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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G001896; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004057-RA_Salv SmilChr08G001896 MYB XP_057783815.1 MP00564 AAAAATTAGGTGAAA

可能结合的靶基因

9893 个结合位点 6984 个候选靶基因 第 45 / 140 下载 TSV

上一页 45 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002289 Chr02 NC_080388.1:40433236-40433250promoter 内 2786-2800 bp + 1201 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 40431150-40432035(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTCCACCTAAATAAA
SmilChr01G001645 Chr01 NC_080387.1:30511829-30511843promoter 内 2708-2722 bp + 1279 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 30513122-30520065(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTTATTAGGTGAAA
SmilChr01G004010 Chr01 NC_080387.1:58512224-58512238promoter 内 2555-2569 bp + 1432 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 58513670-58514897(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TGATGTTTGGTGAAA
SmilChr02G001021 Chr02 NC_080388.1:18038889-18038903promoter 内 2479-2493 bp + 1508 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 18031757-18037381(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GCTGACCTAATTCAA
SmilChr03G003813 Chr03 NC_080389.1:57170450-57170464promoter 内 2325-2339 bp - 1662 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 57166094-57168788(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATAAATTAGGTCAAG
SmilChr01G005172 Chr01 NC_080387.1:69472915-69472929promoter 内 2170-2184 bp - 1817 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 69474746-69476712(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ACACACCTAACTCTA
SmilChr02G002456 Chr02 NC_080388.1:42860851-42860865promoter 内 2087-2101 bp - 1900 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 42851946-42858951(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTTATTAGGTGAAA
SmilChr01G001957 Chr01 NC_080387.1:34835828-34835842promoter 内 2022-2036 bp - 1965 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 34837807-34859598(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ACTCACCTAAATTTC
SmilChr01G005390 Chr01 NC_080387.1:71183513-71183527promoter 内 1953-1967 bp - 2034 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 71185561-71189268(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCAAATATCT
SmilChr02G002291 Chr02 NC_080388.1:40433236-40433250promoter 内 1861-1875 bp + 2126 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 40435376-40439292(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTATTTAGGTGGAC
SmilChr01G005699 Chr01 NC_080387.1:73255032-73255046promoter 内 1842-1856 bp + 2145 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 73247640-73252887(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 AGTCACCAAATTTTT
SmilChr01G000659 Chr01 NC_080387.1:14694208-14694222promoter 内 1806-1820 bp + 2181 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 14696403-14698547(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTCAGTTAGGTGACC
SmilChr03G001263 Chr03 NC_080389.1:14603288-14603302promoter 内 1806-1820 bp - 2181 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 14598107-14601107(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTAATTTAGGTGGAA
SmilChr01G004566 Chr01 NC_080387.1:63734285-63734299promoter 内 1789-1803 bp - 2198 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 63727451-63732087(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CGAAATTAGTTGAAG
SmilChr02G001264 Chr02 NC_080388.1:23171018-23171032promoter 内 1535-1549 bp - 2452 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 23173484-23176757(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CCATACCTAATTTTC
SmilChr02G004265 Chr02 NC_080388.1:64861717-64861731promoter 内 1491-1505 bp + 2496 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 64847257-64859221(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCTAATAAAA
SmilChr02G002795 Chr02 NC_080388.1:48034610-48034624promoter 内 1378-1392 bp - 2609 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 48037233-48039898(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATTTACCTAATTTAA
SmilChr01G001958 Chr01 NC_080387.1:34835828-34835842promoter 内 1334-1348 bp - 2653 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 34838495-34839820(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ACTCACCTAAATTTC
SmilChr02G004693 Chr02 NC_080388.1:69274715-69274729promoter 内 1286-1300 bp - 2701 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 69277430-69280513(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTGCACCTAACATAT
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SmilChr02G001126 Chr02 NC_080388.1:20411305-20411319promoter 内 1251-1265 bp - 2736 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 20403583-20408569(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTCAGTTAGGTGACC
SmilChr03G000462 Chr03 NC_080389.1:4941698-4941712promoter 内 708-722 bp - 3279 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 4944991-4950450(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TCTTACCTAATACTA
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SmilChr01G004448 Chr01 NC_080387.1:62577108-62577122promoter 内 444-458 bp - 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 62580665-62584244(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCAAATATCC
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SmilChr01G001903 Chr01 NC_080387.1:34137716-34137730promoter 内 3578-3592 bp - 409 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 5 34138139-34140145(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TCTCACCTAATAAAA
SmilChr01G001861 Chr01 NC_080387.1:33568989-33569003promoter 内 2711-2725 bp - 1276 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 5 33570279-33572198(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TCTCACCTAATAAAA
SmilChr01G006162 Chr01 NC_080387.1:77041524-77041538promoter 内 2082-2096 bp + 1905 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 4 77038321-77039619(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATTCACCTAATAATG
SmilChr01G006152 Chr01 NC_080387.1:76967504-76967518promoter 内 1322-1336 bp + 2665 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 4 76970183-76971980(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CATTATTAGGTGAAT
SmilChr01G004597 Chr01 NC_080387.1:63947827-63947841promoter 内 3879-3893 bp - 108 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 63944759-63947719(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ACTAATTAGGTCGGG
SmilChr02G005452 Chr02 NC_080388.1:74863011-74863025promoter 内 3566-3580 bp - 421 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 74863446-74865599(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATTTACCTAATATTT
SmilChr02G000281 Chr02 NC_080388.1:3595959-3595973promoter 内 3405-3419 bp + 582 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 3587184-3595377(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TCTCACCTAATAAAA
SmilChr01G003100 Chr01 NC_080387.1:49809963-49809977promoter 内 3305-3319 bp - 682 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 49805545-49809281(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 AAATATTAGGTAAAT
SmilChr01G006098 Chr01 NC_080387.1:76457253-76457267promoter 内 2874-2888 bp - 1113 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 76458380-76459888(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATTCACCTAATAATG
SmilChr02G003727 Chr02 NC_080388.1:58906186-58906200promoter 内 2154-2168 bp - 1833 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 58896027-58904353(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATAGATTAGGTGGCA
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SmilChr03G002883 Chr03 NC_080389.1:45512449-45512463promoter 内 3362-3376 bp - 625 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 45511281-45511824(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 AAAAATTAGGTTGGG
SmilChr01G004494 Chr01 NC_080387.1:63063945-63063959promoter 内 3127-3141 bp - 860 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 63064819-63070667(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATTCACCTAAATCTT
SmilChr03G000747 Chr03 NC_080389.1:8542107-8542121promoter 内 3090-3104 bp + 897 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 8543018-8544377(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GGAAATTAGGTGTAT
SmilChr01G002392 Chr01 NC_080387.1:41200633-41200647promoter 内 2910-2924 bp - 1077 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 41201724-41202541(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTGTACCTAATTAAT
SmilChr03G000152 Chr03 NC_080389.1:1645486-1645500promoter 内 2779-2793 bp - 1208 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 1640738-1644278(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATTAATTAGGTAACG
SmilChr02G004713 Chr02 NC_080388.1:69398935-69398949promoter 内 2622-2636 bp + 1365 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 69400314-69401812(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 AAAAATTAGGTAGTA
SmilChr01G006138 Chr01 NC_080387.1:76889170-76889184promoter 内 2372-2386 bp - 1615 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 76890799-76892272(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATTCACCTAATAATG
SmilChr03G003052 Chr03 NC_080389.1:47414218-47414232promoter 内 2292-2306 bp - 1695 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 47411397-47412523(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTGATGTAGGTGAAA
SmilChr01G005743 Chr01 NC_080387.1:73532304-73532318promoter 内 1941-1955 bp - 2046 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 73534364-73538552(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATTCACCTAATAATG