Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G004274; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001114-RA_Salv SmilChr03G004274 MIKC_MADS XP_057799397.1 MP00080 CCAAAAAAGGAAAA

可能结合的靶基因

9850 个结合位点 6766 个候选靶基因 第 22 / 136 下载 TSV

上一页 22 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000040 Chr02 NC_080388.1:487712-487725promoter 内 3505-3518 bp - 483 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 483264-487229(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCAAAAAAGGAAAC
SmilChr01G005389 Chr01 NC_080387.1:71179025-71179038promoter 内 3501-3514 bp + 487 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 71179525-71182556(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr02G002830 Chr02 NC_080388.1:48395309-48395322promoter 内 3497-3510 bp + 491 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 48390894-48394818(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr02G005516 Chr02 NC_080388.1:75265649-75265662promoter 内 3491-3504 bp - 497 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 75261693-75265152(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCAAAAAAGGAAAC
SmilChr04G001387 Chr04 NC_080390.1:22538001-22538014promoter 内 3487-3500 bp - 501 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 22536700-22537500(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCAAAAAGGGAAAA
SmilChr02G005278 Chr02 NC_080388.1:73837076-73837089promoter 内 3457-3470 bp - 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 73837620-73838616(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr02G000596 Chr02 NC_080388.1:8604581-8604594promoter 内 3436-3449 bp - 552 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 8605146-8607318(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 GTTTCCTTTTTTGG
SmilChr01G003707 Chr01 NC_080387.1:55423038-55423051promoter 内 3366-3379 bp - 622 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 55420943-55422416(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr01G004565 Chr01 NC_080387.1:63723483-63723496promoter 内 3354-3367 bp + 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 63722107-63722849(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr03G001729 Chr03 NC_080389.1:23243089-23243102promoter 内 3333-3346 bp - 655 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 23241387-23242434(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr02G004850 Chr02 NC_080388.1:70648927-70648940promoter 内 3292-3305 bp - 696 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 70649636-70654261(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr03G000786 Chr03 NC_080389.1:8950609-8950622promoter 内 3279-3292 bp - 709 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 8949292-8949900(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCAAAAAGGGAAAA
SmilChr02G004316 Chr02 NC_080388.1:65494701-65494714promoter 内 3237-3250 bp + 751 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 65484708-65493950(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 GTTTCCTTTTTTGG
SmilChr01G004210 Chr01 NC_080387.1:60540442-60540455promoter 内 3201-3214 bp + 787 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 60541242-60544237(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr01G000175 Chr01 NC_080387.1:2851370-2851383promoter 内 3162-3175 bp - 826 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 2852209-2853163(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr02G003168 Chr02 NC_080388.1:52707227-52707240promoter 内 3157-3170 bp - 831 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 52703178-52706396(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr02G005277 Chr02 NC_080388.1:73837076-73837089promoter 内 3120-3133 bp - 868 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 73834413-73836208(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr01G005497 Chr01 NC_080387.1:71874904-71874917promoter 内 3113-3126 bp + 875 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 71870273-71874029(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr03G004619 Chr03 NC_080389.1:63894744-63894757promoter 内 3105-3118 bp + 883 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 63895640-63897794(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCAAAAAAGGAAAC
SmilChr01G005709 Chr01 NC_080387.1:73321811-73321824promoter 内 3100-3113 bp + 888 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 73322712-73323531(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr01G005728 Chr01 NC_080387.1:73422946-73422959promoter 内 3077-3090 bp + 911 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 73419687-73422035(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr03G003480 Chr03 NC_080389.1:53347867-53347880promoter 内 3059-3072 bp - 929 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 53348809-53359732(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr01G002310 Chr01 NC_080387.1:40071369-40071382promoter 内 3032-3045 bp - 956 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 40072338-40074027(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr02G002095 Chr02 NC_080388.1:37608839-37608852promoter 内 3001-3014 bp - 987 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 37609839-37610911(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr02G003259 Chr02 NC_080388.1:53892193-53892206promoter 内 2992-3005 bp + 996 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 53887621-53891197(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr02G003502 Chr02 NC_080388.1:56218316-56218329promoter 内 2984-2997 bp + 1004 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 56216197-56217312(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr03G003756 Chr03 NC_080389.1:56665066-56665079promoter 内 2936-2949 bp + 1052 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 56666131-56670986(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr01G004902 Chr01 NC_080387.1:67087270-67087283promoter 内 2928-2941 bp + 1060 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 67088343-67092059(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr01G004768 Chr01 NC_080387.1:65856662-65856675promoter 内 2870-2883 bp + 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 65854747-65855544(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCCTTTTTGG
SmilChr02G001888 Chr02 NC_080388.1:34184250-34184263promoter 内 2867-2880 bp - 1121 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 34181746-34183129(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCAAAAAGGGAAAA
SmilChr02G001483 Chr02 NC_080388.1:27812644-27812657promoter 内 2856-2869 bp - 1132 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 27807831-27811512(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCAAAAAGGGAAAA
SmilChr03G002076 Chr03 NC_080389.1:31747547-31747560promoter 内 2699-2712 bp - 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 31733993-31746258(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr01G005296 Chr01 NC_080387.1:70273088-70273101promoter 内 2691-2704 bp - 1297 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 70274398-70275173(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr01G004036 Chr01 NC_080387.1:58776027-58776040promoter 内 2674-2687 bp - 1314 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 58777354-58779040(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr02G004810 Chr02 NC_080388.1:70269556-70269569promoter 内 2674-2687 bp - 1314 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 70266135-70268242(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr01G003949 Chr01 NC_080387.1:57873393-57873406promoter 内 2658-2671 bp - 1330 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 57874736-57878256(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr01G000264 Chr01 NC_080387.1:5098390-5098403promoter 内 2655-2668 bp + 1333 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 5088159-5097057(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 GTTTCCTTTTTTGG
SmilChr02G005554 Chr02 NC_080388.1:75505213-75505226promoter 内 2653-2666 bp - 1335 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 75506561-75509709(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCCTTTTTGG
SmilChr01G002129 Chr01 NC_080387.1:37296184-37296197promoter 内 2651-2664 bp + 1337 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 37297534-37299100(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr01G003411 Chr01 NC_080387.1:52762769-52762782promoter 内 2623-2636 bp - 1365 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 52764147-52770005(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr01G003360 Chr01 NC_080387.1:52346641-52346654promoter 内 2618-2631 bp - 1370 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 52337701-52345271(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr03G001287 Chr03 NC_080389.1:15071251-15071264promoter 内 2618-2631 bp - 1370 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 15065646-15069881(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr02G003169 Chr02 NC_080388.1:52707227-52707240promoter 内 2615-2628 bp - 1373 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 52708613-52716242(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr02G000304 Chr02 NC_080388.1:3842802-3842815promoter 内 2580-2593 bp - 1408 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 3839067-3841394(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr02G000260 Chr02 NC_080388.1:3335490-3335503promoter 内 2575-2588 bp + 1413 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 3336916-3346337(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr03G001137 Chr03 NC_080389.1:13094297-13094310promoter 内 2541-2554 bp - 1447 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 13095757-13096290(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr03G000481 Chr03 NC_080389.1:5123956-5123969promoter 内 2512-2525 bp + 1476 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 5118033-5122480(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr03G001169 Chr03 NC_080389.1:13451637-13451650promoter 内 2463-2476 bp + 1525 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 13453175-13453895(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAAAA
SmilChr04G000038 Chr04 NC_080390.1:359978-359991promoter 内 2457-2470 bp - 1531 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 361522-363400(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG
SmilChr04G000224 Chr04 NC_080390.1:2001549-2001562promoter 内 2346-2359 bp + 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 1999515-1999907(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTGGG