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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 82 / 137 下载 TSV

上一页 82 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001953 Chr06 NC_080392.1:24200087-24200101promoter 内 1395-1409 bp + 2592 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 24196005-24197495(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAATCAGACGTGGCT
SmilChr04G003430 Chr04 NC_080390.1:50882258-50882272promoter 内 1355-1369 bp + 2632 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 50877702-50879626(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAATATGACGTGGAA
SmilChr07G000082 Chr07 NC_080393.1:419810-419824promoter 内 1321-1335 bp - 2666 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 404414-417144(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTCATTTAA
SmilChr07G001721 Chr07 NC_080393.1:14647633-14647647promoter 内 1061-1075 bp + 2926 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 14643742-14644707(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTATTCCACGTGGCA
SmilChr07G002217 Chr07 NC_080393.1:20408151-20408165promoter 内 1054-1068 bp + 2933 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 20411098-20417709(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr08G001919 Chr08 NC_080394.1:16718388-16718402promoter 内 892-906 bp + 3095 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 16712997-16715293(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTAAATGACGTGGCG
SmilChr03G003730 Chr03 NC_080389.1:56328563-56328577promoter 内 823-837 bp - 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56331741-56336354(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAGCATCACGTGGCA
SmilChr04G003633 Chr04 NC_080390.1:52840998-52841012promoter 内 809-823 bp + 3178 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 52834489-52837820(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAAAACCACGTGGCA
SmilChr04G002545 Chr04 NC_080390.1:40758607-40758621promoter 内 808-822 bp - 3179 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 40749301-40755428(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGACACGTCACCTAA
SmilChr06G001244 Chr06 NC_080392.1:12842421-12842435promoter 内 697-711 bp + 3290 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 12845725-12847086(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTCATTTAA
SmilChr01G001362 Chr01 NC_080387.1:26972562-26972576promoter 内 694-708 bp + 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 26968437-26969269(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTAAATGACGTGGCG
SmilChr06G001954 Chr06 NC_080392.1:24200087-24200101promoter 内 644-658 bp + 3343 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 24203444-24208996(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCTGATTT
SmilChr02G003231 Chr02 NC_080388.1:53587499-53587513promoter 内 639-653 bp - 3348 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 53579680-53584151(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTACACGTCACCTTT
SmilChr01G003235 Chr01 NC_080387.1:51107617-51107631promoter 内 611-625 bp + 3376 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 51101765-51104241(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAATCGACGTGGCA
SmilChr03G000103 Chr03 NC_080389.1:1143618-1143632promoter 内 601-615 bp + 3386 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 1147018-1154474(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCAGTTTT
SmilChr03G002945 Chr03 NC_080389.1:46197536-46197550promoter 内 601-615 bp + 3386 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 46191717-46194150(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAATCGACGTGGCA
SmilChr04G004119 Chr04 NC_080390.1:56064738-56064752promoter 内 530-544 bp + 3457 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56068209-56070531(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTAACCCGA
SmilChr02G000289 Chr02 NC_080388.1:3681177-3681191promoter 内 495-509 bp - 3492 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 3676633-3677685(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr04G002043 Chr04 NC_080390.1:33155360-33155374promoter 内 468-482 bp + 3519 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 33148031-33151841(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGTGCCAACGTGGCA
SmilChr03G003171 Chr03 NC_080389.1:49079705-49079719promoter 内 461-475 bp + 3526 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 49083245-49091468(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr03G000832 Chr03 NC_080389.1:9559133-9559147promoter 内 450-464 bp + 3537 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 9548359-9555596(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTTGTCGACGTGGCT
SmilChr01G002796 Chr01 NC_080387.1:46452217-46452231promoter 内 376-390 bp + 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 46455842-46458021(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr03G004536 Chr03 NC_080389.1:63396686-63396700promoter 内 215-229 bp - 3772 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 63392106-63392914(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCATATTT
SmilChr07G000083 Chr07 NC_080393.1:419810-419824promoter 内 207-221 bp - 3780 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 423604-429043(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTAAATGACGTGGCG
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SmilChr08G001569 Chr08 NC_080394.1:12918739-12918753promoter 内 167-181 bp + 3820 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 12913949-12914919(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTAAATGACGTGGCG
SmilChr02G004184 Chr02 NC_080388.1:64167570-64167584promoter 内 151-165 bp - 3836 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 64157960-64163734(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTTACCA
SmilChr02G000479 Chr02 NC_080388.1:6586591-6586605promoter 内 133-147 bp + 3854 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 6579395-6582737(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CAAGTTGACGTGGCT
SmilChr02G005178 Chr02 NC_080388.1:73074408-73074422promoter 内 105-119 bp - 3882 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 73078304-73085938(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAATATGACGTGGAA
SmilChr04G000466 Chr04 NC_080390.1:4994846-4994860promoter 内 77-91 bp + 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 4998770-5000404(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCTGCTGG
SmilChr07G004656 Chr07 NC_080393.1:59480061-59480075promoter 内 77-91 bp + 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 59483985-59491003(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr02G005598 Chr02 NC_080388.1:75713582-75713596promoter 内 50-64 bp + 3937 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 75708951-75709645(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCAGGTGACGTGGAT
SmilChr07G000007 Chr07 NC_080393.1:30607-30621promoter 内 40-54 bp - 3947 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 23315-26660(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTTGGCAGC
SmilChr07G002144 Chr07 NC_080393.1:19608266-19608280promoter 内 4-18 bp - 3983 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 19601605-19604283(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr04G003536 Chr04 NC_080390.1:51724804-51724818promoter 内 3838-3852 bp - 149 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 5 51720969-51724655(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCCACGTCATCTCT
SmilChr05G003252 Chr05 NC_080391.1:41916993-41917007promoter 内 3702-3716 bp + 285 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 41914380-41916708(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAATATTACGTGGCG
SmilChr02G001198 Chr02 NC_080388.1:22117515-22117529promoter 内 3580-3594 bp - 407 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 22117936-22121739(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGTGCTGACCTGGCC
SmilChr07G000850 Chr07 NC_080393.1:6062724-6062738promoter 内 3554-3568 bp + 433 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 6063171-6068599(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCCACGTCATCTCT
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SmilChr02G003398 Chr02 NC_080388.1:55120256-55120270promoter 内 3896-3910 bp - 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 55120361-55122165(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCACGCCACGTGGCG
SmilChr02G005241 Chr02 NC_080388.1:73581125-73581139promoter 内 3727-3741 bp - 260 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 73577522-73580865(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGATAA
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SmilChr02G004914 Chr02 NC_080388.1:71125573-71125587promoter 内 3267-3281 bp - 720 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 71126307-71126386(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTTGGAGACGTGGAC
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SmilChr02G004915 Chr02 NC_080388.1:71125573-71125587promoter 内 2287-2301 bp - 1700 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 71127287-71131478(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTTGGAGACGTGGAC
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SmilChr01G005106 Chr01 NC_080387.1:68850902-68850916promoter 内 2046-2060 bp + 1941 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 68852857-68853840(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGAAATTT
SmilChr04G002673 Chr04 NC_080390.1:42142830-42142844promoter 内 1997-2011 bp - 1990 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 42144834-42149368(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTTATTGACGTGGCA