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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004009; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00018864-RA_Salv SmilChr05G004009 MYB XP_057810662.1 MP00216 AAAAAAGTTAGGTAG

可能结合的靶基因

9832 个结合位点 7342 个候选靶基因 第 85 / 147 下载 TSV

上一页 85 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000731 Chr02 NC_080388.1:11858174-11858188promoter 内 1813-1827 bp - 2174 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 11860362-11863701(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CAACCTAACACCTTA
SmilChr03G001750 Chr03 NC_080389.1:23741729-23741743promoter 内 1764-1778 bp - 2223 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 23736896-23739506(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTAATAATTAGGTAT
SmilChr01G000281 Chr01 NC_080387.1:5524260-5524274promoter 内 1754-1768 bp + 2233 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 5521374-5522027(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GGACCTAACATTTAA
SmilChr02G002744 Chr02 NC_080388.1:47422514-47422528promoter 内 1744-1758 bp - 2243 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 47424771-47425681(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GGACCTAACAATCGG
SmilChr01G001635 Chr01 NC_080387.1:30396228-30396242promoter 内 1742-1756 bp + 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 30398487-30404790(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AGGAATATTAGGTAT
SmilChr04G001737 Chr04 NC_080390.1:28601506-28601520promoter 内 1670-1684 bp + 2317 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 28593473-28599189(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TAACCTAACTCATAA
SmilChr01G002164 Chr01 NC_080387.1:37680928-37680942promoter 内 1651-1665 bp + 2336 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 37683278-37684804(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TCAAAATTTAGGTAA
SmilChr01G001789 Chr01 NC_080387.1:32749561-32749575promoter 内 1577-1591 bp + 2410 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 32751985-32754320(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GCCCGGGTTAGGTCA
SmilChr04G001102 Chr04 NC_080390.1:15778319-15778333promoter 内 1542-1556 bp - 2445 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 15780778-15784295(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAACCTAACACTTGG
SmilChr03G001178 Chr03 NC_080389.1:13532242-13532256promoter 内 1517-1531 bp - 2470 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 13528672-13529772(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAAGTGATTAGGTAA
SmilChr02G000536 Chr02 NC_080388.1:7389738-7389752promoter 内 1502-1516 bp - 2485 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 7392237-7393374(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GTACCTAACACAGTC
SmilChr03G000409 Chr03 NC_080389.1:4440859-4440873promoter 内 1455-1469 bp - 2532 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 4437397-4438327(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTGGGAGTTAGGTCA
SmilChr01G004217 Chr01 NC_080387.1:60571200-60571214promoter 内 1452-1466 bp - 2535 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 60565055-60568665(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TCAAAATTTAGGTAC
SmilChr02G003876 Chr02 NC_080388.1:60816971-60816985promoter 内 1405-1419 bp - 2582 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 60812787-60814389(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CACTAAATTAGGTAA
SmilChr01G000934 Chr01 NC_080387.1:19817227-19817241promoter 内 1399-1413 bp + 2588 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 19803718-19814639(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAAATTCTCA
SmilChr01G000933 Chr01 NC_080387.1:19788772-19788786promoter 内 1397-1411 bp + 2590 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 19775261-19786182(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAAATTCTCA
SmilChr02G003408 Chr02 NC_080388.1:55261814-55261828promoter 内 1276-1290 bp + 2711 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 55256670-55259103(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTCCCTAACTCCTTT
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SmilChr03G003104 Chr03 NC_080389.1:48174820-48174834promoter 内 1155-1169 bp - 2832 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 48177666-48181769(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AGACCTAACAACTTT
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SmilChr01G001678 Chr01 NC_080387.1:30988616-30988630promoter 内 649-663 bp + 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 30978791-30985278(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GGACCTAACAATGTT
SmilChr01G001121 Chr01 NC_080387.1:22835697-22835711promoter 内 614-628 bp - 3373 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 22831740-22832324(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GAAGATATTAGGTAA
SmilChr03G002495 Chr03 NC_080389.1:39740702-39740716promoter 内 586-600 bp + 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 39744117-39747305(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTCCAAGTTAGGTTT
SmilChr02G003142 Chr02 NC_080388.1:52433580-52433594promoter 内 524-538 bp + 3463 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 52437057-52437611(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AGGTGGGTTAGGTTC
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SmilChr03G000408 Chr03 NC_080389.1:4440859-4440873promoter 内 438-452 bp - 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 4436879-4437310(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTGGGAGTTAGGTCA
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SmilChr03G000087 Chr03 NC_080389.1:1008605-1008619promoter 内 256-270 bp - 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 995964-1004874(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTGGGAGTTAGGTCA
SmilChr02G002544 Chr02 NC_080388.1:44300020-44300034promoter 内 255-269 bp + 3732 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 44294146-44296288(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GTACCTAACAAAGCT
SmilChr04G000622 Chr04 NC_080390.1:7075781-7075795promoter 内 205-219 bp - 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 7070855-7071999(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AACATTGTTAGGTCC
SmilChr01G002677 Chr01 NC_080387.1:44986856-44986870promoter 内 99-113 bp - 3888 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 44979716-44982968(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GAAGTTGTTAGGTCT
SmilChr04G001372 Chr04 NC_080390.1:22312066-22312080promoter 内 48-62 bp - 3939 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 22316019-22316921(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATACCTAAGTCTGGC
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SmilChr02G002630 Chr02 NC_080388.1:45682315-45682329promoter 内 2155-2169 bp + 1832 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 4 45684161-45685721(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TACAAATTTAGGTAG
SmilChr02G004463 Chr02 NC_080388.1:67055800-67055814promoter 内 1680-1694 bp + 2307 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 4 67049021-67053493(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GAACCTAACAATTGA
SmilChr02G004464 Chr02 NC_080388.1:67055800-67055814promoter 内 1326-1340 bp + 2661 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 4 67058475-67063551(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TCAATTGTTAGGTTC
SmilChr01G002748 Chr01 NC_080387.1:45804311-45804325promoter 内 3515-3529 bp + 472 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 45802255-45803839(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAATATTAGA
SmilChr03G004441 Chr03 NC_080389.1:62552659-62552673promoter 内 2945-2959 bp - 1042 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 62553715-62584049(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GTACCTAACAAGGAC
SmilChr03G004232 Chr03 NC_080389.1:60855760-60855774promoter 内 2214-2228 bp - 1773 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 60853081-60853987(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAAGGCGTTAGGTAC