转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 1 / 143 下载 TSV

1 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005682 Chr01 NC_080387.1:73087706-73087717promoter 内 3387-3398 bp + 603 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.9/ 100 4 73086236-73087103(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCAC
SmilChr05G000679 Chr05 NC_080391.1:5180867-5180878promoter 内 2451-2462 bp + 1539 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.9/ 100 2 5182417-5183946(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGCCAGCTGTC
SmilChr02G000215 Chr02 NC_080388.1:2820614-2820625promoter 内 2393-2404 bp + 1597 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.9/ 100 2 2817805-2819017(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCAC
SmilChr03G004722 Chr03 NC_080389.1:64436309-64436320promoter 内 1285-1296 bp - 2705 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.9/ 100 2 64430510-64433604(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGCCAGCTGTC
SmilChr05G000680 Chr05 NC_080391.1:5180867-5180878promoter 内 652-663 bp + 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.9/ 100 2 5184216-5184288(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGCCAGCTGTC
SmilChr08G001366 Chr08 NC_080394.1:10894048-10894059promoter 内 538-549 bp - 3452 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.9/ 100 2 10897511-10898461(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCAC
SmilChr03G003564 Chr03 NC_080389.1:54292751-54292762promoter 内 240-251 bp + 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.8/ 100 4 54284146-54289001(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCAA
SmilChr08G002141 Chr08 NC_080394.1:19272925-19272936promoter 内 1464-1475 bp + 2526 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.8/ 100 3 19267736-19270399(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCAA
SmilChr01G000986 Chr01 NC_080387.1:20880466-20880477promoter 内 2828-2839 bp - 1162 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.8/ 100 2 20874144-20879304(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTC
SmilChr01G001123 Chr01 NC_080387.1:22839676-22839687promoter 内 2823-2834 bp + 1167 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.8/ 100 2 22840854-22842220(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTC
SmilChr04G002008 Chr04 NC_080390.1:32573741-32573752promoter 内 677-688 bp + 3313 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.8/ 100 2 32568455-32570428(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCAA
SmilChr03G004636 Chr03 NC_080389.1:63975254-63975265promoter 内 3205-3216 bp + 785 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 2 63976050-63982362(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGCCAGCTGTC
SmilChr08G000333 Chr08 NC_080394.1:2331251-2331262promoter 内 2884-2895 bp + 1106 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 2 2328319-2330145(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCAT
SmilChr08G000334 Chr08 NC_080394.1:2331251-2331262promoter 内 2210-2221 bp + 1780 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 2 2333042-2346324(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGCCAGCTGTC
SmilChr03G001408 Chr03 NC_080389.1:16713641-16713652promoter 内 2027-2038 bp + 1963 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 2 16715615-16718826(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGCCAGCTGTC
SmilChr03G004635 Chr03 NC_080389.1:63975254-63975265promoter 内 1484-1495 bp + 2506 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 2 63971211-63972748(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCAT
SmilChr05G000185 Chr05 NC_080391.1:1494670-1494681promoter 内 374-385 bp + 3616 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 4 1490659-1491054(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCCAGCTGTCAC
SmilChr01G004371 Chr01 NC_080387.1:61926005-61926016promoter 内 1316-1327 bp - 2674 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 2 61922627-61923331(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGGC
SmilChr03G003205 Chr03 NC_080389.1:49595376-49595387promoter 内 550-561 bp - 3440 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 2 49589777-49591936(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGGC
SmilChr07G003433 Chr07 NC_080393.1:37733350-37733361promoter 内 1459-1470 bp - 2531 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 3 37735892-37738915(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCAA
SmilChr01G000997 Chr01 NC_080387.1:21009315-21009326promoter 内 3760-3771 bp - 230 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 21002777-21009085(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTA
SmilChr08G003618 Chr08 NC_080394.1:39357137-39357148promoter 内 3261-3272 bp - 729 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 39353947-39356408(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTA
SmilChr01G001107 Chr01 NC_080387.1:22681255-22681266promoter 内 3097-3108 bp + 893 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 22682159-22689602(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTA
SmilChr02G002091 Chr02 NC_080388.1:37540249-37540260promoter 内 3090-3101 bp - 900 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 37538642-37539349(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTA
SmilChr05G002877 Chr05 NC_080391.1:34450477-34450488promoter 内 571-582 bp - 3419 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 34445134-34447058(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGTC
SmilChr07G002390 Chr07 NC_080393.1:22290157-22290168promoter 内 241-252 bp + 3749 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 5 22284890-22286408(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCAT
SmilChr02G002955 Chr02 NC_080388.1:50088261-50088272promoter 内 3615-3626 bp + 375 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 4 50088647-50091298(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGCCAGCTGTA
SmilChr05G003020 Chr05 NC_080391.1:37597421-37597432promoter 内 2738-2749 bp + 1252 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 4 37595765-37596169(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTCAA
SmilChr06G000016 Chr06 NC_080392.1:248178-248189promoter 内 2232-2243 bp - 1758 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 3 242648-246420(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGGC
SmilChr03G002085 Chr03 NC_080389.1:32086927-32086938promoter 内 1600-1611 bp - 2390 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 3 32080679-32084537(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTC
SmilChr01G003309 Chr01 NC_080387.1:51776405-51776416promoter 内 1592-1603 bp - 2398 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 3 51778814-51781960(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCCAGCTGTCAA
SmilChr08G002686 Chr08 NC_080394.1:26478096-26478107promoter 内 3344-3355 bp - 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 26476623-26477450(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTC
SmilChr08G002687 Chr08 NC_080394.1:26478096-26478107promoter 内 2643-2654 bp - 1347 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 26479454-26480477(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTCAA
SmilChr08G002618 Chr08 NC_080394.1:25531397-25531408promoter 内 2551-2562 bp + 1439 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 25532847-25536965(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTC
SmilChr04G004080 Chr04 NC_080390.1:55859183-55859194promoter 内 2348-2359 bp - 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 55855346-55857541(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGCCAGCTGTG
SmilChr02G001211 Chr02 NC_080388.1:22305489-22305500promoter 内 1753-1764 bp - 2237 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 22300368-22303252(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTC
SmilChr02G001210 Chr02 NC_080388.1:22288595-22288606promoter 内 1752-1763 bp - 2238 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 22283444-22286357(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTC
SmilChr08G000575 Chr08 NC_080394.1:4181542-4181553promoter 内 1698-1709 bp - 2292 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 4183845-4185362(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCAT
SmilChr02G001358 Chr02 NC_080388.1:25405846-25405857promoter 内 1613-1624 bp + 2377 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 25400788-25403469(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCCAGCTGTCAA
SmilChr01G005140 Chr01 NC_080387.1:69171793-69171804promoter 内 1567-1578 bp + 2423 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 69174227-69175474(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGCCAGCTGTA
SmilChr08G002823 Chr08 NC_080394.1:28064664-28064675promoter 内 1395-1406 bp + 2595 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 28067270-28067896(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTC
SmilChr02G003127 Chr02 NC_080388.1:52294928-52294939promoter 内 1017-1028 bp - 2973 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 52297912-52299027(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTCAA
SmilChr02G001192 Chr02 NC_080388.1:21898786-21898797promoter 内 1002-1013 bp - 2988 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 21893830-21895798(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTC
SmilChr07G004188 Chr07 NC_080393.1:53909447-53909458promoter 内 941-952 bp - 3049 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 53903475-53906398(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGCCAGCTGTA
SmilChr08G001819 Chr08 NC_080394.1:15352435-15352446promoter 内 821-832 bp - 3169 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 15355615-15358122(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCAC
SmilChr06G003117 Chr06 NC_080392.1:44015285-44015296promoter 内 733-744 bp - 3257 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 44009789-44012028(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGCCAGCTGTG
SmilChr02G002682 Chr02 NC_080388.1:46461992-46462003promoter 内 688-699 bp - 3302 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 46465305-46469714(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCCAGCTGTCAA
SmilChr07G003947 Chr07 NC_080393.1:49903321-49903332promoter 内 650-661 bp - 3340 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 49906672-49913349(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTCAA
SmilChr01G005138 Chr01 NC_080387.1:69171793-69171804promoter 内 276-287 bp + 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 69164447-69168079(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCAT
SmilChr02G003030 Chr02 NC_080388.1:51002341-51002352promoter 内 236-247 bp - 3754 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 51006106-51006841(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCAT