bp + 815 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 55684467-55688188(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGAAGTCAACGCG
SmilChr07G003290 Chr07 NC_080393.1:34657884-34657896promoter 内 2782-2794 bp - 1207 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 34659103-34660527(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAAGTCAACGGT
SmilChr02G000670 Chr02 NC_080388.1:10338662-10338674promoter 内 2671-2683 bp + 1318 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 10339992-10340971(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACAGTTGACTTTT
SmilChr07G000007 Chr07 NC_080393.1:28176-28188promoter 内 2473-2485 bp - 1516 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 23315-26660(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCCGTTGACTATG
SmilChr07G001740 Chr07 NC_080393.1:14766685-14766697promoter 内 2233-2245 bp - 1756 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 14768453-14771874(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACGAT
SmilChr01G002085 Chr01 NC_080387.1:36821744-36821756promoter 内 2138-2150 bp - 1851 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 36818949-36819893(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGCGTTGACCTCT
SmilChr05G002849 Chr05 NC_080391.1:33977056-33977068promoter 内 1940-1952 bp - 2049 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 33979117-33981217(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAGAGTCAACGCG
SmilChr04G001600 Chr04 NC_080390.1:26683021-26683033promoter 内 1703-1715 bp - 2286 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 26676919-26680735(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACTTCC
SmilChr07G003335 Chr07 NC_080393.1:35729687-35729699promoter 内 1335-1347 bp + 2654 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 35732353-35733422(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACTCTT
SmilChr03G003210 Chr03 NC_080389.1:49698107-49698119promoter 内 1330-1342 bp - 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 49693296-49695448(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACTCTT
SmilChr03G003324 Chr03 NC_080389.1:51497473-51497485promoter 内 1325-1337 bp - 2664 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 51492990-51494809(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACTCTT
SmilChr06G001515 Chr06 NC_080392.1:16259233-16259245promoter 内 1170-1182 bp - 2819 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 16254121-16256414(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATCGTTGACTTCT
SmilChr01G000973 Chr01 NC_080387.1:20587699-20587711promoter 内 1025-1037 bp + 2964 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 20590675-20594808(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACTCTT
SmilChr03G001833 Chr03 NC_080389.1:25137368-25137380promoter 内 1005-1017 bp + 2984 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 25140364-25141017(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACCGTTGACTTGC
SmilChr03G001823 Chr03 NC_080389.1:24951821-24951833promoter 内 558-570 bp - 3431 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 24946586-24948390(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACTCTT
SmilChr06G001223 Chr06 NC_080392.1:12636290-12636302promoter 内 193-205 bp + 3796 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 12626675-12632494(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAGAGTCAACGCG
SmilChr01G001825 Chr01 NC_080387.1:33197785-33197797promoter 内 1981-1993 bp - 2008 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 6 33194132-33195777(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCCGTTGACTTCC
SmilChr01G005702 Chr01 NC_080387.1:73265506-73265518promoter 内 3965-3977 bp + 24 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 73262006-73265482(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACCCT
SmilChr07G000788 Chr07 NC_080393.1:5556646-5556658promoter 内 3804-3816 bp + 185 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 5556843-5557667(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCCGTTGACCTCT
SmilChr06G001843 Chr06 NC_080392.1:21649778-21649790promoter 内 3424-3436 bp + 565 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 21650355-21651502(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACCGTTGACTCTG
SmilChr07G000789 Chr07 NC_080393.1:5556646-5556658promoter 内 2146-2158 bp + 1843 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 5558501-5563200(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCCGTTGACCTCT
SmilChr08G001528 Chr08 NC_080394.1:12439505-12439517promoter 内 892-904 bp + 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 12442614-12445647(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACGTTGACTTCT
SmilChr07G002834 Chr07 NC_080393.1:28392199-28392211promoter 内 3955-3967 bp - 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 28392245-28393381(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAGAGTCAACGCA
SmilChr05G001270 Chr05 NC_080391.1:10857145-10857157promoter 内 3938-3950 bp + 51 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 10840559-10857094(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATAAGTCAACGAT
SmilChr08G002938 Chr08 NC_080394.1:29390412-29390424promoter 内 3883-3895 bp - 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 29388151-29390306(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGGGTTGACTTTT
SmilChr06G000259 Chr06 NC_080392.1:1711374-1711386promoter 内 3868-3880 bp + 121 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 1704409-1711253(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACGTT
SmilChr05G002491 Chr05 NC_080391.1:27590061-27590073promoter 内 3665-3677 bp - 324 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 27590397-27597253(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACAGTCAACGGC
SmilChr03G003288 Chr03 NC_080389.1:50982416-50982428promoter 内 3538-3550 bp + 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 50980166-50981965(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAGAGTCAACGCA
SmilChr01G000189 Chr01 NC_080387.1:3238182-3238194promoter 内 3116-3128 bp - 873 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 3239067-3240349(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAGAGTCAACGCA
SmilChr01G002734 Chr01 NC_080387.1:45691837-45691849promoter 内 3008-3020 bp - 981 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 45692830-45692988(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAGAGTCAACGGC
SmilChr08G000421 Chr08 NC_080394.1:3005307-3005319promoter 内 2839-2851 bp - 1150 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 3006469-3010515(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATAAGTCAACGAT
SmilChr07G002835 Chr07 NC_080393.1:28392199-28392211promoter 内 2725-2737 bp - 1264 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 28393475-28394035(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAGAGTCAACGCA
SmilChr03G002312 Chr03 NC_080389.1:36380569-36380581promoter 内 2692-2704 bp + 1297 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 36378395-36379272(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAGAGTCAACGCA
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SmilChr02G003736 Chr02 NC_080388.1:59004450-59004462promoter 内 2465-2477 bp - 1524 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 59005986-59006474(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TATAGTCAACGGC
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SmilChr01G002735 Chr01 NC_080387.1:45691837-45691849promoter 内 1909-1921 bp - 2080 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 45693929-45694047(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAGAGTCAACGGC
SmilChr06G000150 Chr06 NC_080392.1:1054440-1054452promoter 内 1877-1889 bp + 2112 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 1049420-1052328(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACCCT
SmilChr03G003049 Chr03 NC_080389.1:47390425-47390437promoter 内 1824-1836 bp - 2165 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 47392602-47393188(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GATAGTCAACGCT
SmilChr07G000633 Chr07 NC_080393.1:4266499-4266511promoter 内 1764-1776 bp + 2225 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 4268736-4269328(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACGTTGACTTCT