Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G005433; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021978-RA_Salv SmilChr02G005433 WRKY XP_057792682.1 MP00209 CGTTGACTTTTTTTAACAT

可能结合的靶基因

9910 个结合位点 8083 个候选靶基因 第 20 / 162 下载 TSV

上一页 20 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005269 Chr02 NC_080388.1:73776963-73776981promoter 内 3806-3824 bp - 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 73772664-73776786(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTTGGATAGGCCC
SmilChr01G004809 Chr01 NC_080387.1:66295135-66295153promoter 内 3796-3814 bp - 187 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 66295340-66297444(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTAATTTCCAAGTCAACG
SmilChr04G002921 Chr04 NC_080390.1:45472831-45472849promoter 内 3724-3742 bp + 259 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 45467096-45472572(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr08G002560 Chr08 NC_080394.1:24906869-24906887promoter 内 3686-3704 bp - 297 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 24907184-24911211(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr01G001137 Chr01 NC_080387.1:23165703-23165721promoter 内 3671-3689 bp - 312 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 23166033-23167776(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr06G001358 Chr06 NC_080392.1:14144259-14144277promoter 内 3628-3646 bp + 355 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 14139652-14143904(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr01G005179 Chr01 NC_080387.1:69517752-69517770promoter 内 3556-3574 bp - 427 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 69518197-69522787(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr07G002664 Chr07 NC_080393.1:25850053-25850071promoter 内 3555-3573 bp + 428 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 25846118-25849625(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr02G002548 Chr02 NC_080388.1:44340321-44340339promoter 内 3471-3489 bp + 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 44337856-44339809(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr02G001807 Chr02 NC_080388.1:32908929-32908947promoter 内 3426-3444 bp + 557 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 32905498-32908372(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr08G000519 Chr08 NC_080394.1:3770838-3770856promoter 内 3341-3359 bp - 642 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 3771498-3773926(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr04G000951 Chr04 NC_080390.1:12590562-12590580promoter 内 3330-3348 bp + 653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 12588461-12589909(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr08G000288 Chr08 NC_080394.1:1967129-1967147promoter 内 3330-3348 bp - 653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 1961628-1966476(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTCGTACTGATGA
SmilChr01G004985 Chr01 NC_080387.1:67904003-67904021promoter 内 3246-3264 bp + 737 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 67897017-67903266(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr08G000289 Chr08 NC_080394.1:1967129-1967147promoter 内 3182-3200 bp - 801 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 1964997-1966328(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTCGTACTGATGA
SmilChr08G002354 Chr08 NC_080394.1:22272411-22272429promoter 内 3156-3174 bp - 827 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 22273256-22273940(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr01G005178 Chr01 NC_080387.1:69516600-69516618promoter 内 3042-3060 bp + 941 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 69512361-69515659(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr07G002737 Chr07 NC_080393.1:26865621-26865639promoter 内 2880-2898 bp + 1103 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 26861108-26864518(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AACTCGAACAAAGTCAACC
SmilChr01G003197 Chr01 NC_080387.1:50740125-50740143promoter 内 2875-2893 bp + 1108 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 50734261-50739017(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTATTCATAAAAGTCAACG
SmilChr03G002828 Chr03 NC_080389.1:44762949-44762967promoter 内 2555-2573 bp + 1428 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 44759008-44761521(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr06G001505 Chr06 NC_080392.1:16084903-16084921promoter 内 2398-2416 bp - 1585 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 16082373-16083318(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCTCCCTGAACTC
SmilChr07G001617 Chr07 NC_080393.1:13557944-13557962promoter 内 2225-2243 bp + 1758 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 13551815-13556186(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr07G000789 Chr07 NC_080393.1:5556648-5556666promoter 内 2148-2166 bp + 1835 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 5558501-5563200(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCTCTTTCGCCGG
SmilChr02G003222 Chr02 NC_080388.1:53442374-53442392promoter 内 1966-1984 bp - 2017 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 53444409-53444987(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr02G004607 Chr02 NC_080388.1:68567384-68567402promoter 内 1725-1743 bp - 2258 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 68569660-68579495(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr01G006011 Chr01 NC_080387.1:75667497-75667515promoter 内 1658-1676 bp - 2325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 75669840-75713567(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr03G000882 Chr03 NC_080389.1:10018382-10018400promoter 内 1651-1669 bp - 2332 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 10011657-10016050(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTAATTTGAACTA
SmilChr08G002948 Chr08 NC_080394.1:29480545-29480563promoter 内 1590-1608 bp + 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 29482956-29498229(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTACGACAGGGAA
SmilChr04G002194 Chr04 NC_080390.1:35499119-35499137promoter 内 1536-1554 bp + 2447 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 35493357-35496672(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr01G004891 Chr01 NC_080387.1:66981373-66981391promoter 内 1405-1423 bp + 2578 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 66977992-66978795(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr06G001512 Chr06 NC_080392.1:16179591-16179609promoter 内 1188-1206 bp - 2795 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 16182404-16184746(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr02G001870 Chr02 NC_080388.1:33977328-33977346promoter 内 1164-1182 bp - 2819 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 33980165-33981871(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr02G004606 Chr02 NC_080388.1:68566378-68566396promoter 内 1153-1171 bp + 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 68561984-68563548(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr03G002887 Chr03 NC_080389.1:45526337-45526355promoter 内 973-991 bp + 3010 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 45520383-45523327(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTTTAAGGGATGGTCAACG
SmilChr04G003089 Chr04 NC_080390.1:47512618-47512636promoter 内 636-654 bp - 3347 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 47515983-47517462(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TCATTCATAAAAGTCAACG
SmilChr07G000660 Chr07 NC_080393.1:4461478-4461496promoter 内 505-523 bp - 3478 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 4456229-4458000(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCATCTTGTACGG
SmilChr06G002111 Chr06 NC_080392.1:28209532-28209550promoter 内 303-321 bp + 3680 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 28204722-28205852(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TACCACAAGATAGTCAACG
SmilChr02G003621 Chr02 NC_080388.1:57519756-57519774promoter 内 227-245 bp - 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 57523530-57524994(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr03G004262 Chr03 NC_080389.1:61114987-61115005promoter 内 101-119 bp + 3882 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 61109432-61111105(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr07G001148 Chr07 NC_080393.1:8625998-8626016promoter 内 3944-3962 bp - 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 8626055-8631363(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TCGCTTTCATAAGTCAACG
SmilChr07G000270 Chr07 NC_080393.1:1745609-1745627promoter 内 3929-3947 bp - 54 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 1745681-1748579(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTGGCGGCCAAAGTCAACA
SmilChr08G002146 Chr08 NC_080394.1:19332274-19332292promoter 内 3912-3930 bp + 71 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 19331378-19332203(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGGGTCCGCCAAGTCAACG
SmilChr01G002831 Chr01 NC_080387.1:46919612-46919630promoter 内 3894-3912 bp + 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 46909817-46919523(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGGGCCTACCAAGTCAACT
SmilChr02G001578 Chr02 NC_080388.1:29379667-29379685promoter 内 3894-3912 bp + 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 29379774-29381798(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCTCCCTGAACTC
SmilChr06G001558 Chr06 NC_080392.1:16986891-16986909promoter 内 3853-3871 bp + 130 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 16984911-16986761(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAGTTCAGGGAGGTCAACG
SmilChr03G002829 Chr03 NC_080389.1:44764180-44764198promoter 内 3851-3869 bp - 132 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 44763431-44764048(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCTCCCTGAACTC
SmilChr08G001029 Chr08 NC_080394.1:7819621-7819639promoter 内 3832-3850 bp + 151 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 7819790-7821764(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTGCGGTTGACGC
SmilChr02G000301 Chr02 NC_080388.1:3801764-3801782promoter 内 3677-3695 bp - 306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 3800886-3801458(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCTATTTAATTTC
SmilChr02G000341 Chr02 NC_080388.1:4440391-4440409promoter 内 3677-3695 bp + 306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 4440715-4441287(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCTATTTAATTTC
SmilChr04G002468 Chr04 NC_080390.1:39502812-39502830promoter 内 3661-3679 bp - 322 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 39503152-39505282(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTGGCGGTGGCGGTCAACG