转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G003924; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010794-RA_Salv SmilChr03G003924 NAC XP_057798851.1 MP00059 TAACACGCCACA

可能结合的靶基因

9940 个结合位点 8333 个候选靶基因 第 5 / 167 下载 TSV

上一页 5 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003980 Chr04 NC_080390.1:55243990-55244001promoter 内 349-360 bp - 3641 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 55247642-55254934(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGTGGCGTGCGA
SmilChr07G003707 Chr07 NC_080393.1:44732352-44732363promoter 内 321-332 bp + 3669 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 44736032-44738258(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCGCACGCCACG
SmilChr01G002571 Chr01 NC_080387.1:43804247-43804258promoter 内 272-283 bp - 3718 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 43795685-43800529(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCACACGCCACC
SmilChr05G004319 Chr05 NC_080391.1:56849215-56849226promoter 内 223-234 bp - 3767 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 56843286-56845448(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CAACACGCCACC
SmilChr07G000641 Chr07 NC_080393.1:4322752-4322763promoter 内 155-166 bp - 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 4316350-4318917(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCGCACGCCACG
SmilChr04G001448 Chr04 NC_080390.1:23797102-23797113promoter 内 125-136 bp + 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 23800978-23809216(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CCGCACGCCACA
SmilChr03G002779 Chr03 NC_080389.1:44222219-44222230promoter 内 73-84 bp - 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 44226147-44229024(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGTGGCGTGTTC
SmilChr01G003827 Chr01 NC_080387.1:56604088-56604099promoter 内 1700-1711 bp + 2290 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 7 56599963-56601798(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTGC
SmilChr01G004644 Chr01 NC_080387.1:64484301-64484312promoter 内 1543-1554 bp - 2447 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 3 64486759-64489939(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTGC
SmilChr03G001090 Chr03 NC_080389.1:12606291-12606302promoter 内 2315-2326 bp - 1675 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 12607977-12609094(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTCG
SmilChr07G001368 Chr07 NC_080393.1:10607836-10607847promoter 内 1998-2009 bp - 1992 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 10609839-10612787(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTGG
SmilChr03G000377 Chr03 NC_080389.1:4209586-4209597promoter 内 1709-1720 bp + 2281 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 4206521-4207305(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTCG
SmilChr03G000327 Chr03 NC_080389.1:3729905-3729916promoter 内 39-50 bp + 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 3733867-3734983(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGACACGCCACA
SmilChr02G003751 Chr02 NC_080388.1:59156548-59156559promoter 内 3896-3907 bp + 94 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 59156653-59157317(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCACACGCCACA
SmilChr03G001988 Chr03 NC_080389.1:29131665-29131676promoter 内 3768-3779 bp + 222 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 29124350-29131443(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTGC
SmilChr07G002136 Chr07 NC_080393.1:19509452-19509463promoter 内 3551-3562 bp - 439 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 19509902-19513320(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTGC
SmilChr08G000325 Chr08 NC_080394.1:2276781-2276792promoter 内 3349-3360 bp + 641 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 2274100-2276140(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTCG
SmilChr08G003559 Chr08 NC_080394.1:38268352-38268363promoter 内 3288-3299 bp + 702 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 38266321-38267650(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTGG
SmilChr01G005036 Chr01 NC_080387.1:68305161-68305172promoter 内 2986-2997 bp - 1004 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 68298512-68304157(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGACACGCCACA
SmilChr04G002442 Chr04 NC_080390.1:39121511-39121522promoter 内 2909-2920 bp + 1081 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 39122603-39123336(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CCACACGCCACA
SmilChr02G000074 Chr02 NC_080388.1:950166-950177promoter 内 2596-2607 bp - 1394 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 945915-948772(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCACACGCCACA
SmilChr02G002586 Chr02 NC_080388.1:44959624-44959635promoter 内 2564-2575 bp - 1426 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 44958127-44958198(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CCACACGCCACA
SmilChr02G003752 Chr02 NC_080388.1:59156548-59156559promoter 内 2320-2331 bp + 1670 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 59158229-59162643(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCACACGCCACA
SmilChr07G001479 Chr07 NC_080393.1:11641083-11641094promoter 内 1910-1921 bp + 2080 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 11643174-11647294(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCACACGCCACA
SmilChr02G002780 Chr02 NC_080388.1:47890669-47890680promoter 内 1808-1819 bp - 2182 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 47892862-47899489(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTCG
SmilChr01G005037 Chr01 NC_080387.1:68305161-68305172promoter 内 1662-1673 bp - 2328 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 68307500-68325829(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTCC
SmilChr02G002822 Chr02 NC_080388.1:48334175-48334186promoter 内 1651-1662 bp + 2339 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 48336525-48342033(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CCACACGCCACA
SmilChr04G001531 Chr04 NC_080390.1:25233202-25233213promoter 内 1485-1496 bp + 2505 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 25235718-25237673(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCACACGCCACA
SmilChr05G001965 Chr05 NC_080391.1:20226067-20226078promoter 内 1398-1409 bp + 2592 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 20222571-20223475(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTGC
SmilChr01G002640 Chr01 NC_080387.1:44691822-44691833promoter 内 1275-1286 bp + 2715 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 44679049-44689107(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTGC
SmilChr05G001635 Chr05 NC_080391.1:15278879-15278890promoter 内 1230-1241 bp + 2760 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 15281650-15283298(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCACACGCCACA
SmilChr08G000471 Chr08 NC_080394.1:3351049-3351060promoter 内 1080-1091 bp + 2910 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 3353970-3354995(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGACACGCCACA
SmilChr03G000325 Chr03 NC_080389.1:3729905-3729916promoter 内 1025-1036 bp + 2965 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 3725567-3726940(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTCC
SmilChr07G002864 Chr07 NC_080393.1:28793928-28793939promoter 内 838-849 bp + 3152 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 28797091-28801672(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CCACACGCCACA
SmilChr05G000094 Chr05 NC_080391.1:538823-538834promoter 内 446-457 bp + 3544 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 542378-548997(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGACACGCCACA
SmilChr06G000313 Chr06 NC_080392.1:2270132-2270143promoter 内 274-285 bp - 3716 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 2265367-2266416(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CCACACGCCACA
SmilChr04G003494 Chr04 NC_080390.1:51373225-51373236promoter 内 168-179 bp + 3822 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 51365035-51369403(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTGC
SmilChr01G001797 Chr01 NC_080387.1:32834590-32834601promoter 内 84-95 bp + 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 32828472-32830684(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTGC
SmilChr03G002826 Chr03 NC_080389.1:44753029-44753040promoter 内 72-83 bp + 3918 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 44748438-44749111(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGTCG
SmilChr07G001374 Chr07 NC_080393.1:10675280-10675291promoter 内 3322-3333 bp - 668 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 10671533-10674612(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CAGCACGCCAGC
SmilChr07G003480 Chr07 NC_080393.1:39085124-39085135promoter 内 2542-2553 bp - 1448 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 39081857-39083676(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GAGCACGCCAGC
SmilChr05G000124 Chr05 NC_080391.1:1001150-1001161promoter 内 2200-2211 bp + 1790 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 994000-999360(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCTGGCGTGCTC
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SmilChr03G003060 Chr03 NC_080389.1:47537245-47537256promoter 内 1648-1659 bp + 2342 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 47539598-47543187(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCGCACGCCAGG
SmilChr03G002990 Chr03 NC_080389.1:46717883-46717894promoter 内 1088-1099 bp + 2902 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 46720796-46721795(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CAGCACGCCAGG
SmilChr08G002493 Chr08 NC_080394.1:23901589-23901600promoter 内 587-598 bp - 3403 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 23892060-23898186(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TCGCACGCCAGG
SmilChr02G002023 Chr02 NC_080388.1:36462420-36462431promoter 内 455-466 bp - 3535 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 36456009-36458885(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GAGCACGCCAGG
SmilChr03G002426 Chr03 NC_080389.1:38557685-38557696promoter 内 3742-3753 bp - 248 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 38557944-38559092(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CCTGGCGTGCTG