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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G003924; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010794-RA_Salv SmilChr03G003924 NAC XP_057798851.1 MP00059 TAACACGCCACA

可能结合的靶基因

9940 个结合位点 8333 个候选靶基因 第 37 / 167 下载 TSV

上一页 37 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003505 Chr02 NC_080388.1:56239384-56239395promoter 内 2795-2806 bp - 1195 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 56240590-56243338(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGTTG
SmilChr03G003527 Chr03 NC_080389.1:53885566-53885577promoter 内 2648-2659 bp + 1342 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 53878008-53884224(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGTTG
SmilChr08G002062 Chr08 NC_080394.1:18487288-18487299promoter 内 2444-2455 bp - 1546 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 18488845-18492567(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGGGG
SmilChr07G002930 Chr07 NC_080393.1:29659234-29659245promoter 内 2405-2416 bp + 1585 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 29657578-29657649(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGTCA
SmilChr05G001102 Chr05 NC_080391.1:9164600-9164611promoter 内 2273-2284 bp + 1717 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 9166328-9170099(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCACACGCCATG
SmilChr06G003090 Chr06 NC_080392.1:43749869-43749880promoter 内 2234-2245 bp - 1756 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 43751636-43753957(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGGGG
SmilChr07G002929 Chr07 NC_080393.1:29659234-29659245promoter 内 2190-2201 bp + 1800 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 29651169-29657434(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGTCA
SmilChr07G000456 Chr07 NC_080393.1:3224529-3224540promoter 内 2050-2061 bp - 1940 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 3226480-3233069(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCTGGCGTGTTT
SmilChr05G001104 Chr05 NC_080391.1:9169344-9169355promoter 内 798-809 bp + 3192 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 9172547-9175840(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCGCACGCCATA
SmilChr05G003815 Chr05 NC_080391.1:51445172-51445183promoter 内 716-727 bp + 3274 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 51448457-51451631(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGGCACGCCATA
SmilChr02G003230 Chr02 NC_080388.1:53572060-53572071promoter 内 499-510 bp - 3491 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 53575562-53577213(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCTGGCGTGTTT
SmilChr05G001235 Chr05 NC_080391.1:10464521-10464532promoter 内 431-442 bp + 3559 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 10468091-10474523(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGGCACGCCATA
SmilChr01G000081 Chr01 NC_080387.1:1520342-1520353promoter 内 394-405 bp + 3596 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 1513404-1516746(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGTGA
SmilChr07G000118 Chr07 NC_080393.1:663140-663151promoter 内 3920-3931 bp + 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 663221-665376(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGCCACGCCACA
SmilChr03G004086 Chr03 NC_080389.1:59770805-59770816promoter 内 3895-3906 bp + 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 59765665-59770710(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGTGA
SmilChr06G002928 Chr06 NC_080392.1:42150860-42150871promoter 内 3869-3880 bp - 121 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 42150992-42153855(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGGCC
SmilChr05G004288 Chr05 NC_080391.1:56662170-56662181promoter 内 3851-3862 bp + 139 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 56662320-56668544(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGACACGCCATA
SmilChr01G005126 Chr01 NC_080387.1:69063914-69063925promoter 内 3806-3817 bp - 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 69060113-69063730(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GAACACGCCATC
SmilChr05G003125 Chr05 NC_080391.1:39891276-39891287promoter 内 3757-3768 bp - 233 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 39889837-39891043(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGCCACGCCACA
SmilChr08G000790 Chr08 NC_080394.1:5819716-5819727promoter 内 3720-3731 bp - 270 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 5819997-5822606(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGTCA
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SmilChr02G003551 Chr02 NC_080388.1:56656454-56656465promoter 内 3614-3625 bp + 376 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 56650319-56656078(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCTGGCGTGTTT
SmilChr02G003609 Chr02 NC_080388.1:57347145-57347156promoter 内 3552-3563 bp + 438 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 57340981-57346707(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCTGGCGTGTTT
SmilChr03G001474 Chr03 NC_080389.1:17685385-17685396promoter 内 3459-3470 bp - 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 17684069-17684854(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CCCCACGCCACA
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SmilChr06G002389 Chr06 NC_080392.1:34689931-34689942promoter 内 3318-3329 bp + 672 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 34690614-34693094(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCACACGCCATA
SmilChr03G003174 Chr03 NC_080389.1:49201719-49201730promoter 内 3296-3307 bp + 694 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 49198344-49201025(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGGCG
SmilChr07G002703 Chr07 NC_080393.1:26402262-26402273promoter 内 3279-3290 bp - 711 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 26402984-26406766(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCTGGCGTGTTT
SmilChr04G002305 Chr04 NC_080390.1:37325817-37325828promoter 内 3233-3244 bp + 757 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 37326585-37327405(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CCCCACGCCACA
SmilChr04G001731 Chr04 NC_080390.1:28554391-28554402promoter 内 3232-3243 bp + 758 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 28555160-28558097(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CAACACGCCATC
SmilChr01G003018 Chr01 NC_080387.1:49207899-49207910promoter 内 3214-3225 bp - 776 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 49203621-49207123(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCACACGCCATA
SmilChr04G002708 Chr04 NC_080390.1:42706963-42706974promoter 内 3150-3161 bp + 840 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 42707814-42709227(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGACACGCCATC
SmilChr08G000763 Chr08 NC_080394.1:5627870-5627881promoter 内 3141-3152 bp + 849 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 5628730-5633743(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GAACACGCCATG
SmilChr08G001683 Chr08 NC_080394.1:14050300-14050311promoter 内 2954-2965 bp + 1036 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 14051347-14053811(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GAACACGCCATG
SmilChr01G002474 Chr01 NC_080387.1:42483317-42483328promoter 内 2872-2883 bp - 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 42484446-42486418(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGTGA
SmilChr02G003557 Chr02 NC_080388.1:56742289-56742300promoter 内 2829-2840 bp - 1161 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 56743461-56746354(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGTTG
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SmilChr01G005062 Chr01 NC_080387.1:68527565-68527576promoter 内 2646-2657 bp - 1344 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 68528920-68531209(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCTGGCGTGTTT
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SmilChr01G005647 Chr01 NC_080387.1:72874312-72874323promoter 内 2609-2620 bp + 1381 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 72869032-72872931(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TATGGCGTGCGG
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SmilChr05G001400 Chr05 NC_080391.1:12589910-12589921promoter 内 2532-2543 bp - 1458 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 12591379-12595302(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGTTG
SmilChr02G002811 Chr02 NC_080388.1:48153645-48153656promoter 内 2466-2477 bp + 1524 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 48150724-48152121(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGTCA
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SmilChr08G000043 Chr08 NC_080394.1:289097-289108promoter 内 2293-2304 bp - 1697 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 285804-287400(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGACACGCCATA