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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 9 / 138 下载 TSV

上一页 9 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001503 Chr03 NC_080389.1:18390519-18390531promoter 内 786-798 bp + 3203 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 18383325-18387316(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATGGTCAACGGG
SmilChr01G005701 Chr01 NC_080387.1:73260662-73260674promoter 内 3896-3908 bp + 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 73257396-73260569(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATGGTCAACGTT
SmilChr02G000183 Chr02 NC_080388.1:2320712-2320724promoter 内 3197-3209 bp + 792 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 2321516-2326040(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCGTTGACCATG
SmilChr01G000509 Chr01 NC_080387.1:10347463-10347475promoter 内 2843-2855 bp - 1146 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 10339985-10346317(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCGTTGACCGGG
SmilChr02G004276 Chr02 NC_080388.1:64957671-64957683promoter 内 2759-2771 bp + 1230 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 64954210-64956441(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAAGTCAACGCG
SmilChr01G000559 Chr01 NC_080387.1:11647293-11647305promoter 内 2686-2698 bp + 1303 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 11644323-11645990(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGGTCAACGCG
SmilChr02G003527 Chr02 NC_080388.1:56420880-56420892promoter 内 2632-2644 bp + 1357 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 56422249-56426658(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACTATT
SmilChr02G003579 Chr02 NC_080388.1:56960633-56960645promoter 内 2421-2433 bp + 1568 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 56962213-56966574(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACTATT
SmilChr02G003375 Chr02 NC_080388.1:54891305-54891317promoter 内 2263-2275 bp + 1726 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 54887308-54889579(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGGTCAACGTT
SmilChr02G000182 Chr02 NC_080388.1:2320712-2320724promoter 内 2206-2218 bp + 1783 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 2316010-2318929(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATGGTCAACGAA
SmilChr03G000783 Chr03 NC_080389.1:8932867-8932879promoter 内 1866-1878 bp + 2123 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 8926994-8930744(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTGGTCAACGAA
SmilChr01G001386 Chr01 NC_080387.1:27258697-27258709promoter 内 954-966 bp - 3035 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 27261744-27264782(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAAGTCAACGGG
SmilChr03G000914 Chr03 NC_080389.1:10461388-10461400promoter 内 3910-3922 bp - 79 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 3 10461479-10467262(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCAGTCAACGCC
SmilChr02G000156 Chr02 NC_080388.1:2025823-2025835promoter 内 3224-3236 bp + 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 2021802-2025058(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATGGTCAACGCG
SmilChr01G001222 Chr01 NC_080387.1:24509539-24509551promoter 内 1532-1544 bp + 2457 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 24490718-24507082(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGTAGTCAACGCC
SmilChr01G005751 Chr01 NC_080387.1:73592339-73592351promoter 内 1487-1499 bp + 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 73588147-73589837(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CACGGTCAACGAA
SmilChr02G001831 Chr02 NC_080388.1:33328151-33328163promoter 内 1445-1457 bp - 2544 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 33330707-33330813(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGGTCAACGCG
SmilChr01G005655 Chr01 NC_080387.1:72901519-72901531promoter 内 438-450 bp - 3551 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 72905082-72906357(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGGTCAACGGG
SmilChr01G000271 Chr01 NC_080387.1:5367710-5367722promoter 内 410-422 bp + 3579 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 5363352-5364131(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGTAGTCAACGCC
SmilChr02G005376 Chr02 NC_080388.1:74440039-74440051promoter 内 184-196 bp - 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 74431320-74436234(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGTTGACTAAC
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SmilChr02G000157 Chr02 NC_080388.1:2026397-2026409promoter 内 3787-3799 bp - 202 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 2025881-2026195(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACCATC
SmilChr01G000653 Chr01 NC_080387.1:14518427-14518439promoter 内 3581-3593 bp + 408 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 14516943-14518019(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACAGTCAACGCG
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SmilChr01G005141 Chr01 NC_080387.1:69195697-69195709promoter 内 3157-3169 bp - 832 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 69196541-69199173(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATGGTCAACGCG
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SmilChr01G000855 Chr01 NC_080387.1:18426746-18426758promoter 内 2868-2880 bp - 1121 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 18427879-18429114(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATGGTCAACGCG
SmilChr02G001114 Chr02 NC_080388.1:20110369-20110381promoter 内 2468-2480 bp - 1521 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 20105086-20108848(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCGTTGACTTGG
SmilChr01G002279 Chr01 NC_080387.1:39580783-39580795promoter 内 2281-2293 bp + 1708 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 39582503-39591376(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGCGTTGACTACG
SmilChr03G002729 Chr03 NC_080389.1:43354646-43354658promoter 内 2122-2134 bp - 1867 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 43351839-43352779(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACCATC
SmilChr02G000665 Chr02 NC_080388.1:10213000-10213012promoter 内 1138-1150 bp - 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 10208037-10210149(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACCATC
SmilChr01G002240 Chr01 NC_080387.1:38946143-38946155promoter 内 831-843 bp + 3158 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 38949313-38953240(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCGTTGACCTTG
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SmilChr01G005816 Chr01 NC_080387.1:74156952-74156964promoter 内 488-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 74152452-74153451(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATGGTCAACGGG
SmilChr01G004125 Chr01 NC_080387.1:59734580-59734592promoter 内 152-164 bp + 3837 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 59738429-59750632(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCGTTGACCTTT
SmilChr01G001496 Chr01 NC_080387.1:28809200-28809212promoter 内 3227-3239 bp - 762 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 6 28809974-28814378(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAAGTCAACGAT
SmilChr03G000504 Chr03 NC_080389.1:5433369-5433381promoter 内 3073-3085 bp + 916 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 6 5434297-5437684(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCGTTGACTTTT
SmilChr01G001495 Chr01 NC_080387.1:28809200-28809212promoter 内 348-360 bp - 3641 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 6 28804866-28805559(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCGTTGACTTTT
SmilChr03G004280 Chr03 NC_080389.1:61232472-61232484promoter 内 3253-3265 bp - 736 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 4 61233220-61236207(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCGGTCAACGAT
SmilChr01G001926 Chr01 NC_080387.1:34399126-34399138promoter 内 2564-2576 bp + 1425 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 4 34400563-34402953(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGTTGACTGAC
SmilChr01G001925 Chr01 NC_080387.1:34399126-34399138promoter 内 2263-2275 bp + 1726 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 4 34395602-34397400(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCAGTCAACGGC
SmilChr01G001233 Chr01 NC_080387.1:24759741-24759753promoter 内 1449-1461 bp - 2540 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 4 24762293-24763434(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAAGTCAACGAT
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SmilChr01G002870 Chr01 NC_080387.1:47308134-47308146promoter 内 3320-3332 bp + 669 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 47308815-47312567(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCGTTGACTTTT